All-atom conformational sampling of protein-protein interaction

蛋白质-蛋白质相互作用的全原子构象采样

• 批准号: 25840060
• 负责人: MORITSUGU Kei
• 金额: $ 2.33万
• 依托单位: Yokohama City University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2013
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2013-04-01 至 2015-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-25840060/
• 关键词: タンパク質相互作用; 分子動力学シミュレーション; 全原子空間探索; MSES法; barnase-barstar複合体; EIN-HPr複合体; 常磁性緩和促進; barnase-barster複合体

项目成果

新規全原子構造探索法（MSES）とその天然変性蛋白質への適用

新型全原子结构搜索方法（MSES）及其在自然变性蛋白质中的应用

• 发表时间: 2013
• 作者: 森次 圭;寺田 透;木寺 詔紀
• 通讯作者: 木寺 詔紀

マルチスケール手法によるタンパク質全原子構造サンプリング

使用多尺度方法对蛋白质进行全原子结构采样

• 发表时间: 2014
• 期刊: 分子シミュレーション研究会会誌“アンサンブル”
• 作者: K. Moritsugu;T. Terada;and A. Kidera;猪股 晃介;森次圭
• 通讯作者: 森次圭

Multiscale enhanced sampling driven by multiple coarse-grained models

• DOI: 10.1016/j.cplett.2014.10.009
• 发表时间: 2014-11-25
• 期刊: CHEMICAL PHYSICS LETTERS
• 影响因子: 2.8
• 作者: Moritsugu, Kei;Terada, Tohru;Kidera, Akinori
• 通讯作者: Kidera, Akinori

Multiscale enhanced path sampling based on the Onsager-Machlup action: Application to a model polymer

• DOI: 10.1063/1.4817209
• 发表时间: 2013-08-07
• 期刊: JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS
• 影响因子: 4.4
• 作者: Fujisaki, Hiroshi;Shiga, Motoyuki;Kidera, Akinori
• 通讯作者: Kidera, Akinori

Ligand binding process at atomistic resolution revealed by multiscale enhanced sampling

多尺度增强采样揭示原子分辨率下的配体结合过程

• 发表时间: 2014
• 作者: Kei Moritsugu;Tohru Terada;Akinori Kidera
• 通讯作者: Akinori Kidera