Structure and function of complex of substrate-binding protein and macromolecule-specific ABC transpoter

底物结合蛋白与大分子特异性ABC转座子复合物的结构与功能

• 批准号: 23380049
• 负责人: MURATA Kousaku
• 金额: $ 11.65万
• 依托单位: Setsunan University (2013)Kyoto University (2011-2012)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23380049/
• 关键词: ABCトランスポーター; 酸性多糖輸送; Sphingomonas属細菌; Ｘ線結晶構造; 輸送体分子進化; X線結晶構造; 基質結合タンパク質; アルギン酸; スフィンゴモナス属細菌; X線結晶構造解析; プロテオリポソーム再構成系; ヘテロ多糖; 高分子輸送; アルギン酸結合タンパク質; ABCタンパク質

The structure and function relationship of macromolecule(alginate)-specific ABC transporter (importer:AlgM1-AlgM2/AlgS-AlgS) of Sphingomonas sp, A1 was analyzed.The substrate-binding proteins (AlgQ) bind/reliese alginate by opening/closing the N-domein and C-domein. The subsite 1 in the AlgQ specifically binds mannuronate. Through the contact with alginate-bound AlgQ, the permeases (AlgM1 and AlgM2) constituting importer open, receive alginate from AlgQ, and then alginate is introduced into cytosol by using ATP-hydrolyzing energy, which is generated by the action of AlgS (ATPase). This ATP transporter was different from the ABC transporters responsible for the transport of low-molecular weight substrates in that the substrate-binding protein (AlgQ) forms the tunnel that allows the passage of alginate, a long chain acid polysaccharide.

分析了SPHOMONAS SP的大分子（Alginate）特异性ABC转运蛋白（进口蛋白：ALGM1-ALGM2/ALGS-ALGS）A1的结构和功能关系。底物结合蛋白（ALGQ）依赖/依赖于n-DomiN和C-DomiNIn nIniNIn。 ALGQ中的亚铁矿1特异性结合了甘露酸酯。通过与藻酸盐结合的ALGQ接触，构成进口商的磁盘（ALGM1和ALGM2）开放，从Algq接收藻酸盐，然后通过使用ATP-氢化溶液将藻酸盐引入细胞质，这是由ALGS的作用产生的（ATPase）。该ATP转运蛋白与负责低分子重量底物转运的ABC转运蛋白不同，因为底物结合蛋白（ALGQ）形成了允许藻酸盐（一种长链酸多糖）的隧道。

项目成果

海洋バイオマスからのエタノール生産

利用海洋生物质生产乙醇

• 发表时间: 2009

体腔依存多糖取り込み ABC トランスポーターの構造機能相関とその応用

体腔依赖性多糖摄取ABC转运蛋白的结构-功能关系及其应用

• 发表时间: 2013
• 作者: 橋本 渉;丸山如江;三上文三;村田幸作 (京大院 ・ 農)
• 通讯作者: 村田幸作 (京大院 ・ 農)

Production of ethanol from mannitol by the yeast strain Saccharomyces paradoxus NBRC 0259

• DOI: 10.1016/j.jbiosc.2013.03.018
• 发表时间: 2013-09-01
• 期刊: JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING
• 影响因子: 2.8
• 作者: Ota, Anri;Kawai, Shigeyuki;Murata, Kousaku
• 通讯作者: Murata, Kousaku

Crystallization and preliminary X-ray analysis of alginate importer from Sphingomonas sp. A1

鞘氨醇单胞菌藻酸盐输入物的结晶和初步 X 射线分析。

• 发表时间: 2012
• 期刊: Acta Cryst
• 作者: Y.Maruyama;T.Itoh;Y.Nishitani;B. Mikami;W.Hashimoto & K.Murata
• 通讯作者: W.Hashimoto & K.Murata

多糖アルギン酸の取り込みに関わる細菌由来ABCトランスポーターのX線結晶構造解析

参与海藻酸多糖摄取的细菌ABC转运蛋白的X射线晶体结构分析

• 发表时间: 2012
• 作者: 林 智恵;丸山如江;橋本渉;村田幸作;丸山如江;丸山如江;丸山如江
• 通讯作者: 丸山如江