Synthesis and analysis of telomere quadruplex DNA-binding porphyrins based on an electrostatic interaction model

基于静电相互作用模型的端粒四链体 DNA 结合卟啉的合成与分析

• 批准号: 21590118
• 负责人: ISHIKAWA Yoshinobu
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: University of Shizuoka
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21590118/
• 关键词: テロメア; テロメラーゼ; 核酸; 四重鎖; ポルフィリン; 分子認識; インシリコ創薬; 薬学; 生物物理; 有機化学

Drug design, molecular docking, molecular dynamics simulation and synthesis of octacationic porphyrins bearing pyridiniums at their meso and terminal positions were carried out, because these were expected to interact with telomere quadruplex DNA more electrostatically and tightly than did tetracationic porphyrins. In addition, crystallization of the complex of telomere quadruplex DNA with the octacationic porphyrins was attempted.

进行药物设计，分子对接，分子动力学模拟和在其中胞和末端位置的刻有吡啶的八八整数卟啉的合成，因为这些预期这些与四肾上腺素相比，这些预期与端粒四连带DNA相互作用。此外，尝试了端粒四链体DNA与刻板卟啉的结晶。

项目成果

X-ray crystal structure of stomatin from P.horikoshii

堀越松子孔素的 X 射线晶体结构

• 发表时间: 2009
• 作者: Gouda H;Sunazuka T;Hirose T;Iguchi K;Yamaotsu N;Sugawara A;Noguchi Y;Saito Y;Yamamoto T;Watanabe T;Shiomi K;Omura S;Hirono S;荒野直紀;Kazuhiro Haraguchi;横山英志
• 通讯作者: 横山英志

Zinc(II)-5, 10, 15, 20-tetrakis(a-pyridino-m-tolyl)porphyrin Tetrabromide

四溴化锌(II)-5,10,15,20-四(α-吡啶基-间甲苯基)卟啉

• 发表时间: 2009
• 期刊: Molbank
• 影响因子: 0.6
• 作者: Ishikawa Y.;Yamashita T.;Fujii S.;Uno T.
• 通讯作者: Uno T.

D-ファミリーDNAポリメラーゼの大サブユニットN-末端領域に保存される両親媒性は酵素安定性とDNA合成活性を支配する

D 家族 DNA 聚合酶大亚基 N 末端区域的保守两亲特性控制着酶的稳定性和 DNA 合成活性

• 发表时间: 2011
• 作者: 松井郁夫;漆畑祐司;申玉龍;松井えり子;横山英志
• 通讯作者: 横山英志

Structure-based Drug Design of Diketo Acid Derivatives inhibiting Influenza Viral Metalloenzyme RNA Polymerase

基于结构的二酮酸衍生物抑制流感病毒金属酶 RNA 聚合酶的药物设计

• 发表时间: 2010
• 作者: Yoshinobu Ishikawa;Satoshi Fujii
• 通讯作者: Satoshi Fujii

膜タンパク質ストマチンの三次元構造

膜蛋白stomatin的三维结构

• 发表时间: 2009
• 作者: 横山英志;藤井敏;松井郁夫;横山英志;藤田英伸;横山英志
• 通讯作者: 横山英志