新規フォールディングRNA修飾酵素のRNA認識機構の解明
阐明新型折叠RNA修饰酶的RNA识别机制
基本信息
- 批准号：09J10011
- 负责人：
- 金额：$ 0.9万
- 依托单位：
- 依托单位国家：日本
- 项目类别：Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- 财政年份：2009
- 资助国家：日本
- 起止时间：2009 至 2010
- 项目状态：已结题
- 来源：
- 关键词：
项目摘要
平成22年度は、計画していた通り、トレフォイル・ノット型酵素であるtRNA (Gm18) methyltransferase [TrmH]のRNA認識機構の解明を中心に研究を行った。(1)TrmHの基質tRNA認識メカニズムの解明TrmHは、基質とするtRNAの種類によって、Type I型およびType II型酵素に分けられる。全てのtRNA種を基質とするType I型酵素および特定のtRNAのみをメチル化するType II型酵素はどのようにしてtRNAを選別しているのかを調べるために、Type I型酵素であるT. thermophilus TrmHおよびType II型酵素であるE. coli TrmHのキメラタンパク質を作製し、tRNAとの相互作用の解析を行った。その結果、今までtRNAの選別には大きく異なるC末端領域が関わっていると考えられていたが、C末端およびN末端を入れ替えても基質tRNAの特異性は変化せず、選別にはコア部分が関わっていることが示唆された。(2)TrmHと基質tRNAにおけるpre-steady state kineticsまた、統合バイオサイエンスセンターの桑島先生・真壁先生ご協力のもと、TrmHと基質tRNA結合におけるpre-steady state kineticsを行った。その結果、C末端はtRNAとの最初の結合にのみ関与していること、また、メチル化されたtRNAでもTrmHに認識されて結合するが(First Binding Process)、その後に続くStructual Change Processによって排除されてしまうことが判った。
2010年，我们按照计划重点阐明了tRNA（Gm18）甲基转移酶[TrmH]（一种三叶结酶）的RNA识别机制。 (1)阐明TrmH的底物tRNA识别机制 根据用作底物的tRNA类型，TrmH分为I型和II型酶。为了研究使用所有 tRNA 物种作为底物的 I 型酶和仅甲基化特定 tRNA 物种的 II 型酶如何选择 tRNA，我们使用了 I 型酶 T。我们创建了嗜热菌 TrmH 和 E 的嵌合蛋白。大肠杆菌 TrmH（一种 II 型酶），并分析了它们与 tRNA 的相互作用。因此，之前认为tRNA选择涉及很大程度上不同的C端区域，但即使C端和N端互换，底物tRNA的特异性也没有改变，而核心区域被认为是建议参与 tRNA 选择。 (2) TrmH 和底物 tRNA 结合的前稳态动力学 我们还在综合生物科学中心的 Kuwashima 博士和 Makabe 博士的合作下进行了 TrmH 和底物 tRNA 结合的前稳态动力学。结果，C末端仅参与与tRNA的初始结合，甚至甲基化的tRNA也被识别并与TrmH（第一次结合过程）结合，但在随后的结构改变过程中被消除。完成了。
项目成果
期刊论文数量（0）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Multi-site substrate recognition mechanism of Aquifex aeolicus Trm1
Aquifex aeolicus Trm1的多位点底物识别机制
- DOI：
- 发表时间：2010
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：T.Awai;Ihsanawati;S.Kimura;C.Tomikawa;A.Ochi;T.Yokogawa;T.Suzuki;Y.Bessho;S.Yokoyama;H.Hori
- 通讯作者：H.Hori
マルチサイト特異性RNAメチル化酵素のtRNA認識機構
多位点特异性RNA甲基转移酶的tRNA识别机制
- DOI：
- 发表时间：2009
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：粟井貴子;木村聡;冨川千恵;越智杏奈;Ihsanawati;別所義隆;横山茂之;横川隆志;鈴木勉;堀弘幸
- 通讯作者：堀弘幸
Flexible recognition of methylation targes site, guanosine at position 18 in tRNA(Gm18)methyltransferase[TrmH]
灵活识别甲基化目标位点，tRNA(Gm18)甲基转移酶[TrmH]第18位鸟苷
- DOI：
- 发表时间：2010
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：A.Ochi;H.Hori
- 通讯作者：H.Hori
三次元コアを修飾するtRNAメチル化酵素による多段階基質tRNA認識
tRNA 甲基转移酶对底物 tRNA 进行多步识别，修饰三维核心
- DOI：
- 发表时间：2010
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：越智杏奈;真壁幸樹;桑島邦弘;堀弘幸
- 通讯作者：堀弘幸
超好熱性真性細菌Aquifex aeolicu由来Trm1[tRNA(m^2_2G26)methyltransferase] のtRNA認識機構と構造の相関
超嗜热真细菌 Aquifex aeolicu 的 tRNA 识别机制与 Trm1 [tRNA(m^2_2G26)methyltransferase] 结构之间的相关性
- DOI：
- 发表时间：2009
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：粟井貴子;Ihsanawati;木村聡;冨川千恵;越智杏奈;横川隆志;鈴木勉;別所義隆;横山茂之;堀弘幸
- 通讯作者：堀弘幸
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- 作者：
粟井 貴子;Ihsanawati;木村聡;冨川 千恵;越智 杏奈;横川 隆志;鈴木 勉;横山 茂之;別所 義隆;堀 弘幸 - 通讯作者：
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