Development of analysis method of transition state for improvement of enzymatic function

改进酶功能的过渡态分析方法的开发

基本信息

批准号：
16KT0166
负责人：
Nakamura Takashi
金额：
$ 3.08万
依托单位：
Nagahama Institute of Bio-Science and Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2016
资助国家：
日本
起止时间：
2016-07-19 至 2019-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-16KT0166/
关键词：
遷移状態エネルギー分割法 QM/MM計算ハロ酸脱ハロゲン化酵素計算精度遷移状態構造活性化エネルギー実験結果と計算結果の対応反応経路自動探索加水分解反応酵素反応遷移状態構造探索反応経路自動探索プログラム計算結果と実験結果の対応遷移状態解析量子化学計算機能改良

项目摘要

项目成果

期刊论文数量（5）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

QM/MM法によるハロ酸脱ハロゲン化酵素L-DEX YLのフルオロ酢酸分解反応の機構解析

QM/MM法分析卤酸脱卤酶L-DEX YL的氟乙酸分解反应机理

DOI：
发表时间：
2018
期刊：
影响因子：
0
作者：
中村　卓;近藤　洋隆;渡邉　博文;田中　成典
通讯作者：
田中　成典

Computational analysis of defluorination of fluoroacetic acid catalyzed by L-2-haloacid dehalogenase from Pseudomonas sp. YL

假单胞菌L-2-卤酸脱卤酶催化氟乙酸脱氟的计算分析。

DOI：
发表时间：
2016
期刊：
影响因子：
0
作者：
中村　卓;近藤　洋隆;渡邉　博文;田中　成典;中村　卓;福田　昌寛;中村　卓
通讯作者：
中村　卓

フルオロ酢酸分解活性の向上したハロ酸デハロゲナーゼ L-DEX YL 変異体の量子化学計算によるデザインと実験による検証 (2)

利用量子化学计算和实验验证设计具有改进的氟乙酸分解活性的卤代酸脱卤酶 L-DEX YL 变体 (2)

DOI：
发表时间：
2017
期刊：
影响因子：
0
作者：
中村　卓;近藤　洋隆;渡邉　博文;田中　成典;中村　卓;福田　昌寛
通讯作者：
福田　昌寛

ハロ酸デハロゲナーゼL-DEX YLの触媒する脱ハロゲン化反応の量子化学計算による反応経路特定

卤酸脱卤酶L-DEX YL催化脱卤反应的量子化学计算识别反应途径

DOI：
发表时间：
2019
期刊：
影响因子：
0
作者：
田中　悠介;中村　卓;近藤　洋隆;渡邉　博文;田中　成典
通讯作者：
田中　成典

量子化学計算による酵素反応機構解析

利用量子化学计算分析酶反应机理

DOI：
发表时间：
2018
期刊：
影响因子：
0
作者：
中村　卓;近藤　洋隆;渡邉　博文;田中　成典;中村　卓
通讯作者：
中村　卓

DOI：
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Nakamura Takashi其他文献

IA-2 抗体陽性の MODY2 の 1 例.

IA-2 抗体阳性的 MODY2 病例。

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Fujishiro Midori;Ishihara Hisamitsu;Ogawa Katsuhiko;Murase Takayo;Nakamura Takashi;Watanabe Kentaro;Sakoda Hideyuki;Ono Hiraku;Yamamotoya Takeshi;Nakatsu Yusuke;Asano Tomoichiro;Kushiyama Akifumi;西川武志,木下博之,西田周平,井手口拓弥,荒木裕大,高橋毅,荒木栄一
通讯作者：
西川武志,木下博之,西田周平,井手口拓弥,荒木裕大,高橋毅,荒木栄一

実験モデルから考えた腎病理：ポドサイト研究からの腎病理

从实验模型考虑肾脏病理学：足细胞研究的肾脏病理学

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
腎臓内科
影响因子：
0
作者：
Zhang Ying;Fukusumi Yoshiyasu;Kayaba Mutsumi;Nakamura Takashi;Sakamoto Ryusuke;Ashizawa Naoki;Kawachi Hiroshi;合山進;河内　裕
通讯作者：
河内　裕

Initiation and propagation of small fatigue crack in beta titanium alloy observed through synchrotron radiation multiscale computed tomography

同步辐射多尺度计算机断层扫描观察β钛合金细小疲劳裂纹的萌生和扩展

DOI：
10.1016/j.engfracmech.2022.108308
发表时间：
2022
期刊：
Engineering Fracture Mechanics
影响因子：
5.4
作者：
Xue Gaoge;Nakamura Takashi;Fujimura Nao;Takahashi Kosuke;Oguma Hiroyuki;Takeuchi Akihisa;Uesugi Masayuki;Uesugi Kentaro
通讯作者：
Uesugi Kentaro

Japanese Familial Cases of Frontotemporal Dementia and Parkinsonism with N279K Tau Gene Mutation

N279K Tau 基因突变导致额颞叶痴呆和帕金森病的日本家族病例

DOI：
10.1002/mdc3.13100
发表时间：
2020
期刊：
Movement Disorders Clinical Practice
影响因子：
4
作者：
Oka Yuwa;Saiki Hidemoto;Hashimoto Yasumasa;Terada Yuta;Nakamura Takashi;Ayaki Takashi;Orimo Satoshi;Matsumoto Sadayuki
通讯作者：
Matsumoto Sadayuki