リゾチーム〜α-ラクトアルブミンの折りたたみ中間体の構造と物性

溶菌酶和α-乳清蛋白折叠中间体的结构和物理性质

基本信息

  • 批准号:
    01J10878
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.28万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2001
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2001 至 2002
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

本年度はイヌミルクリゾチーム(Canine Milk Lysozyme : CML)のMolten Globule(MG)状態のnon-native helix構造に関する研究を行った。これまでの研究から、CMLのMG状態においてα-helixに特有な222nmの楕円率の絶対値がNative(N)状態よりも大きく、MG状態のhelix含量がN状態よりも多くなっていることが示されていた。しかしながら、どの部分がMG状態においてhelixを形成するのかは明らかにはされていなかった。本研究において、helical propensityを予測するプログラムであるAGADIRによって、N状態ではβ-sheetを形成している領域内にhelixを形成し易い領域が存在していることが見出され、その領域がMG状態においてhelixを形成している可能性が示唆された。そこで、その領域内の1残基をhelix-breakerであるプロリンに置換した変異体(Q58P)を作成することでnon-native helix構造の存在について検討を行った。その結果、変異体のMG状態における222nmの楕円率の絶対値が野生型よりも小さくなり、58番目周辺が天然状態ではβ-sheetを形成しているがMG状態においてはhelixを形成していることが示された。また、変性実験の結果より58番目周辺のhelix構造はMG状態の形成および安定性には寄与しないことが示され、58番目周辺のhelix構造は非協同的相互作用により形成されていることが示唆された。そこで、この部分に対応するペプチドモデルを作成し、この部分のMG状態のおける3次元分子構造に関する検討をNMR法を用いて行った。研究成果については現在論文執筆中である。
今年,我们对熔球(MG)状态下的犬乳溶菌酶(CML)的非天然螺旋结构进行了研究。既往研究表明,CML MG状态下222 nm处的椭圆率绝对值(α螺旋特征)大于Native(N)状态,并且MG状态的螺旋含量大于 N 状态。然而,尚不清楚哪一部分在 MG 状态下形成螺旋。在这项研究中,使用预测螺旋倾向的程序AGADIR发现,在N状态下,在形成β-折叠的区域内有一个可能形成螺旋的区域,并且该区域是表明在这种状态下可能形成螺旋。因此,我们通过创建突变体(Q58P)来研究非天然螺旋结构的存在,其中该区域的一个残基被脯氨酸(一种螺旋破坏者)取代。结果,突变体MG状态下222 nm处的椭圆度绝对值比野生型小,并且58位周围的区域在自然状态下形成β-折叠,但在自然状态下形成螺旋。结果表明 MG 状态。此外,变性实验的结果表明,58位周围的螺旋结构对MG态的形成和稳定没有贡献,这表明58位周围的螺旋结构是通过非合作相互作用形成的。因此,我们创建了与该部分相对应的肽模型,并利用NMR研究了该部分在MG状态下的三维分子结构。我目前正在写一篇关于我的研究成果的论文。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Mizuguchi M et al.: "Effects of a helix substitution on the folding mechanism of bovine α-lactalbumin"PROTEINS : Structure, Function, and Genetics. 49・1. 95-103 (2002)
Mizuguchi M 等人:“螺旋取代对牛 α-乳白蛋白折叠机制的影响”蛋白质:结构、功能和遗传学 95・1(2002)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Kumeta H et al.: "Low-Temperature-Induced Structural Changes in Human Lysozyme Elucidated by Three-Dimensional NMR Spectroscopy"Biochemistry. 42・5. 1209-1216 (2003)
Kumeta H 等:“三维 NMR 光谱阐明的低温诱导的人体溶菌酶结构变化”生物化学 42・5(2003 年)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Tada M et al.: "Stabilization of protein by replacement of a fluctuating loop : structural analysis of a chimera of bovine α-lactalbumin and equine lysozyme"Biochemistry. 41・46. 13807-13813 (2002)
Tada M等人:“通过替换波动环来稳定蛋白质:牛α-乳清蛋白和马溶菌酶嵌合体的结构分析”生物化学41·46(2002)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

小橋川 敬博其他文献

細胞外プロテオスタシスにおけるレドックス制御とタンパク質凝集との関連解析
细胞外蛋白质稳态中氧化还原控制与蛋白质聚集的关系分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    佐藤 卓史;稲田 祐貴;小橋川 敬博;森岡 弘志
  • 通讯作者:
    森岡 弘志
トランスサイレチンの品質管理における小胞体分子シャペロンの基質認識機構の解明
阐明内质网分子伴侣底物识别机制在转甲状腺素蛋白质量控制中的作用
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    稲田 祐貴;河野 慎吾;小橋川 敬博;森岡 弘志;佐藤 卓史
  • 通讯作者:
    佐藤 卓史
抗体薬物複合体(ADC)の設計開発(機能性一本鎖抗体)
抗体药物偶联物(ADC)(功能性单链抗体)的设计和开发
  • DOI:
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    福田 夏希;二階堂 里那;小橋川 敬博;森岡 弘志(松村保広 監修)
  • 通讯作者:
    森岡 弘志(松村保広 監修)
トランスサイレチン単量体の動的な構造平衡状態の解析
甲状腺素运载蛋白单体的动态结构平衡状态分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    河野 慎吾;小橋川 敬博;甲斐 広文;森岡 弘志;佐藤 卓史
  • 通讯作者:
    佐藤 卓史
阻害剤耐性および選択性の分子機構の解明へ向けた阻害剤-FGFR間相互作用の物理化学的解析
抑制剂-FGFR 相互作用的理化分析,以阐明抑制剂耐药性和选择性的分子机制
  • DOI:
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    林田 大輝;与座 魁斗;雨宮 舜;姫野 梨花;佐藤 卓史;福田 夏希;赤星 璃;逆瀬川 知香;森岡 弘志;小橋川 敬博
  • 通讯作者:
    小橋川 敬博

小橋川 敬博的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('小橋川 敬博', 18)}}的其他基金

構造生物学・物理化学・計算化学に基づくチロシンキナーゼ阻害剤剤選択性の解明
基于结构生物学、物理化学和计算化学阐明酪氨酸激酶抑制剂的选择性
  • 批准号:
    24K09762
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
抗がん剤耐性克服へ向けた核内受容体の活性制御機構の解明
阐明核受体活性控制机制以克服抗癌耐药性
  • 批准号:
    21K06493
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 1.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
ラフトに集積するシグナル伝達タンパク質群の構造生物学的研究
筏中积累的信号蛋白的结构生物学研究
  • 批准号:
    04J08909
  • 财政年份:
    2004
  • 资助金额:
    $ 1.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows

相似海外基金

タンパク質フォールディングに対する天然状態類似相互作用の役割のNMRによる研究
核磁共振研究天然态相互作用对蛋白质折叠的作用
  • 批准号:
    13780529
  • 财政年份:
    2001
  • 资助金额:
    $ 1.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
ランダムタンパク質を表層に提示した細胞の進化工学的機能開発
细胞表面展示随机蛋白质的进化工程功能开发
  • 批准号:
    10145234
  • 财政年份:
    1998
  • 资助金额:
    $ 1.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
触媒機能を有するディノボ人工タンパク質の創製は可能か?
是否有可能制造出具有催化功能的dinovo人造蛋白?
  • 批准号:
    08878087
  • 财政年份:
    1996
  • 资助金额:
    $ 1.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
腸管上皮細胞におけるストレス蛋白質の構造と抗原提示機能の解析
肠上皮细胞应激蛋白的结构和抗原呈递功能分析
  • 批准号:
    05760111
  • 财政年份:
    1993
  • 资助金额:
    $ 1.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了