The study on reaction mechanisms and dynamics of ribosome using deuterium exchange and mass spectrometry

利用氘交换和质谱研究核糖体反应机理和动力学

基本信息

项目摘要

Protein synthetic process by ribosome (translation) had never been observed the detail movement in solution, because ribosome is a macro complex (2.3MDa) comprised of 55 proteins and three rRNAs. In this study, we succeeded in the simultaneous detection of 52 ribosomal proteins in solution on the working time scale by using deuterium exchange and mass spectrometry, and elucidated the magnitude of the conformation change during the translocation process in protein synthesis.
核糖体(翻译)的蛋白质合成过程从未观察到溶液中的细节运动,因为核糖体是由55种蛋白质和三个RRNA组成的宏复合物(2.3mDa)。在这项研究中,我们通过使用氘交换和质谱法在工作时间范围内同时检测了52个核糖体蛋白,并阐明了蛋白质合成中易位过程中构象变化的幅度。

项目成果

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70S ribosomal-protein dynamics in translocation revealed by H/D exchange and mass spectrometry
H/D 交换和质谱揭示易位中的 70S 核糖体-蛋白质动力学
  • DOI:
  • 发表时间:
    2009
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Yamamoto T.;et.al.;山本竜也;山本竜也;山本竜也;山本竜也・清水義宏・上田卓也・城宜嗣;山本竜也・清水義宏・上田卓也・城宜嗣;山本竜也・清水義宏・上田卓也・城宜嗣
  • 通讯作者:
    山本竜也・清水義宏・上田卓也・城宜嗣
H/D 交換と質量分析法を用いた転移過程における70Sリボソーム蛋白質のダイナミクス研究
使用 H/D 交换和质谱法研究转移过程中 70S 核糖体蛋白的动力学
  • DOI:
  • 发表时间:
    2009
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Tatsuya Yamamoto;Yoshihiro Shimizu;Takuya Ueda ;Yoshitsugu Shiro;山本竜也・清水義宏・上田卓也・城宜嗣
  • 通讯作者:
    山本竜也・清水義宏・上田卓也・城宜嗣
H/D 交換と質量分析法による70Sリボソーム蛋白質ダイナミクスのMg2+濃度依存性解析
使用 H/D 交换和质谱法对 70S 核糖体蛋白动力学进行 Mg2+ 浓度依赖性分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Tatsuya Yamamoto;Yoshihiro Shimizu;Takuya Ueda ;Yoshitsugu Shiro;山本竜也・清水義宏・上田卓也・城宜嗣;山本竜也;山本竜也;山本竜也・清水義宏・上田卓也・城宜嗣;山本竜也・清水義宏・上田卓也・城宜嗣;山本竜也・清水義宏・上田卓也・城宜嗣
  • 通讯作者:
    山本竜也・清水義宏・上田卓也・城宜嗣
Application of Micro-reactor Chip Technique for Millisecond Quenching of Deuterium Incorporation into 70S Ribosomal Protein Complex
应用微反应器芯片技术毫秒淬灭氘掺入70S核糖体蛋白复合物
  • DOI:
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    T. Yamamoto;Y. Shimizu;T. Ueda;Y. Shiro;M. Suematsu
  • 通讯作者:
    M. Suematsu
70Sリボソーム蛋白質ダイナミクスのMg^<2+>濃度依存性解析
70S 核糖体蛋白动力学的 Mg^<2+> 浓度依赖性分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Tatsuya Yamamoto;Yoshitsugu Shiro;山本竜也・城宜嗣;Yamamoto Tatsuya;山本竜也
  • 通讯作者:
    山本竜也
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YAMAMOTO Tatsuya其他文献

植民暴力の記憶と日本人:台湾高地先住民と脱植民の運動
殖民暴力与日本人的记忆:台湾高原原住民与非殖民化运动
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    木村自;YAMAMOTO Tatsuya;YAMAMOTO Tatsuya;山本達也;中村平;山本達也;KIMURA Mizuka;YAMAMOTO Tatsuya;NAKAMURA Taira;中村 平;山本達也;中村平
  • 通讯作者:
    中村平
Consuming Music : Case Study of Dharamsala
消费音乐:达兰萨拉案例研究
  • DOI:
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
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  • 作者:
    池上篤志;阿部正明;嶌越恒;久枝良雄;山本達也;増森海笑D.;北別府悠;YAMAMOTO Tatsuya
  • 通讯作者:
    YAMAMOTO Tatsuya
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    木村自;YAMAMOTO Tatsuya;YAMAMOTO Tatsuya;山本達也;中村平;山本達也;KIMURA Mizuka;YAMAMOTO Tatsuya;NAKAMURA Taira;中村 平;山本達也;中村平;中村平
  • 通讯作者:
    中村平
「フィールドでの関わり、立体化する政治」岡本圭史、神本秀爾編『ラウンド・アバウトーフィールドワークという交差点』
《涉足田野,三维政治》冈本敬史、上本修二主编《迂回田野调查的交集》
  • DOI:
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    木村自;YAMAMOTO Tatsuya;YAMAMOTO Tatsuya;山本達也;中村平;山本達也;KIMURA Mizuka;YAMAMOTO Tatsuya;NAKAMURA Taira;中村 平;山本達也
  • 通讯作者:
    山本達也
"Selling Healing: A Case Study of Tibetan Chanting CD Production in Kathmandu," Charles Ramble and Ulrike Roeslar(eds.,), Tibetan and Himalayan Healing: An Anthology for Anthony Arias.
“销售治疗:加德满都西藏唱诵 CD 制作的案例研究”,Charles Ramble 和 Ulrike Roeslar(编辑),西藏和喜马拉雅治疗:安东尼·阿里亚斯的选集。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    木村自;華僑華人の事典編集委員会 編;山本達也;中村平;木村自;山本達也;木村自;木村自;木村 自;山本達也;山本達也;YAMAMOTO Tatsuya
  • 通讯作者:
    YAMAMOTO Tatsuya

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    2009
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  • 批准号:
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基于量子科学和数学信息学的生物大分子系统反应场的理论研究
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    2013
  • 资助金额:
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    24570182
  • 财政年份:
    2012
  • 资助金额:
    $ 2.75万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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