Interaction between membrane protein and lipids in the raft

筏中膜蛋白和脂质之间的相互作用

• 批准号: 24700299
• 负责人: NAOYUKI Miyashita
• 金额: $ 2.83万
• 依托单位: Institute of Physical and Chemical Research
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2012
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2012-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-24700299/
• 关键词: ラフト; アミロイド前駆体タンパク質; 膜タンパク質; 粗視化モデル; レプリカ交換分子動力学法; MDシミュレーション; 脂質分子; コレステロール; アルツハイマー病; APP; シミュレーション; 混合膜; replica-exchange

Bio-membrane consists of membrane proteins and a various variety of lipids. Nano-domains that are called "Raft" are created in such heterogeneous system. The raft contains a lot of cholesterols and Sphingo-lipids. The functions of Amyloid Precursor Proteins (APP), are related to the Alzheimer disease, are affected by the raft. We have investigated the interaction between lipid and APP, and the interaction of membrane proteins in the raft. Our results suggested that the cholesterols are collected around the APP, especially Gly-xxx-Gly motif, and the cholesterols assist the association of APP.

生物膜由膜蛋白和多种脂质组成。在这种异构系统中创建了被称为“Raft”的纳米域。该筏含有大量胆固醇和鞘脂。与阿尔茨海默病相关的淀粉样前体蛋白（APP）的功能受到筏的影响。我们研究了脂质和APP之间的相互作用，以及筏中膜蛋白的相互作用。我们的结果表明，胆固醇聚集在 APP 周围，特别是 Gly-xxx-Gly 基序，并且胆固醇有助于 APP 的结合。

项目成果

The Simulation Study of the Interaction between Transmembrane Region of Amyloid Precursor Proteinj and Cholesterols

淀粉样前体蛋白跨膜区与胆固醇相互作用的模拟研究

• 发表时间: 2013
• 作者: 宮下尚之;小串典子;杉田有治
• 通讯作者: 杉田有治

Replica-exchange Interface Program

副本交换接口程序

• 发表时间: 2012
• 作者: Kazuki Nakada;Keiji Miura;宮下尚之,李秀栄,杉田有治;宮下尚之,李秀栄,杉田有治
• 通讯作者: 宮下尚之,李秀栄,杉田有治

②成果の一つであるGRO2CHMのダウンロードサイト

② 成果之一 GRO2CHM 下载网站

Replica-exchange interface program: REIN

副本交换接口程序：REIN

• 发表时间: 2013
• 作者: Naoyuki Miyashita;Suyong Re;Yuji Sugita
• 通讯作者: Yuji Sugita

レプリカ交換分子動力学インターフェースプログラム

复制品交换分子动力学接口程序

• 发表时间: 2013
• 作者: Keiji Miura;Kazuki Nakada;宮下尚之,李秀栄,杉田有治
• 通讯作者: 宮下尚之,李秀栄,杉田有治