Phylogeny reconstruction and taxonomic revision of the genus Drosophila by super-tree and -matrix analyses

通过超树和矩阵分析果蝇属的系统发育重建和分类学修订

• 批准号: 20570080
• 负责人: HU Yao-Guang
• 金额: $ 2.25万
• 依托单位: Hokkaido University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20570080/
• 关键词: ショウジョウバエ; 分子系統; 分類学; 分類体系; 生物地理学; 中国:インドネシア:マレーシア; 国際研究者交流; 中国

With a perspective of revising the classification system of the whole genus Drosophila, which includes a famous model organism, D. melanogaster, some unsolved problems in its phylogeny were addressed using DNA molecular information. In addition, we developed a novel, sequence-partitioning procedure for phylogenetic tree construction by the Neighbor Joining (NJ) method, to cope with heterogeneous evolutionary processes in different gene regions. Our novel method for NJ tree construction will be useful in saving time of computation, in comparison to other methods, from a huge dataset based on genome-scale sequences, which are now becoming available but include many regions under heterogeneous evolutionary processes.

通过修改整个果蝇属的分类系统，其中包括著名的模型生物体D. melanogaster，使用DNA分子信息解决了其系统发育中的一些未解决问题。此外，我们开发了一种新型的，邻居连接（NJ）方法的系统发育树结构的新型序列分区程序，以应对不同基因区域的异质进化过程。与其他方法相比，从基于基因组尺度序列的巨大数据集中，我们的新泽西树结构方法将有助于节省计算时间，而这些方法现在已经可用，但在异构进化过程中包括许多区域。

项目成果

ゲノムベースの分子系統学に向けたささやかな試みと系統に基づく分類体系改訂の問題:ショウジョウバエ科の場合

对基于基因组的分子系统学的适度尝试以及基于系统发育的分类系统修订问题：果蝇科的案例

• 发表时间: 2011
• 作者: Shahjahan;Md.;他2名;戸田正憲
• 通讯作者: 戸田正憲

学名を変更すべきか,すべきでないか? : Drosophila melanogaster を例に

我们应该还是不应该改变学名？：以果蝇为例

• 发表时间: 2009
• 作者: 幡中迫彦;友澤森彦;佐藤淳;細田徹治;鈴木仁;戸田正憲
• 通讯作者: 戸田正憲

MEGA4を用いた分子系統解析

使用 MEGA4 进行分子系统发育分析

• 发表时间: 2008
• 作者: 志賀向子;浜中良隆;田村浩一郎
• 通讯作者: 田村浩一郎

ショウジョウバエ分子系統学研究の最前線

果蝇分子系统发育研究前沿

• 发表时间: 2011
• 期刊: 低温科学 69巻
• 作者: Michibata;H.;Ueki;T.;加藤徹
• 通讯作者: 加藤徹

Arengomyia, new genus for the Colocasiomyia arenga species group (Diptera : Drosophilidae), with description of a new species

Arengomyia，Colocasiomyia arega 物种组的新属（双翅目：果蝇科），以及新物种的描述

• 发表时间: 2008
• 期刊: Entomological Science 11
• 作者: Yafuso;M.
• 通讯作者: M.