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有用オリゴ糖合成酵素の構造機能解析
有用寡糖合酶的结构和功能分析
基本信息
- 批准号：05J00182
- 负责人：
- 金额：$ 2.11万
- 依托单位：
- 依托单位国家：日本
- 项目类别：Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- 财政年份：2005
- 资助国家：日本
- 起止时间：2005 至 2007
- 项目状态：已结题
- 来源：
- 关键词：
项目摘要
本研究は糖鎖の伸長・分解を触媒する糖質関連酵素についてX線結晶構造解析により反応機構・基質特異性の構造基盤を獲得し、タンパク質工学的手法を用いた有用オリゴ糖合成への応用を目的としている。ビフィズス菌はラクト-N-ビオース(Ga1-β1,3-GlcNAc)を資化するユニークな代謝経路を持つが、その資化能は加リン酸分解酵素(LNBP)のラクト-N-ビオース分解能に由来する。Bifidobacterium longumのLNBPについて構造解析を行い、基質との複合体構造解析およびドッキングシミュレーションにより反応機構を決定した。LNBPの立体構造は糖質加水分解酵素と類縁の構造を有し、その加リン酸分解は加水分解と類似の機構で進行することが分かった。一方既知の加水分解酵素には見られない特徴として、基質の結合状態によって大きく構造を変化させることを明らかにした。
这项研究旨在获取与碳水化合物相关酶的反应机制和底物特异性的结构基础，这些酶通过X射线晶体学分析来催化糖链的扩展和分解，并将其应用于使用蛋白质工程技术的有用的寡糖同步。双歧杆菌具有独特的代谢途径，该途径使用乳酸-N-生物（GA1-β1,3-GLCNAC），并且它们的使用能力来自磷酸盐降解酶（LNBP）的乳糖-N-生物分辨率（LNBP）。在双歧杆菌的LNBP上进行了结构分析，并通过对底物和停靠模拟的复合物的结构分析来确定反应机理。发现LNBP的三维结构具有与碳水化合物水解酶相关的结构，并且其磷酸盐的磷酸盐降解是通过类似于水解的机制发生的。另一方面，在已知水解酶中未发现的特征是该结构取决于底物的结合状态。
项目成果
期刊论文数量（5）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Structural dissection of the reaction mechanism of cellobiose phosphorylase
- DOI：10.1042/bj20060274
- 发表时间：2006-08-15
- 期刊：
- 影响因子：4.1
- 作者：Hidaka, Masafumi;Kitaoka, Motomitsu;Fushinobu, Shinya
- 通讯作者：Fushinobu, Shinya
Computational analyses of the conformational itinerary along the reaction pathway of GH94 cellobiose phosphorylase
GH94 纤维二糖磷酸化酶反应途径构象行程的计算分析
- DOI：
- 发表时间：
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：S. Fushinobu;B. Mertz;A. D. Hill;M. Hidaka;M;Kitaoka;and P. J. Reilly
- 通讯作者：and P. J. Reilly
New structural insights on carbohydrate-active enzymes
关于碳水化合物活性酶的新结构见解
- DOI：
- 发表时间：2007
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：S. Fushinobu;M. Hidaka;A. Miyanaga;and H. Imamura
- 通讯作者：and H. Imamura
Reaction mechanism and substrate recognition of GH-94 phosphorolytic enzymes
- DOI：10.5458/jag.52.191
- 发表时间：2005-01-01
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：Hidaka, M.;Honda, Y.;Fushinobu, S
- 通讯作者：Fushinobu, S
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