Identifikation von Schlüsselgenen in der Pathogenese Myelodysplastischer Syndrome (MDS) mittels "high-density" Genomanalyse

利用高密度基因组分析鉴定骨髓增生异常综合征 (MDS) 发病机制中的关键基因

• 批准号: 50848630
• 负责人: Professor Dr. Daniel Nowak
• 金额: --
• 依托单位: III. Medizinische Klinik: Hämatologie und Internistische Onkologie
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Fellowships
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2006-12-31 至 2008-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/50848630?language=en
• 关键词: Identifikation; von; Schl; sselgenen; der

Das Myelodysplastische Syndrom (MDS) ist eine klonale Knochenmarkserkrankung, die durch eine Blutbildungsstörung gekennzeichnet ist und im Verlauf in ca. 50% der Fälle in eine Akute Myeloische Leukämie (AML) transformieren kann. Es gibt zahlreiche Hinweise dafür, dass die Entstehung eines MDS auf die Akkumulation genetischer Schäden in hämatopoetischen Zellen des Knochenmarks zurückzuführen ist. Über die Art dieser Läsionen ist bisher jedoch nur wenig bekannt. Kürzlich wurde mit der Einführung von 500K SNP mapping arrays eine sehr robuste Technologie auf der Basis von microarrays entwickelt, die erstmals eine detaillierte gesamtgenomische Analyse dieser genetischen Veränderungen erlaubt. Mit diesen microarray Chips können insgesamt 500.000 SNPs (single nucleotide polymorphisms) in genomischer DNA abgefragt werden, was einer medianen Abtastungsdichte von ca. 2500 kb entspricht, und somit kann fast jedes Gen im gesamten Genom erfasst werden. Durch die Intensitätsmessungen auf dem Chip können kleinste Verluste oder Multiplikationen genetischen Materials delektiert werden. Die Erstellung des Genotyps durch die SNP Kartierung erlaubt darüber hinaus die Feststellung von Loss of Heterozygosity (LOH) oder uniparentaler Disomie (UPD). In diesem Forschungsprojekt stehen über 250 anonymisierte Proben genomischer DNA aus Knochenmark von MDS Patienten mit entsprechender klinischer Information für die Untersuchung mit 500K Chips zur Verfügung. Durch die hochauflösende genetische Untersuchung dieser Proben sollen aberrante Gene im MDS identifiziert werden und möglicherweise neue prognostische Marker für die Erkrankung erstellt werden. Des Weiteren könnten möglicherweise ein neues Subklassifizierungssystem entwickelt und neue Zielgene für molekulare Therapien entdeckt werden.

骨髓增生异常综合征 (MDS) 是一种常见的 Knochenmarkserkrankung，是一种常见的骨髓增生异常综合征 (MDS)，它在急性骨髓性白血病 (AML) 转化中的发病率约为 50%。 500K 单核苷酸多态性基因组学 DNA 中有 500.000 个 SNP（单核苷酸多态性） abgefragt werden，是 ca. 2500 kb entspricht 中的 Abtastungsdichte，并在 gesamten Genom erfasst werden 中快速生成。 SNP 基因型的建立是杂合性丢失 (LOH) 或单亲二体 (UPD) 的表征。有关 500K 芯片的详细信息。最新的分子治疗系统子分类和新分子治疗方法。

项目成果

Molecular allelokaryotyping of T-cell prolymphocytic leukemia cells with high density single nucleotide polymorphism arrays identifies novel common genomic lesions and acquired uniparental disomy

利用高密度单核苷酸多态性阵列对 T 细胞幼淋巴细胞白血病细胞进行分子等位核型分析，鉴定出新的常见基因组病变和获得性单亲二体性

• DOI: 10.3324/haematol.2008.001347
• 发表时间: 2009
• 期刊: Haematologica
• 影响因子: 10.1
• 作者: Nowak D;Le Toriellec E;Stern MH;Kawamata N;Akagi T;Dyer MJ;Hofmann WK;Ogawa S;Koeffler HP
• 通讯作者: Koeffler HP