Structure and function of light driven chloride ion pump

光驱动氯离子泵的结构和功能

• 批准号: 21570164
• 负责人: IHARA Kunio
• 金额: $ 3.16万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2011
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21570164/
• 关键词: 光生物学; 構造生物学; エネルギー変換; イオンポンプ; ハロロドプシン; 膜タンパク質; 構造解析; 古細菌; 好塩菌; 膜電位感受性

An extremely haloalkaliphilic archaon Natronomonas pharaonis possesses the light-drivenchloride ion pump, halorhodopsin(pHR) on its membrane. We purified pHR in the form of native membrane, crystallized, and solved its structure at 2. 0A resolution. Furthermore we succeeded to solve the structure of chloride ion free blue form of pHR, which is considered to be O-like intermediate. From the structure comparison between chloride-boud and chloride-free forms of pHR, it was shown that the removal of the chloride ion, which is located between the retinal Schiff base and Thr126, is accompanied by such a deformation of helix C that the side chain of Thr126 moves toward helix G, leading to a significant shrinkage of the chloride ion binding site and the water molecule, which was hydrogen boded with the chloride ion, had moved.

极其卤水的Archaon natromonas pharaonis在其膜上具有轻驱氯离子泵，卤代紫红蛋白（PHR）。我们以天然膜的形式纯化了PHR，结晶并以2。0a分辨率求解其结构。此外，我们成功地解决了PHR的氯离子游离蓝色形式的结构，该形式被认为是O样中间体。从氯化物孔和无氯化物形式的PHR之间的结构比较中，可以表明，位于视网膜席夫碱基和Thr126之间的氯离子的去除均伴随着螺旋c的变形，螺旋中伴有Thr126的侧链Thr126的侧链朝向螺旋的螺旋，导致氯化物的显着地位，并导致氯化物的结合，并导致了氯离子的结合，并导致了氯离子的粘结率，并导致了氯离子的结合。离子，已经搬了。

项目成果

A Microbial Rhodopsin with a Unique Retinal Composition Shows Both Sensory Rhodopsin II and Bacteriorhodopsin-like Properties

• DOI: 10.1074/jbc.m110.190058
• 发表时间: 2011-02-25
• 期刊: JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
• 影响因子: 4.8
• 作者: Sudo, Yuki;Ihara, Kunio;Homma, Michio
• 通讯作者: Homma, Michio

高度好塩性好アルカリ性古細菌Natronomonas pharaonisのhR大量発現株の性質

表达大量 hR 的高度嗜盐和嗜碱古菌菌株 Natronomonas pharaonis 的特性

• 发表时间: 2009
• 作者: 井原邦夫;成澤明洋;丸山恵太、竹口優;神山勉
• 通讯作者: 神山勉

Crystal structure of the M intermediate of the azide-bound purple form of pharaonis halorhodopsin

法老视紫红质叠氮化物紫色形式的 M 中间体的晶体结构

• 发表时间: 2011
• 作者: Taichi Nakanishi;Soun Kanada;Midori Murakami;Kunio Ihara;Tsutomu Kouyama
• 通讯作者: Tsutomu Kouyama

ハロロドプシンの立体構造と塩素イオン輸送活性

盐视紫红质的三维结构和氯离子转运活性

• 发表时间: 2010
• 作者: 井原邦夫;金田創運;北島-井原智美;神山勉
• 通讯作者: 神山勉

Gene orders in the upstream of 16S rRNA genes divide genera of the family Halobacteriaceae into two groups

• DOI: 10.1099/ijs.0.031708-0
• 发表时间: 2012-01-01
• 期刊: INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY
• 影响因子: 2.8
• 作者: Minegishi, Hiroaki;Kamekura, Masahiro;Ihara, Kunio
• 通讯作者: Ihara, Kunio