統合失調症感受性候補領域9q及び20qにおける関連解析による感受性遺伝子の同定

通过关联分析鉴定精神分裂症易感候选区域9q和20q的易感基因

基本信息

批准号：
04J61632
负责人：
後藤大輝
金额：
$ 0.77万
依托单位：
Kyushu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-04J61632/
关键词：
ヒト統合失調症関連解析連鎖不平衡解析 SNP 日本人集団

项目摘要

統合失調症感受性遺伝子を同定することを目的として、受入研究室の服巻らが属するJSSLG (Japanese schizophrenia Sib-pair Linkage Group)の研究により示された疾患と弱いながら連鎖する11カ所の染色体領域の中から、他のグループからも連鎖の報告がある5q33.1領域を選択し、関連解析を行った。まず、上記の染色体領域において、データベース検索により、40個の遺伝子を候補遺伝子とし、各々の遺伝子領域全体をカバーするように約30kbごとにSNPを選定した。これらのSNPについて、Direct Sequencing法を用い、日本人集団からなる罹患群・健常群各100検体のタイピングを行った。これまでに設定した119個のSNPのうち101個のSNPについてタイピングが終了した。その結果、罹患群と健常群の間に有意水準5%レベルでの差が認められたのは、単点での遺伝子型頻度およびアレル頻度においては、それぞれ8SNPと5SNPであった。また、ハプロタイプ解析の結果、1%および5%レベルでの有意差がそれぞれ5組および6組のハプロタイプで見つかった。これらの結果から、単点解析とハプロタイプ解析の両方で有意差が見られた3遺伝子については統合失調症との関連が示唆された。残りのSNPについてタイピングを行うのとともに、有意差が認められたSNPについては第二の日本人集団を用いて再現性の確認を行った。これらの結果がまとまり次第、論文として公表する予定である。

为了鉴定精神分裂症的易感基因，我们选择了5q33.1区域，据报道，该区域与其他组相关的5q33.1区域是从11个与日本精神分裂症Sib-Pair-Pair-Pair-Pair-Pair-Pair-Pairage Group（JSSLG）的疾病相关的11个染色体区域之间的联系。属于并进行了相关分析。首先，在上述染色体区域中，通过数据库搜索使用40个基因作为候选基因，每30 KB选择SNP以覆盖整个基因区域。这些SNP使用直接测序方法对每个受影响和健康的群体的100个标本进行键入，包括日本人群。到目前为止已设置的119个SNP中有101个已经完成了打字。结果，分别在8SNP和5SNP的单点基因型和等位基因频率中观察到受影响组和健康组之间的差异。此外，单倍型分析显示，分别在五个和六个单倍型中分别在1％和5％的水平上存在显着差异。这些结果表明，在单点和单倍型分析中都有显着差异的三个基因与精神分裂症有关。除了输入剩余的SNP外，还使用第二个日本人群证实了可重复性的SNP，具有显着差异的SNP。一旦总结了这些结果，它们将作为论文发表。