New Development of Kramers-Fokker-Planck Equation of Polyatomic Molecules

多原子分子Kramers-Fokker-Planck方程的新进展

• 批准号: 20550011
• 负责人: NAGAOKA Masataka
• 金额: $ 3.16万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20550011/
• 关键词: 化学反応; 計算科学; 化学物理; 原子・分子物理; シミュレーション工学; 自己組織化; 非平衡

How is the dynamics in condensed system recognized? We tried to understand its characteristics from the viewpoint of energy relaxation processes from an HF molecule to its surrounding water solvent system.Since the dynamics in condensed system should be considered on the basis of stochastic theory, observables must be statistically calculated. Therefore, the super-multi concurrent molecular dynamics simulation system was developed.From those simulations of energy relaxation process using the system involved, it is found that solvated water molecules around the vibrationally excited HF molecule requires their internal vibrational modes for energy transfer. Such energy transfer pathway depends on vibrational vector of excitation mode of the HF molecule. It is concluded that intra-molecular vibrational couplings are dominant on the energy relaxation process.In relation to the Kramers-Fokker-Planck equation modeled condensed systems, furthermore, it was investigated to select which coordinates systems could represent molecular dynamics. We considered that time scales of observables should be introduced in correspondence with molecular fluctuation. It was found that the characteristics depend properly on the time window size.

冷凝系统中的动力学如何识别？我们试图从HF分子到其周围的水溶剂系统的能量放松过程的角度来理解其特征。由于应根据随机理论考虑凝结系统中的动力学，因此必须从统计上计算出可观察的物品。因此，从涉及的系统的能量弛豫过程中开发了超级元素并发的分子动力学模拟系统，发现振动激发的HF分子周围的溶剂化水分子需要其内部振动模式才能进行能量传递。这种能量转移途径取决于HF分子激发模式的振动载体。可以得出结论，分子内振动耦合在能量弛豫过程中占主导地位。与Kramers-Fokker-Planck方程建模的凝结系统相关，此外，还研究了哪些坐标系统可以代表分子动力学。我们认为，应在与分子波动的对应中引入可观察到的时间尺度。发现特征正确取决于时间窗口大小。

项目成果

QM/MM法におけるQM電子分布を再現する点電荷分布評価法

以 QM/MM 法重现 QM 电子分布的点电荷分布评估方法

• 发表时间: 2010
• 作者: 山田健太;小谷野哲之;岡本拓也;麻田俊雄;古賀伸明;長岡正隆
• 通讯作者: 長岡正隆

表面Kirkwood-Buff積分法によるタンパク質部分モル体積不変性の微視的理解

通过表面 Kirkwood-Buff 积分法对蛋白质部分摩尔体积不变性的微观理解

• 发表时间: 2009
• 作者: 優乙石;長岡正隆
• 通讯作者: 長岡正隆

溶液化学反応のための半経験的分子軌道法の最適手法 : ポテンシャル面と電荷分布

溶液化学反应的最佳半经验分子轨道方法：势表面和电荷分布

• 发表时间: 2009
• 作者: 竹中規雄;小谷野哲之;長岡正隆
• 通讯作者: 長岡正隆

自由エネルギー勾配法による水溶液中アンモニアイオン化過程の反応経路探索

利用自由能梯度法寻找水溶液中氨电离过程的反应路线

• 发表时间: 2010
• 作者: 小谷野哲之;竹中規雄;長岡正隆
• 通讯作者: 長岡正隆

化学反応のマルチスケールシミュレーション

化学反应的多尺度模拟

• 发表时间: 2011
• 作者: 菅野学;河野裕彦;藤村勇一;長岡正隆
• 通讯作者: 長岡正隆