Identification of novel tyrosine kinase fusion genes using a unique system based on morphology

使用基于形态学的独特系统鉴定新型酪氨酸激酶融合基因

• 批准号: 22680063
• 负责人: TAKEUCHI Kengo
• 金额: $ 16.06万
• 依托单位: Japanese Foundation For Cancer Research
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22680063/
• 关键词: がん; チロシンキナーゼ; 融合遺伝子; IRF4; ALK; ROS1; RET; SQSTM1-ALK; PPFIBP1-ALK

We identified PPFIBP1-ALK in inflammatory myofibroblastic tumor and TPM3-ALK and EML4-ALK in renal cell carcinoma. In lymphoma, we found SQSTM1-ALK. KLC1-ALK was identified from a formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissue by RACE optimized for FFPE. We established a unique system for identification of fusion genes based on histopathological methods, and identified 4 ROS1 and 2 RET novel fusion genes. We also proposed a new entity of low-grade B-cell lymphoma, which was characterized by IRF4 rearrangement

我们在炎性肌纤维母细胞肿瘤中鉴定出 PPFIBP1-ALK，在肾细胞癌中鉴定出 TPM3-ALK 和 EML4-ALK。在淋巴瘤中，我们发现了 SQSTM1-ALK。通过针对 FFPE 优化的 RACE，从福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 组织中鉴定出 KLC1-ALK。我们基于组织病理学方法建立了独特的融合基因鉴定系统，并鉴定了4个ROS1和2个RET新型融合基因。我们还提出了一种新的低度B细胞淋巴瘤实体，其特征是IRF4重排

项目成果

Allelotypes of lung adenocarcinomas featuring ALK fusion demonstrate fewer onco- and suppressor gene changes.

• DOI: 10.1186/1471-2407-13-8
• 发表时间: 2013-01-05
• 期刊: BMC cancer
• 影响因子: 3.8
• 作者: Ninomiya H;Kato M;Sanada M;Takeuchi K;Inamura K;Motoi N;Nagano H;Nomura K;Sakao Y;Okumura S;Mano H;Ogawa S;Ishikawa Y
• 通讯作者: Ishikawa Y

核酸配列の切断標識方法

核酸序列的切割标记方法

• 发表时间: 2012

ALK fusions

ALK 融合

• 发表时间: 2012
• 作者: 板井 啓明;兵部 唯香;熊谷 道夫;田辺 信介;竹内賢吾
• 通讯作者: 竹内賢吾

融合遺伝子の発見

融合基因的发现

• 发表时间: 2012
• 作者: Yoshimi Kamiya;Shinnji Nishimura;Lu Long;Tetsuo Miyakoshi;竹内賢吾
• 通讯作者: 竹内賢吾

Lymphomatoid Gastropathy

淋巴瘤样胃病

• 发表时间: 2011
• 作者: Yoshimi Kamiya;Tetsuo Miyakoshi;K. Ueda;A.S. Riyadi;竹内賢吾;K.A. Asante;竹内賢吾;神谷嘉美;竹内賢吾;K. Ueda;竹内賢吾;神谷嘉美;板井啓明;K. Ueda;竹内賢吾;A.S. Riyadi;神谷嘉美;K. Ueda;竹内賢吾
• 通讯作者: 竹内賢吾