ゲノム分野におけるオントロジーを基にした知識自動獲得と知識の構造化に関する研究

基因组学领域基于本体的自动知识获取与知识结构化研究

• 批准号: 15700243
• 负责人: 美馬 秀樹
• 金额: $ 2.18万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 2004
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-15700243/
• 关键词: 知の構造化; 自然言語処理; バイオインフォマティックス; 情報抽出; 用語認識; クラスタリング; ターミノロジー; オントロジー

本研究では、ゲノム分野のように、今後、さらに知識資源が増加すると考えられる分野において、ますます問題となる知識管理に関し、XMLによる知識表現が標準となることを前提に、用語の認識と分類(ターミノロジー、及びオントロジー)を中心としたオントロジー情報の構築とオントロジー情報の管理検索の手法について研究開発を行うことを基本とする。平成16年度においては、前年度により設計された基盤システムの実装を進めると共に、研究、開発される要素技術の統合を進めることで、全体システムとして、基盤システム側と要素技術側の双方向から必要とされる機能、精度、処理効率を整理しつつ統合を行った。また、用語認識、オントロジー構築等の言語処理技術のカバレッジを広げ、頑健性を高めることで、大規模なデータを対象とする際にも十分実運用に耐えられるシステムの構築を行った。具体的には、・知識管理システムの構築と高速かつ容易な情報抽出手法の研究XMLタグを含むタグ情報等によりアノテートされた知識の効率的管理システムを実現し、研究を推進するための稼動環境の構築、および実際の運用、開発に際して、ユーザインタフェース、API等に関する研究開発を行った。さらに、管理された知識情報を効率的、かつ容易な操作で検索するための処理環境について研究を行い、実装を進め、総合的な知識の構造化システムの実現を行った。・知識の構造化とVisualizeの研究構造化された知識を如何に解りやすく表現し、Visualizeを行うかに関する研究開発を行い、知識の検索において、従来のように関連する知識のリストを表示するのみではなく、関連する知識をVisualizeすることで知識の俯瞰を可能とするインタフェースの実装を行った。以上のように、本年度においても概ね計画に基づき研究を進めることができたと思われる。今後、さらなるケーススタディ、および評価を行うことでシステム、およびモデルの有効性、頑健性を検証すると共に、実際のネットワーク上や、協力企業等での実稼動による運用を行うことで、システムの実用性を高める予定である。また同時に研究成果の発表も積極的に行う予定である。

这项研究的重点是本体论信息构建和管理以及搜索本体学信息的搜索方法的研究和开发，侧重于术语识别和分类（术语和本体学）（术语和本体论），假设使用XML的知识表达将成为诸如基因组领域的领域的标准，例如知识资源将在未来的基因组领域中进一步提高，并且具有使用XML的前提，那么知识的表达将会进一步增加。 2004年，我们实施了上一年设计的基础系统，并促进了要研究和开发的基本技术的集成，并且作为整个系统，我们组织了基础系统方面和元素技术方面所需的功能，准确性和处理效率。此外，通过扩大对语言处理技术（例如术语识别和本体论构建和改善鲁棒性）的覆盖范围，我们建立了一个系统，即使在针对大型数据时，也可以承受实际操作。具体来说，当构建知识管理系统并研究快速简便的信息提取方法时，我们已经对用户界面，API等进行了研究。我们已经意识到了一个有效的知识管理系统，其中包括标签信息，包括XML标签等，以及在构建工作环境以促进研究的工作环境，并且在实际操作和开发研究时，我们进行了研究和开发。此外，对处理环境进行了研究，以通过操作有效，轻松地搜索托管知识信息，并实现了全面的知识结构系统。 - 知识的结构和可视化研究我们进行了研究和开发，以了解如何轻松理解和表达结构化知识并实施可视化，在搜索知识时，我们不仅像以前一样显示了相关知识的列表，而且还实施了一个界面，该界面可以通过可视化相关知识来提供鸟类的知识视图。如上所述，似乎今年我们也能够根据计划进行研究。将来，将进行进一步的案例研究和评估，以验证系统和模型的有效性和鲁棒性，并通过在实际网络或合作伙伴公司中操作系统来增强系统的实用性。同时，我们计划积极提出研究结果。

项目成果

Mining biomedical terminology from literature

从文献中挖掘生物医学术语

• 发表时间: 2004
• 期刊: Proceedings of Terminology, Computing and Translation : an International Conference at the University of Wales Swansea
• 作者: Sophia Ananiadu;Goran Nenadic;Hideki Mima;Junichi Tsujii
• 通讯作者: Junichi Tsujii

A Study of a Search System for Structured Knowledge Platform for Nanomaterial Manufacturing

纳米材料制造结构化知识平台搜索系统的研究

• 发表时间: 2004
• 期刊: Proceedings of the 10th Asian Pacific Confederation of Chemical Engineering (APCChE)
• 作者: Naoko Yamagata;Hideki Mima;Eiichi Watanabe
• 通讯作者: Eiichi Watanabe

Hideki Mima, Taesung Yoon: "A Methodology for Ontology-based Knowledge Acquisition and Structuring in an Industry-Academic-Government Project "Go Japan!""Proceedings of u-Korea Conference. 197-203 (2003)

Hideki Mima、Taesung Yoon：“工业-学术-政府项目“Go Japan！”中基于本体的知识获取和构建的方法”u-Korea 会议论文集。