Elucidation of the selective lignin degradation mechanism in a white rot fungus and the biosynthetic pathway of its key metabolites through a proteomic approach

通过蛋白质组学方法阐明白腐真菌中的选择性木质素降解机制及其关键代谢物的生物合成途径

• 批准号: 23780183
• 负责人: WATANABE Takahito
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23780183/
• 关键词: リグニン; 白色腐朽菌; 脂質関連代謝物; プロテオーム

A white-rot fungus, Ceriporiospsis subvermispora, can selectively degrade lignin without serious damage to cellulose. In order to elucidate the molecular mechanism of the selective lignin degradation, we tried to investigate the cellular response of C. subvermispora to a lignin fragment, vanillin. We obtained expression profiles of C. subvermispora in the presence and absence of vanillin through a proteomics-based approach, and detected vanillin-induced and repressed proteins. Using suppression subtractive hybridization, moreover, we also obtained many genes clones that are up-regulated in the presence of vanillin.

白腐真菌 Ceriporiospsis subvermispora 可以选择性降解木质素，而不会对纤维素造成严重损害。为了阐明选择性木质素降解的分子机制，我们尝试研究 C. subvermispora 对木质素片段香草醛的细胞反应。我们通过基于蛋白质组学的方法获得了 C. subvermispora 在存在和不存在香草醛的情况下的表达谱，并检测了香草醛诱导和抑制的蛋白质。此外，通过抑制消减杂交，我们还获得了许多在香草醛存在下上调的基因克隆。

项目成果

Vanillin-induced cellular response in the white rot fungus, Ceriporiopsis subvermispora

香兰素诱导白腐真菌 Ceriporiopsis subvermispora 的细胞反应

• 发表时间: 2013
• 期刊: Sustainable Humanosphere
• 作者: Watanabe;T.;Nishimura;H;Watanabe;T
• 通讯作者: T

選択的白色腐朽菌 Ceriporiopsis subvermispora のバニリンに対する細胞応答

选择性白腐真菌 Ceriporiopsis subvermispora 对香草醛的细胞反应。

• 作者: 山口晴生;井上実;谷本祐子;外丸裕司;森賢一郎;山口晴生;渡邊崇人，森賢一郎，木戸彩子，長谷川隆大，西村裕志，本田与一，渡辺隆司
• 通讯作者: 渡邊崇人，森賢一郎，木戸彩子，長谷川隆大，西村裕志，本田与一，渡辺隆司

選択的リグニン分解菌のバニリンに対する細胞応答

选择性木质素降解细菌对香草醛的细胞反应

• 发表时间: 2013
• 作者: Elena Fernandez-Fueyo;Chiaki Hori;et.al.;渡邊崇人,森賢一郎,木戸彩子,長谷川隆大,西村裕志,本田与一,渡辺隆司;渡邊崇人,森賢一郎,木戸彩子,長谷川隆大,和泉千尋,津田冴子,西村裕志,渡辺隆司
• 通讯作者: 渡邊崇人,森賢一郎,木戸彩子,長谷川隆大,和泉千尋,津田冴子,西村裕志,渡辺隆司

Cellular response of a selective lignin-degrading fungus to vanillin. Lignobiotech II Symposium

选择性木质素降解真菌对香草醛的细胞反应。

• 发表时间: 2012
• 作者: Watanabe;T.;Mori;K.;Kido;A.;Izumi;C.;Hasegawa;T.;Tsuda;S.;Nishimura;H.;Honda;Y.;Watanabe;T
• 通讯作者: T

選択的白色腐朽菌Ceriporiopsis subvermisporaのリグニン分解フラグメントに対する転写応答及び代謝物解析

选择性白腐真菌 Ceriporiopsis subvermispora 对木质素降解片段的转录反应和代谢物分析

• 发表时间: 2012
• 作者: Elena Fernandez-Fueyo;Chiaki Hori;et.al.;渡邊崇人,森賢一郎,木戸彩子,長谷川隆大,西村裕志,本田与一,渡辺隆司;渡邊崇人,森賢一郎,木戸彩子,長谷川隆大,和泉千尋,津田冴子,西村裕志,渡辺隆司;渡邊崇人;森賢一郎,高田理江,渡邊崇人,本田与一,渡辺隆司
• 通讯作者: 森賢一郎,高田理江,渡邊崇人,本田与一,渡辺隆司