野生哺乳類の季節性毛色変化と生物時計の適応進化に関する分子集団遺伝学的研究

野生哺乳动物毛色季节变化及生物钟适应性进化的分子群体遗传学研究

基本信息

批准号：
12J05241
负责人：
木下豪太
金额：
$ 1.73万
依托单位：
Hokkaido University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2012
资助国家：
日本
起止时间：
2012-04-01 至 2015-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

核DNAの8遺伝子座（Mgf、Tg、Tshb、Sptbn1、Mc1r、Asip、Phka2、Sry）を用いた解析を行った。その結果、北東アジア産ノウサギ属は第四紀前期に分岐した3つの系統群に明瞭に分けられ、L. brachyurusの高い遺伝的固有性とL. timidusの単系統性が示されたが、L. mandshuricus・L. coreanus・L. melainusは一つの系統群として括られ、これら3種については同一種（L. mandshuricus complex）としての扱いが強く支持された。また、北東アジアの大陸種（冬季白化・非白化種を含む）において複数種間のintrogressionを伴った網状進化が起きていることが示唆された。さらに、mtDNAのCytb遺伝子座についても解析を行い、核DNAの解析結果との比較からintrogressionの影を明らかにし、それがもたらされた要因についてより詳細な考察を行った。特に冷帯と温帯の境界付近に分布するL. mandshuricus complexでは、北方種のL. timidus と南方に生息する温帯種のL. sinensisの双方から第四紀後期以降にintrogressionが繰り返し起こり、それによって種独自のmtDNA系統は完全に失われてしまう“mitochondria capture”が起きていることが示唆された。これらの結果は、北東アジアにおけるノウサギ属の網状進化は、第四紀の気候変動に伴って北方種と温帯種の分布の変遷が大陸で繰り返されたことで種間交雑が促進されたためであると推察された。またmtDNAの解析では、日本列島内にニホンノウサギとユキウサギの各種内で地理的分布の大きく異なる２つの亜系統への分化が示唆された。これは、第四紀中期以降の大陸からの隔離状態と、氷期における列島内の複数ﾌｭｰｼﾞｱの存在を示唆していると考えられる。これらの結果から、大陸各地で頻発しているノウサギ属のintrogressionと、北東アジアに生息する生物の集団史を理解する上で、環日本海地域は歴史的かつ地理的側面から非常に重要なフィールドであることが示された。

我们使用 8 个核 DNA 位点（Mgf、Tg、Tshb、Sptbn1、Mc1r、Asip、Phka2 和 Sry）进行了分析。结果，来自东北亚的榛属被清楚地划分为三个系统发育类群，这些类群在第四纪早期出现分歧，显示出 L. brachyurus 的高度遗传特有性和 L. timidus 的单系性，但 L. mandshuricus、L. coreanus 和 L. mandshuricus 和 L. coreanus 表现出高度遗传特有性。 melainus 被归为一个系统发育类群，强烈支持将这三个物种视为同一物种（L. mandshuricus 复合体）。此外，有人认为，东北亚大陆物种（包括冬季白化和非白化物种）发生了伴随着多个物种间渗入的网状进化。此外，我们还分析了mtDNA中的Cytb基因位点，通过与核DNA分析结果进行比较，澄清了基因渗入的影子，并对导致基因渗入的因素进行了更详细的讨论。特别是，在分布于寒温带边界附近的L. mandshuricus复合体中，从第四纪晚期开始，北方物种L. timidus和南温带物种L. sinensis反复发生渗入。发生“线粒体捕获”，其中一个物种独特的线粒体DNA谱系完全丢失。这些结果表明，东北亚兔属的网状进化是由于第四纪气候变化导致该大陆上寒带和温带物种分布的反复变化，从而促进了种间杂交。此外，线粒体DNA分析表明，在日本列岛内，日本兔和雪兔已分化为地理分布截然不同的两个亚系。这被认为表明自第四纪中期以来就处于与大陆隔绝的状态，并且在冰河时期群岛内存在着多个福斯人。这些结果表明，从历史和地理的角度来看，日本海地区对于了解在大陆各地频繁发生的兔属的基因渗入以及栖息在东北亚的生物的种群历史而言是极其重要的领域。结果表明

项目成果

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Phylogeography of the genus Lepus in eastern Asia inffered multidirectional introgressions during the Pleistocene

东亚天兔属的系统发育地理学推断更新世期间多向渗入

DOI：
发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
0
作者：
Gohta Kinoshita;Mitsuo Nunome;Alexey Kryukov;San-Hoon Han;Hitoshi Suzuki
通讯作者：
Hitoshi Suzuki

北東ｱｼﾞｱ産ﾉｳｻｷﾞ属（Lepus）の網状進化と毛色関連遺伝子の自然選択

东北亚天兔属毛色相关基因的网状进化和自然选择

DOI：
发表时间：
2014
期刊：
影响因子：
0
作者：
木下豪太;布目三夫;Alexey P Kryukov;Irina V Kartavtseva;San-Hoon Han;山田文雄;鈴木仁
通讯作者：
鈴木仁

北東ｱｼﾞｱ産ﾉｳｻｷﾞ属における第四紀の気候変動に伴う種分化機構

东北亚豪萨吉属第四纪气候变化的物种形成机制

DOI：
发表时间：
2014
期刊：
影响因子：
0
作者：
木下豪太;布目三夫;Alexey P Kryukov;Irina V Kartavtseva;San-Hoon Han;山田文雄;鈴木仁
通讯作者：
鈴木仁

Colonization history of the sable Martes zibellina (Mammalia, Carnivora) on the marginal peninsula and islands of northeastern Eurasia

DOI：
10.1093/jmammal/gyu021
发表时间：
2015-02
期刊：
影响因子：
0
作者：
G. Kinoshita;J. Sato;I. G. Meschersky;S. L. Pishchulina;L. Simakin;V. Rozhnov;B. Malyarchuk;M. Derenko;G. Denisova;L. V. Frisman;A. Kryukov;T. Hosoda;Hitoshi Suzuki
通讯作者：
G. Kinoshita;J. Sato;I. G. Meschersky;S. L. Pishchulina;L. Simakin;V. Rozhnov;B. Malyarchuk;M. Derenko;G. Denisova;L. V. Frisman;A. Kryukov;T. Hosoda;Hitoshi Suzuki

Evolutionary history of the sable (Martes zibellina brachyura) on Hokkaido inferred from mitochondrial Cytb and nuclear Mclr and Tcf25 gene sequences

从线粒体 Cytb 和核 Mclr 和 Tcf25 基因序列推断北海道紫貂 (Martes zibellina brachyura) 的进化史