Artificial translation system using dual sense codon and divided codon boxes

使用双义密码子和分开的密码子盒的人工翻译系统

• 批准号: 22750145
• 负责人: GOTO Yuki
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22750145/
• 关键词: 遺伝暗号のリプログラミング; 翻訳合成; ペプチド; ペプチドライブラリー; リボザイム; 非天然アミノ酸

We have designed two novel strategies in genetic code reprogramming,"dual genetic code" and "artificial division of codon boxes", enabling us to create extremely engineered translation system. Dual genetic code is translation-decoding system governed by two distinct reprogrammed genetic codes. One is the genetic code used for elongation reaction as usual, and the other is one exclusively used in initiation step. That is, a single codon has" dual sense "designating two distinct amino acids in initiation and elongation steps. In the approach of artificial division of codon boxes, a codon box occupied by one amino acid in natural is virtually split and two distinct amino acids are reassigned into each part of the divided codon box. This enables us to designate a codon box for an original proteinogenic and another desirable non-proteinogenic amino acids. We have experimentally demonstrated these two methodologies. Moreover, integration of these two novel strategies was also carried out, allowing us to drastically reprogram the decoding rule of translation system involving a wide array of non-standard and proteinogenic building blocks(totally over 28 spicies)

我们在遗传密码重编程方面设计了两种新颖的策略，“双遗传密码”和“密码子盒的人工划分”，使我们能够创建极其工程化的翻译系统。双遗传密码是由两个不同的重编程遗传密码控制的翻译解码系统。一种是通常用于延伸反应的遗传密码，另一种是专门用于起始步骤的遗传密码。也就是说，单个密码子具有“双重意义”，在起始和延伸步骤中指定两个不同的氨基酸。在人工分割密码子盒的方法中，天然中被一个氨基酸占据的密码子盒实际上被分裂，并且两个不同的氨基酸被重新分配到分割的密码子盒的每个部分中。这使我们能够为原始蛋白氨基酸和另一种所需的非蛋白氨基酸指定密码子盒。我们已经通过实验证明了这两种方法。此外，还进行了这两种新颖策略的整合，使我们能够彻底重新编程翻译系统的解码规则，涉及广泛的非标准和蛋白质构建块（总共超过28种香料）

项目成果

New strategies for genetic code reprogramming ; dual genetic code and artificial division of codon boxes

遗传密码重编程的新策略；

• 发表时间: 2011
• 期刊: Peptide Science
• 影响因子: 2.4
• 作者: Yuki Goto;et al.
• 通讯作者: et al.

ヘテロ環化修飾酵素を用いた化合物ライブラリー構築

使用杂环化修饰酶构建化合物库

• 发表时间: 2011
• 作者: 浅見祐也;元田彩香;塚本眞幸;早川芳宏;三枝洋之;東山尚史・関口康司・樫田啓・浅沼浩之;後藤佑樹
• 通讯作者: 後藤佑樹

A posttranslational heterocyclase : a versatile synthetic tool for various azoline-containing compounds

翻译后杂环酶：多种含唑啉化合物的多功能合成工具

• 发表时间: 2011
• 作者: 後藤佑樹・伊藤悠美・菅裕明

無細胞翻訳系と翻訳後修飾酵素を利用した特殊骨格含有ペプチドライブラリーの迅速構築

使用无细胞翻译系统和翻译后修饰酶快速构建含有特殊骨架的肽库

• 发表时间: 2011
• 作者: Sugiyama;Y.; Shinohara;Y.; Momotake;A.; Takahashi;K.; Kanna;Y.; Nishimura,Y.; Arai;T.;後藤佑樹
• 通讯作者: 後藤佑樹

PatD : a versatile synthetic tool for various azoline-containing compounds

PatD：一种用于各种含唑啉化合物的多功能合成工具

• 发表时间: 2011
• 作者: Senda;N.; Momotake;A.; Arai;T;後藤佑樹・伊藤悠美・菅裕明
• 通讯作者: 後藤佑樹・伊藤悠美・菅裕明