Escherichia coli host engineering for non-biased expression of metagenomic library

用于宏基因组文库无偏表达的大肠杆菌宿主工程

• 批准号: 23380197
• 负责人: MIYAZAKI Kentaro
• 金额: $ 12.73万
• 依托单位: National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23380197/
• 关键词: メタゲノム; バイオテクノロジー; 大腸菌; ゲノム育種; リボソーム工学; 16S rRNA; 翻訳; リボソーム; 宿主; 機能改変; 遺伝子発現; 異宿主発現; レポーターアッセイ; 翻訳開始因子; 発現バイアス; 進化工学; 開始コドン

We have applied translational engineering approach to solve the problem in heterologous expression problem in Escherichia coli. Initiation factor 3 as well as the ribosome was engineered to alter the translational profile and variants that showed enhanced expression of genes having non-AUG initiation codon were identified. Also, mutant ribosome that have 16S rRNA from non-E. coli bacteria showed altered, or enhanced expression of reporter gfp genes, that were not efficiently expressed in wild type E. coli.

我们应用转化工程方法来解决大肠杆菌中的异源表达问题。起始因子 3 以及核糖体经过工程改造以改变翻译谱，并鉴定出显示具有非 AUG 起始密码子的基因表达增强的变体。此外，具有来自非大肠杆菌的 16S rRNA 的突变核糖体。大肠杆菌显示报告基因 gfp 基因的表达发生改变或增强，而这些基因在野生型大肠杆菌中无法有效表达。

项目成果

Characterization of a Novel β-Glucosidase from a Compost Microbial Metagenome with Strong Transglycosylation Activity

• DOI: 10.1074/jbc.m113.471342
• 发表时间: 2013-06-21
• 期刊: JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
• 影响因子: 4.8
• 作者: Uchiyama, Taku;Miyazaki, Kentaro;Yaoi, Katsuro
• 通讯作者: Yaoi, Katsuro

翻訳特性の改変された大腸菌

具有修饰翻译特性的大肠杆菌

• 发表时间: 2013

メタゲノム由来新奇βーグルコシダーゼの性状解析

宏基因组学衍生的新型 β-葡萄糖苷酶的表征

• 作者: 佃 美雪;宮崎 健太郎;宮崎 健太郎;佃美雪,宮崎健太郎;宮崎健太郎;北原圭,宮崎健太郎;宮崎健太郎;宮崎健太郎;宮崎健太郎;北原圭;城俊徳;佃美雪;佃美雪;佐藤允治;内山拓
• 通讯作者: 内山拓

リボソームに翻訳以外の機能を発見

发现核糖体中翻译以外的功能

• 发表时间: 2012
• 期刊: 産総研TODAY
• 作者: Kitahara K;Yasutake Y;Miyazaki K;宮崎健太郎
• 通讯作者: 宮崎健太郎

進化工学手法による異種蛋白質発現における翻訳律速因子の同定と発現効率化

利用进化工程技术鉴定翻译速率限制因素并提高异源蛋白表达的表达效率

• 发表时间: 2011
• 作者: 佃 美雪;宮崎 健太郎
• 通讯作者: 宮崎 健太郎