Infrared Spectroscopy of Newly Discovered Archaeal-type Rhodopsins

新发现的古菌型视紫红质的红外光谱

• 批准号: 19370067
• 负责人: KANDORI Hideki
• 金额: $ 11.65万
• 依托单位: Nagoya Institute of Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19370067/
• 关键词: 光生物; 生体分子; レチナール; 水素結合; ナノバイオ; 生物物理; 内部結合水; 赤外分光

Archaeal-type rhodopsins were found in Archaea, but the recent genome sequencing projects have revealed that archaeal rhodopsins also exist in Eukarya and Eubacteria. In this grant project, we investigated molecular mechanism of light-energy and light-signal conversions in newly discovered archaeal-type rhodopsins. Comprehensive Fourier-transform infrared (FTIR) analysis led to a finding that proton-pumping rhodopsins possess strongly hydrogen-bonded water molecules, suggesting that such an internal water is the functional determinant of light-driven proton pump.

古细菌在古细菌中发现了古细菌的视紫红蛋白，但是最近的基因组测序项目表明，古代菌和精杆菌也存在古细菌蛋白。在这个赠款项目中，我们研究了新发现的古细菌型动蛋白中光能和光信号转化的分子机制。综合的傅立叶转换红外（FTIR）分析导致发现质子泵式的视紫红蛋白具有强大的氢键水分子，这表明这种内部水是光驱动质子泵的功能决定因素。

项目成果

ヒドロキシルアミン存在下でのウシロドプシンの赤外分光解析

羟胺存在下牛视紫红质的红外光谱分析

• 发表时间: 2008
• 作者: 片山耕大;古谷裕司;神取秀樹
• 通讯作者: 神取秀樹

細菌のべん毛モーターを駆動する固定子複合体中のイオン透過機構の解析

驱动细菌鞭毛马达的定子复合体中离子渗透机制的分析

• 发表时间: 2008
• 作者: 須藤雄気;北出祐也;寺島浩行;吉住玲;小嶋勝;小嶋誠司;古谷祐詞;神取秀樹;本間道夫
• 通讯作者: 本間道夫

時間分解赤外分光法によるバクテリオロドプシンの内部結合水の構造解析

时间分辨红外光谱法分析细菌视紫红质内部结合水的结构

• 发表时间: 2008
• 作者: 張宇;岩田達也;神取秀樹;神取秀樹
• 通讯作者: 神取秀樹

光回復酵素およびクリプトクロムの光誘起構造変化の研究

光致激活酶和隐花色素结构变化的研究

• 发表时间: 2008
• 作者: 張宇;岩田達也;人見研一;Elizabeth D.Getzoff;藤堂剛;神取秀樹
• 通讯作者: 神取秀樹

Mechanism of color-tuning mutation in the E-F loop of proteorhodopsin

蛋白视紫红质E-F环的颜色调节突变机制

• 发表时间: 2009
• 作者: 山田啓介;川鍋陽;吉次麻衣子;神取秀樹
• 通讯作者: 神取秀樹