Chromatin immunoprecipitation-based analysis of transcriptional regulation in Arabidopsis thaliana chloroplasts

基于染色质免疫沉淀的拟南芥叶绿体转录调控分析

• 批准号: 21770034
• 负责人: HANAOKA Mitsumasa
• 金额: $ 2.33万
• 依托单位: Chiba University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21770034/
• 关键词: 葉緑体; 転写制御; ChIP; 環境応答; シロイヌナズナ; 色素体分化; シグマ因子; 転写因子

In this study, to further clarify transcriptional regulation in Arabidopsis thaliana chloroplasts, Chromatin immunoprecipitation (ChIP)-based method has been established. Novel target promoters for SIG1, an essential sigma factor in A.thaliana, as well as those for SIG5, a multiple stress-induced chloroplast sigma factor were identified respectively. These results suggest that ChIP analysis is useful to understand transcriptional regulation of chloroplast genes.

在这项研究中，为了进一步阐明拟南芥叶绿体中的转录调节，已经建立了染色质免疫沉淀（芯片）方法。 Sig1的新型靶启动子是A.thaliana中的必不可少的Sigma因子，以及SIG5的新目标启动子，分别确定了多个应力诱导的叶绿体Sigma因子。这些结果表明，芯片分析对于了解叶绿体基因的转录调节很有用。

项目成果

単細胞紅藻 Cyanidioschzon merolae におけるオルガネラDNA複製の調節機構

单细胞红藻 Cyanidioschzon merolae 中细胞器 DNA 复制的调节

• 发表时间: 2010
• 作者: 華岡光正;加藤麻衣子;東美由紀;田中寛;Kie Itoh;華岡光正;金岡雅浩;岩崎義純
• 通讯作者: 岩崎義純

ChIP法を用いたシロイヌナズナ葉緑体シグマ因子の機能解析

采用 ChIP 方法对拟南芥叶绿体 sigma 因子进行功能分析

• 发表时间: 2010
• 作者: 華岡光正;加藤麻衣子;東美由紀;田中寛
• 通讯作者: 田中寛

シアノバクテリア Synechococcus elongatus PCC 7942の概日リズム応答に関わる制御因子LabAの機能解析

LabA 的功能分析，LabA 是参与蓝藻细长聚球藻 PCC 7942 昼夜节律反应的调节因子

• 发表时间: 2010
• 作者: 金岡雅浩;東山哲也;藤原正幸
• 通讯作者: 藤原正幸

Red Algae in the Genomic Age(共著)

基因组时代的红藻（合著者）

• 发表时间: 2010
• 作者: Mitsumasa Hanaoka;Kan Tanaka;金岡雅浩;Mitsumasa Hanaoka
• 通讯作者: Mitsumasa Hanaoka

The role of two-component system for light-dependent transcriptional regulation in Cyanidioschyzon merolae chloroplasts.

双组分系统在 Cyanidioschyzon merolae 叶绿体中光依赖性转录调控中的作用。

• 发表时间: 2010
• 作者: Mitsumasa Hanaoka;Takayuki Kawakami;Daichi Satoh;Sousuke Imamura;Kan Tanaka
• 通讯作者: Kan Tanaka