軟腐性エルウイニア属細菌におけるペクチンにより誘導される遺伝子群のマイクロアレーによる探索

微阵列在软腐欧文氏菌中寻找果胶诱导的基因

基本信息

批准号：
04F04196
负责人：
露無慎二
金额：
$ 1.54万
依托单位：
Shizuoka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至 2006
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-04F04196/
关键词：
軟腐性エルウイニア PhoP-PhoQ二分子制御植物微細環境ペクチナーゼマイクロアレー解析プロテオミクスリポ多糖質エリシター植物病原細菌エルウイニア属細菌 PhoP-PhoQ二分子制御機構シデロフォア

项目摘要

平成18年度は、8月31日に2年間の特別研究員奨励費の受給が終わった.着任以来精力的に研究に取組み、これまでに着実に研究成果をあげてきている。明治大学農学部渋谷教授との病原細菌のリポ多糖質がエリシター活性を持つ事を見つけ、日本植物整理学会で既に発表し、国際植物-微生物相互作用学会でも発表の予定である。また、軟腐性エルウイニア属細菌については、英国スコットランド農業作物研究所Ian Toth博士とのポストゲノム解析の共同研究のため、渡英し、phoP-phoQ二成分制御システムの制御下にある遺伝子群をマイクロアレー解析を用いて、網羅的に解析した。次に、これらの遺伝子についてマイーカーエクスチェンジ変異株を作成して、これらの遺伝子の役割を詳細に解析している。このようにして捉えた遺伝子群の中に鉄輸送関連の遺伝子等のある程度予測できた遺伝子群の他に、昆虫毒素遺伝子などの全く予想もしなかった遺伝子群も捉える事ができた。鉄輸送については、FepA欠損変異株を作成し、さらに解析を進め、細胞内の鉄イオン濃度が、多くの病原性関連遺伝子の生産誘導に重要な働きを持つ事を明らかにする事ができた。

2006年，我于8月31日领取了为期两年的特殊研究员资助。上任以来，我积极从事研究工作，稳步取得研究成果。他与明治大学农学院涩谷教授合作，发现来自病原菌的脂多糖具有激发子活性，他已在日本植物有机体学会上发表了这一发现，并计划在国际植物-微生物相互作用学会上发表论文。关于欧文氏菌属软腐菌，我去英国与英国苏格兰农作物研究所的Ian Toth博士进行后基因组分析联合研究，将其在phoP-控制下的基因簇进行了微组织化。使用阵列分析进行了 phoQ 双组分调节系统的综合分析。接下来，我们为这些基因创建了汽车交换突变株，并详细分析了这些基因的作用。在以这种方式捕获的基因组中，除了可以在一定程度上预测的基因组，例如铁转运相关基因之外，我们还能够识别出完全意想不到的基因组，例如昆虫毒素基因。关于铁转运，我们创建了FepA缺陷突变株并进行了进一步分析，结果表明细胞内铁离子浓度在诱导许多致病性相关基因的产生中发挥着重要作用。