Reconstruction of phylogenetic and biogeographic scenarios of ranoid frogs based on SINE and other molecular markers

基于SINE和其他分子标记重建类青蛙的系统发育和生物地理场景

基本信息

批准号：
23770088
负责人：
KURABAYASHI Atsushi
金额：
$ 3.08万
依托单位：
Hiroshima University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2011
资助国家：
日本
起止时间：
2011 至 2013
项目状态：
已结题

项目摘要

Superfamily Ranoides is a large anuran taxon nested in suborder Neobatrachia. It has been considered that lineage splits and distribution expansions of many ranoid groups were occurred in association with the segmentation and collisions of the Gondowanan landmasses. In this taxon, many phylogenetic and biogeographic issues remain unresolved by common molecular phylogenetic analyses based on DNA and/or protein sequence data. To resolve these problems, I aimed to perform phylogenetic analyses based on SINE - a nuclear transposable elements.- information. Although any SINEs had not been found in neobatrachians, we discovered SINE2-1XT homologues from many frog genomes including neobatrachian species. Also the same SINE elements were found from the urodelan and caecilian genomes, indicating that this SINE element had originated in a common ancestor of all living amphibians. These results enable applications of SINE phylogeny in not only ranoids but also many amphibian taxa.

超家族ranoides是嵌套在近artrachia中的大型阿努族分类群。人们认为，与贡多瓦南陆地的分割和碰撞有关，发生了许多ranoid群体的谱系分裂和分布扩展。在该分类单元中，基于DNA和/或蛋白质序列数据的常见分子系统发育分析，许多系统发育和生物地理问题仍未解决。为了解决这些问题，我旨在基于正弦 - 核转座元素进行系统发育分析。尽管在Neobatrachians中没有发现任何罪过，但我们发现了包括Neobatrachian物种在内的许多青蛙基因组中的正弦2-1xt同源物。还从乌德兰和凯西尔基因组中发现了相同的正弦元素，表明这种正弦元素起源于所有活着的两栖动物的共同祖先。这些结果使得正弦系统发育不仅在ranoid中，而且可以在许多两栖类群中应用。

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

広島大学両生類研究施設HP

广岛大学两栖动物研究设施 HP

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

両生類研究施設進化多様性・生命サイクル研究グループHP

两栖动物研究设施进化多样性/生命周期研究组 HP

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

オセアニアヒメアマガエル亜科はどこからきたのか? : 亜科所属不明属Gastrophrynoidesの系統的位置に基づく推定

大洋洲海龟亚科来自哪里？：基于胃海龟属的系统发育位置进行估计，该属的亚科未知

DOI：
发表时间：
2011
期刊：
影响因子：
0
作者：
Atsushi Kurabayashi;Masafumi Matsui;Daicus M Belabut;Hoi-Sen Yong;Norhayati Ahmad;Ahmad Sudin;Mitsuru Kuramoto;Amir Hamidy;and Masayuki Sumida;坪田博美・井上侑哉・中原-坪田美保・島本俊樹・松田伊代・内田慎治・向井誠二;宮澤清太;日本進化学会;広瀬大・大園享司;西田伸;倉林敦・松井正文・Amir Hamidy・Daicus M.Belabat・倉本満・住田正幸
通讯作者：
倉林敦・松井正文・Amir Hamidy・Daicus M.Belabat・倉本満・住田正幸

オセアニアヒメアマガエル亜科はどこからきたのか？：亜科所属不明属Gastrophrynoidesの系統的位置に基づく推定

大洋洲雨蛙亚科来自哪里？