急性白血病再発・難治例のグノム発現解析による白血病細胞の治療耐性機構の解明

急性白血病复发难治病例基因组表达分析阐明白血病细胞耐药机制

基本信息

批准号：
12217064
负责人：
小林透
金额：
$ 2.88万
依托单位：
Mie University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
财政年份：
2000
资助国家：
日本
起止时间：
2000 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12217064/
关键词：
DNA microarray Gene expression profiling AML MDR1 Annexin I FAB-M1 FAB-M3 myeloperoxidase precursor

项目摘要

急性白血病再発例の治療反応性は初診時に比べ悪く、白血病細胞のmRNA発現様式は、その進展・増殖・治療反応性と深く関連している。本研究は、2304個のunselected genes(Research Genetics)を有するDNA microarrayを用い、以下の点について検討した。1.1μgのtotal RNAを用いて解析が可能なoligo-dT/T7 promoterとswitch mechanism at 5'-end of RNA template(SMART)法を組み合わせたリニア増幅法を開発した。2.急性骨髄性白血病(AML)7症例において初診時及び再発時のtotal RNAを抽出し解析した結果では、multidrug resistance gene(MDR1:再発時2.4倍)を含む19個の遺伝子が2倍以上再発時にupregulateされており、Annexin I(再発時2.7倍)を含む23個の遺伝子がdownregulateされていた。さらに個々の遺伝子についてはPCR法にて確認予定である。3.AML FAB-M1症例4例とFAB-M3[t(15;17)]症例4例で病型によるmRNA発現様式を比較した。FAB-M3ではM1と比較し448個の遺伝子が2倍以上upregulateされており、myeloperoxidase precursorを含む58個以上の遺伝子が4倍以上upregulateされていた。M1にくらべM3で2倍以上downregulateされている遺伝子は79個みられ、4倍以上downregulateされている遺伝子は11個みられた。このことよりFAB-M1とFAB-M3では遺伝子発現様式でかなりの相違があることが示された。興味深い遺伝子発現様式の相違が観察されており、今後は新しい治療法の開発や遺伝子の機能解明につなげるように研究を発展させていく予定である。(本研究はM.D.Anderson癌センターCancer Genomics Core Lab.のWei Zhang博士との共同研究である。)

急性白血病复发病例的治疗反应比初诊时差，白血病细胞的mRNA表达模式与其进展、增殖和治疗反应密切相关。本研究使用包含 2304 个未选择基因的 DNA 微阵列（遗传学研究）来检查以下几点。我们开发了一种结合oligo-dT/T7启动子和RNA模板5'端开关机制（SMART）的线性扩增方法，可以使用1.1μg总RNA进行分析。 2.对7例急性髓系白血病（AML）初诊时和复发时的总RNA进行提取和分析结果显示，包括多药耐药基因（MDR1：复发时的2.4倍）在内的19个基因，其发生可能性是其两倍以上。 23 个基因下调，包括膜联蛋白 I（复发时下调 2.7 倍）。此外，我们计划使用PCR方法确认各个基因。 3. 我们比较了 4 例 AML FAB-M1 病例和 4 例 FAB-M3[t(15;17)] 病例中不同疾病类型的 mRNA 表达模式。在FAB-M3中，448个基因上调是M1中的两倍多，并且超过58个基因（包括髓过氧化物酶前体）上调了四倍多。与 M1 相比，M3 中有 79 个基因下调超过两倍，11 个基因下调超过四倍。这表明FAB-M1和FAB-M3之间的基因表达模式存在相当大的差异。已经观察到基因表达模式的有趣差异，未来我们计划以一种能够开发新疗法和阐明基因功能的方式发展我们的研究。（这项研究是与 M.D. 安德森癌症中心癌症基因组学核心实验室的张伟博士合作的。）