Studies on functional domains essential for the retrotransposition of LINE

LINE逆转录转座必需功能域的研究

• 批准号: 15370003
• 负责人: FUJIWARA Haruhiko
• 金额: $ 7.3万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 2005
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-15370003/
• 关键词: non-LTR retrotransposon; LINE; endonuclease; telomere; target specific LINE; reverse transcriptase; rDNA specific LINE; retrotransposition mechanism; 部位特異的レトロトランスポジ; RNP複合体構造; 28SrDNA; 転移機構; レトロトランスポジション; SART; ORF1

During the project term, we clarified the essential domains for the retrotranspositions of LINE, using mainly telomere specific LINE SART1, as shown below (1 to 3, TRAS1 for 4, R1 for 5).1. We found novel domains NLS and telomere accession signals in ORF1 proteins in SART1 (Matsumoto, T., et al.Mol.Cell Biol. 24,105-122. (2004)).2. We found eukaryotic translational coupling for the regulation of ORF1 and ORF2 translation in SART1 (Kojima, KK.et al.Mol.Cell.Biol.25, 7675-7686. (2005)).3. We clarified the 3'UTR structure which is recognized by reversetranscription unit of SART1 (Osanai, M., et al.Mol.Cell Biol.24, 7902-7913. (2004)).4. Collaborating with Dr.Maita in Kyusyu Univ., we firstly reported the crystal structure of endonuclease domain of TRAS1 (Maita, N., et al.J.Biol.Chem.279, 41067-41076. (2004)).5.We established the retrotransposion assay system for 28SrDNA specific LINE, R1, which enable us to use several target specific LINE, telomere specific LINEs, SART1 and TRAS1,and rDNA specific R1,for future analysis (Anzai T., et al.Nucleic Acids Res.33, 1993-2002. (2005)).

在项目术语中，我们使用主要是端粒特异性线SART1（如下所示）（1至3，Tras1 for 4，r1 for 5）。1。我们在SART1中的ORF1蛋白中发现了新型NLS和端粒登录信号（Matsumoto，T。，等人Cell.cellBiol。24,105-122。（2004））。2。我们发现了SART1中ORF1和ORF2翻译的真核转化耦合（Kojima，Kk.et al.mol.cell.cell.biol.25，7675-7686。（2005））。3。我们阐明了SART1的回流笔记单元（Osanai，M。等，M。等。与Maita博士在Kyusyu大学合作，我们首先报道了TRAS1的核酸内切酶结构域的晶体结构（Maita，N。，N。等人，等等。特定线，SART1和TRAS1和RDNA特异性R1，用于将来分析（Anzai T.等，核酸Res.33，1993-2002。（2005））。

项目成果

染色体の端に共生するもの-昆虫の特異なテロメア構造

染色体末端共生的东西——昆虫独特的端粒结构

• 发表时间: 2004
• 期刊: 現代化学 399
• 作者: Maita;N.;Anzai;T.;Aoyagi;H.;Mizuno;H.;Fujiwara;H.;藤原晴彦;藤原晴彦
• 通讯作者: 藤原晴彦

Hwang JS, et al.: "cDNA cloning and mRNA expression of L-3,4-dihydroxyphyenylalanine decarboxylase gene homologue from the silkworm, Bombryx mori."Biotechnol Lett.. 25. 997-1002 (2003)

Hwang JS 等人：“蚕 Bombryx mori 的 L-3,4-二羟基苯丙氨酸脱羧酶基因同源物的 cDNA 克隆和 mRNA 表达。”Biotechnol Lett.. 25. 997-1002 (2003)

Functional roles of read-through 28S rRNA sequence in in vivo retrotransposition of non-LTR retrotransposon R1Bm.

通读 28S rRNA 序列在非 LTR 逆转录转座子 R1Bm 体内逆转座中的功能作用。

• 发表时间: 2005
• 期刊: Nucleic Acids Res 33
• 作者: Anzai T.;Osanai;M.;Hamada;M.;Fujiwara;H.
• 通讯作者: H.

放送大学教材「分子生物学]分担執筆 第2,6,7章、

合着开放大学教材《分子生物学》第2、6、7章，

• 发表时间: 2005
• 作者: Osanai;M.;Kojima;K.K.;Futahashi;R.;Yaguchi;S.;Fujiwara,H.;藤原晴彦
• 通讯作者: 藤原晴彦

An extraordinary retrotransposon family encoding dual endonucleases

• DOI: 10.1101/gr.3271405
• 发表时间: 2005-08-01
• 期刊: GENOME RESEARCH
• 影响因子: 7
• 作者: Kojima, KK;Fujiwara, H
• 通讯作者: Fujiwara, H