ANALYSIS OF DYNAMIC BEHAVIOR OF RNA USING LIGHT-UP RNA MODULE AS A TAG

以发光RNA模块为标签的RNA动态行为分析

• 批准号: 21350091
• 负责人: AOYAMA Yasuhiro
• 金额: $ 11.98万
• 依托单位: Doshisha University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21350091/
• 关键词: 転写; RNA; 蛍光; 蛍光モニタリング; BODIPY; アプタマー; トブラマイシン; 融合遺伝子; カナマシシン; 抗生物質; リボソーム; 抗生物質修飾酵素; 大腸菌; タグ; 融合RNA(DNA); 蛍光色素; アミノ糖; SELEX; カナマイシン; 回転阻害; ヘキスト; 光るRNAモジュール

The fluorescence intensity of tobramycin-bearing phenyl-BODIPY as a probe increases upon interaction with tobramycin-aptamer, an RNA sequence that specifically binds to tobramycin. Transcription of a target gene (tRNA in this case) containing the aptamer sequence downstream thereof affords a fused (target-aptamer) RNA, the aptamer component of which can be detected by enhanced fluorescence, although no big, in the presence of the probe. In this way, the transcription of the target gene can be fluorescence monitored.

带有妥布霉素的苯基-BODIPY 作为探针，在与妥布霉素适体（一种与妥布霉素特异性结合的 RNA 序列）相互作用后，荧光强度会增加。含有其下游适体序列的靶基因（在本例中为tRNA）的转录提供了融合的（靶标-适体）RNA，在探针存在的情况下，可以通过增强的荧光（尽管不大）来检测其适体成分。这样就可以对目标基因的转录进行荧光监测。

项目成果

抗生物質部位を有する蛍光色素と抗生物質耐性菌との相互作用

荧光染料与抗生素部分和抗生素抗性细菌之间的相互作用

• 发表时间: 2012
• 作者: 篠宮拓也;平川翔太;林侑香;竹澤佑太;芳賀正明;山本達望・田中愛・青山安宏
• 通讯作者: 山本達望・田中愛・青山安宏

核酸相互作用部位としてのアミノ糖を置換した蛍光色素の合成と応用

以取代氨基糖为核酸相互作用位点的荧光染料的合成及应用

• 发表时间: 2010
• 作者: 跡見晴幸;佐藤喬章;横大路裕介;今中忠行;M. Ikeda-Saito;中西拓也;水上久美・青山安宏・徳永武士・山東信介
• 通讯作者: 水上久美・青山安宏・徳永武士・山東信介

生体イメージングに向けた新手法

生物成像新方法

• 发表时间: 2009
• 作者: M. Unno;K. Kakiage;M. Yamamura;and M. Hanaya;青山安宏
• 通讯作者: 青山安宏

生体イメージンに向けた新手法

生物成像新方法

• 发表时间: 2009
• 作者: Naoya Murakami;Shota Kawakami and Teruhisa Ohno;青山安宏
• 通讯作者: 青山安宏

Modular Blue RNA Sensors for Label-Free Detection of Target Molecules

用于无标记检测目标分子的模块化蓝色 RNA 传感器

• 发表时间: 2010
• 期刊: BioSystems (掲載確定)
• 作者: C.Furutani;K.Shinomiya;Y.Aoyama;K.Yamada;S.Sando
• 通讯作者: S.Sando