共生型ウイルスの真の多様性をキノコで解く

利用蘑菇揭示共生病毒的真正多样性

基本信息

批准号：
22KJ0440
负责人：
趙彦杰
金额：
$ 2.83万
依托单位：
University of Tsukuba
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2023
资助国家：
日本
起止时间：
2023-03-08 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22KJ0440/
关键词：
マイコウイルスきのこ環境ウイルス

项目摘要

本研究では、自然界生態系における「宿主と共生するウイルス」の真の多様性を解明することを目的としている。実験計画初年度である2022年度は、上記目的達成のために、まず“キノコ子実体から共生型ウイルスの多様性”を解析した。研究材料は自然界の子実体から分離した菌株を用いた。2022年度はアガロースゲル電気泳動方法 (AGE)およびdsRNA シーケンシング (FLDS方法)により担子菌類とチャワンタケ (子嚢菌類)のウイルススクリーニングを実施した。その結果、担子菌類の51分離株のうち、5株はウイルス保持株として検出された。さらに、FLDS法を用いて、ウイルス保持株から5種の二本鎖RNA（dsRNA）ウイルス、1種のプラスセンス一本鎖RNA（+ssRNA）ウイルス、および1種のプラスセンス一本鎖RNA（-ssRNA）ウイルスの新規ゲノム配列を同定した。また、同定されたウイルスの配列情報を用いて、特異プライマーを設計して、長期保存の子実体標本からRT-PCRにより各ウイルスも検出できた。分離株及び子実体標本からウイルスを検出したことで、上記行われた方法は有効的にウイルスを探索できることを証明した。さらに、上記確立した方法でチャワンタケ (子嚢菌類)の57分離株からウイルススクリーニングを実施した結果、13株はウイルスを保持することが解明した。また、FLDS法によりウイルス配列を決定し、検出できた11種のウイルスのうち、MitovirusとEndornavirusはそれぞれ4種であることがわかった。現在は各ウイルス配列の特徴と分類地位を進んでいる。今後はウイルス検出しやすい菌種に注目して、環境中におけるウイルスの機能に進む予定である。

这项研究的目的是阐明自然生态系统中“与宿主共存的病毒”的真正多样性。 2022年，即实验计划的第一年，为了实现上述目标，我们首先分析了“蘑菇子实体共生病毒的多样性”。所用的研究材料是从自然界子实体中分离的菌株。 2022年，我们利用琼脂糖凝胶电泳（AGE）和dsRNA测序（FLDS）对担子菌和子囊菌（Ascomycetes）进行了病毒筛查。结果，在51株担子菌分离株中，检测出5株为病毒携带者。此外，使用FLDS方法，五种双链RNA（dsRNA）病毒、一种正义单链RNA（+ssRNA）病毒和一种正义单链RNA（-ssRNA）病毒鉴定了新的基因组序列病毒。此外，利用已识别病毒的序列信息，我们设计了特异性引物，并能够通过RT-PCR从长期子实体标本中检测出每种病毒。对分离株和子实体标本中病毒的检测证明，上述方法可以有效地寻找病毒。此外，使用上述方法对57株Chawantake（子囊菌）分离株进行病毒筛选，结果发现13株携带该病毒。此外，利用FLDS法测定病毒序列，发现可检测的11种病毒中，线粒体病毒和内核病毒各4种。我们目前正在研究每种病毒序列的特征和分类状态。未来，我们计划将重点放在易于检测的细菌物种上，并转向环境中病毒的功能。

项目成果

期刊论文数量（4）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Eukaryotic Microbial RNA Viruses—Acute or Persistent? Insights into Their Function in the Aquatic Ecosystem

真核微生物 RNA 病毒——急性还是持续性？它们在水生生态系统中的功能

DOI：
10.1264/jsme2.me22034
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
2.2
作者：
Urayama Syun;Takaki Yoshihiro;Chiba Yuto;Zhao Yanjie;Kuroki Misa;Hagiwara Daisuke;Nunoura Takuro
通讯作者：
Nunoura Takuro

Identification of novel RNA mycoviruses from wild mushroom isolates in Japan

从日本野生蘑菇分离物中鉴定新型 RNA 真菌病毒

DOI：
10.1016/j.virusres.2023.199045
发表时间：
2023
期刊：
影响因子：
5
作者：
Zhao; Y.; T. Shirouzu; Y. Chiba; K. Hosaka; H. Moriyama; S. Urayama;D. Hagiwara
通讯作者：
D. Hagiwara

野生キノコの分離株から新たに検出できたRNAマイコウイルスの同定について

从野生蘑菇分离物中鉴定新检测到的 RNA 真菌病毒