Dynamic Proteomics of Transcriptional and Nuclear Architecture

转录和核结构的动态蛋白质组学

• 批准号: 20221010
• 负责人: HAMAKUBO Takao
• 金额: $ 126.13万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20221010/
• 关键词: プロテオミクス; 複合体解析; スプライシング; 転写調節; 細胞周期; 核スペックル; 核小体; クロマチン修飾; 核微細構造; ヒストン修飾; 生体イメージング; 軟Ｘ線顕微鏡; 核内受容体; 軟X線顕微鏡; 核タンパク質; RNAプロセッシング; モノクローナル抗体

In this study, we developed a highly sensitive quantitative proteomics analysis technique by using magnetic beads with immobilized specific antibodies. By generating highly specific monoclonal antibodies against HNF4-alpha, LXR-alpha, or WTAP, we have identified protein complexes for the transcriptional control of glucose metabolism related genes or RNA-processing machinery for the cell cycle control through distribution to nuclear speckles or nucleoli.

在这项研究中，我们通过使用具有固定特异性抗体的磁珠来开发高度敏感的定量蛋白质组学分析技术。通过生成针对HNF4-Alpha，LXR-Alpha或WTAP的高度特异性单克隆抗体，我们已经确定了与葡萄糖代谢相关基因的转录控制或RNA处理机制的转录控制，以通过分布到核斑点或核仁。

项目成果

CDGAPはROBO1と相互作用して血管内皮細胞のSLIT2依存的な遊走に関与する

CDGAP 与 ROBO1 相互作用并参与血管内皮细胞的 SLIT2 依赖性迁移

• 发表时间: 2010
• 作者: 根本悟士;川村猛;岩成宏子;太期健二;堀内恵子;南敬;児玉龍彦;浜窪隆雄
• 通讯作者: 浜窪隆雄

Epigenetically coordinated GATA2 binding is necessary for endothelium specific endomucin sxpression

表观遗传协调的 GATA2 结合对于内皮特异性内粘蛋白表达是必需的

• 发表时间: 2011
• 期刊: The EMBO Journal in press
• 作者: Kanki Y;Kohro T;Jiang S;Tsutsumi S;Mimura I;Suehiro J;Wada Y;Ohta Y;Ihara S;Iwanari H;Naito M;Hamakubo T;Aburatani H;Kodama T;Minami T.
• 通讯作者: Minami T.

核内受容体の組織発現と細胞内局在

核受体的组织表达和亚细胞定位

• 发表时间: 2010
• 作者: 本庄裕司;長岡貞男;中村健太;清水由美;Yasuyuki Miyahara;内藤眞
• 通讯作者: 内藤眞

Development of the compact low-energy soft x-ray CT instrument for the soft material structural analysis 」

开发用于软材料结构分析的紧凑型低能软X射线CT仪器

• 发表时间: 2008
• 作者: M.Miyoshi,T.Hamakubo,T.Kodama ,A.Ko ishikawa,M.Tsuchiya;N
• 通讯作者: N

Pentraxin 3 (PTX3) is a novel predictive marker for acutecoronary events

Pentraxin 3 (PTX3) 是急性冠状动脉事件的新型预测标记物

• 发表时间: 2010
• 作者: Alexander AS;Ohashi R;Hamakubo T;Kodama T;Naito M
• 通讯作者: Naito M