ヒト遺伝的多型の生体機能解析実験系の構築―メダカをモデルとした新たなアプローチ

人类基因多态性生物功能分析实验体系的构建——以青鳉为模型的新方法

• 批准号: 10J06207
• 负责人: 勝村 啓史
• 金额: $ 0.9万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-10J06207/
• 关键词: ヒト遺伝的多型; SNP; メダカ; 集団遺伝学; cytochrome P450; 野生集団; mtDNA; D-loop

【背景】近年ヒト集団において膨大な量のゲノムワイドな遺伝的多型データが蓄積されているが、それらの対立遺伝子(アレル)がどのような表現型に影響するかの機能解析を行う有効な実験系がない。【目的】メダカ集団をヒト集団のアナロジーとして捉え、ヒトでアレル間での機能差が知られているcytochrome P450(CYP)遺伝子に着目し、メダカを用いたヒト多型のアレル間の機能差を推定する実験系を構築する。【平成23年度の成果】1、平成22年度にサンプリングした南日本グループの野生メダカDNAサンプル(青森94個体、岩手149個体、茨城173個体、千葉124個体、岡山95個体、広島96個体、佐賀96個体、沖縄149個体の計976個体)を用いて、ミトコンドリアDNA・D-loop領域の塩基配列解析を行い、南日本グループの遺伝的多様性が北部九州(佐賀)を起源とする可能性を示した(Katsmura et al. 2012)。2、メダカ地域集団に見られたCYPアレルの酵素活性を、GAL4-UASシステムを用いた培養細胞発現系により測定した。ヒトCYPアレル間で酵素活性差が見られる基質を用いたところ、メダカのCYPアレル間でも有意な酵素活性差が観察された。3、有意な酵素活性差を示したアレルを持つ地域集団の生体を用いて、CYPが代謝する基質を使い薬剤暴露実験を行った。その結果、上記の2によって示された酵素活性が異なるアレルを持つ地域集団間で、薬剤暴露後の行動に違いが見られる可能性が示唆された。

[背景]近年来，人类群体积累了大量遗传多重类型数据，但是分析哪种表达类型会影响这些对手（ALLEL）。 [目的] Medaka群被认为是人类群体的类比，重点是细胞色素P450（CYP）基因，该基因以其等位基因之间的功能差异而闻名，并着重于使用MEDAKA的人类多形型等位基因之间的功能差异。建立一个估计的实验系统。 [2011年的结果] 1，南部日本集团的野生Medaka DNA样本（94 iwate，173 Ibaraki，124个人，95个冈马，96个Hiroshima，Saga 96个人，Saga 96个个人。使用976个个人，总计976个人Oukinawa是线粒体DNA / D环区的基本序列分析，以及南日本组的遗传多样性可能起源于北北北部（Katsmura etal。2012）。 2。使用GAL4-UAS系统通过培养细胞表达系统测量Medaka区域中CYP ALLEL的酶活性。当人CYP Allel之间具有酶活性差异的底物时，Medaka CYP Allel之间也观察到显着的酶活性差异。 3。使用具有明显酶活性差异的区域组的活体，使用CYP代谢的底物进行了药物暴露实验。结果，有人提出，在上面2中显示的具有不同酶活性的区域组之间，有可能看到药物暴露后的行为。

项目成果

ヒトCYP多型とメダカ地域集団を用いた生体機能解析

利用人类 CYP 多态性和青鳉区域种群的生物学功能分析

• 发表时间: 2010
• 作者: 勝村啓史;尾田正二;三谷啓志;河村正二;太田博樹
• 通讯作者: 太田博樹

A population genetic study on the relationship between medaka fish and the spread of wet-rice cultivation across the Japanese archipelago

青鳉鱼与日本列岛湿稻种植传播关系的群体遗传学研究

• DOI: 10.1537/ase.110525
• 发表时间: 2012
• 期刊: Anthropological Science
• 影响因子: 0.7
• 作者: Katsumura;T.;Oda;S.;Tsukamoto;K.;Sekiya;Y.;Yamashita;T.;Aso;M.;Hata;M.;Nonaka;M.;Mano;S.;Ishida;H.;Mitani;H.;Kawamura;S.;Oota;H.
• 通讯作者: H.

Allelic Variations of Cytochrome P450 1B1 in Wild Medaka Populations : Curious Similarities to Humans' Polymorphisms and Their Functions

野生青鳉种群中细胞色素 P450 1B1 的等位基因变异：与人类多态性及其功能的奇妙相似之处

• 发表时间: 2011
• 作者: T. Katsumura;S. Oda;H. Mitani;S. Kawamura;H. Oota
• 通讯作者: H. Oota

メダカ地域集団間のCYP酵素活性の違い

青鳉区域种群之间CYP酶活性的差异

• 发表时间: 2010
• 作者: 勝村啓史;尾田正二;三谷宏志;河村正二;太田博樹
• 通讯作者: 太田博樹

A study of functional differences between alleles in P450 genes for medaka fish.

青鳉鱼 P450 基因等位基因功能差异的研究。

• 发表时间: 2010
• 作者: Katsumura;T.;Oda;S.;Mitani;H.;Kawamura;S.;Oota;H.
• 通讯作者: H.