Development of a computational peptide-protein interaction prediction method based on their tertiary structures

基于三级结构的计算肽-蛋白质相互作用预测方法的开发

基本信息

批准号：
15K16081
负责人：
Ohue Masahito
金额：
$ 2.5万
依托单位：
Tokyo Institute of Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2015
资助国家：
日本
起止时间：
2015-04-01 至 2018-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15K16081/
关键词：
ペプチド創薬タンパク質間相互作用バイオインフォマティクス分子ドッキング標的予測カーネル法ランク学習中分子アミノ酸配列構造インフォマティクス MEGADOCK-Web ペプチド分子 MEGADOCK プロファイル中規模ペプチドアミノ酸相互作用プロファイル

项目摘要

项目成果

期刊论文数量（57）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

アミノ酸プロファイルによるタンパク質ペプチド複合体のポストドッキング解析

通过氨基酸谱对蛋白质-肽复合物进行对接后分析

DOI：
发表时间：
2015
期刊：
影响因子：
0
作者：
大上雅史;内古閑伸之，松崎由理，秋山泰
通讯作者：
内古閑伸之，松崎由理，秋山泰

タンパク質間相互作用予測統合データベースMEGADOCK-WEBの改良とクラウド計算環境との連携

蛋白质-蛋白质相互作用综合预测数据库MEGADOCK-WEB的改进及与云计算环境的协作

DOI：
发表时间：
2017
期刊：
影响因子：
0
作者：
林孝紀;山本悠生;松崎由理;大上雅史;秋山泰
通讯作者：
秋山泰

ESPRESSO: An ultrafast compound pre-screening method based on compound segmentation

ESPRESSO：一种基于复合分割的超快复合预筛选方法

DOI：
发表时间：
2016
期刊：
影响因子：
0
作者：
Keisuke Yanagisawa;Shunta Komine;Shogo D. Suzuki;Masahito Ohue;Takashi Ishida;Yutaka Akiyama
通讯作者：
Yutaka Akiyama

Human insight in drug discovery: docking pose selection in protein-ligand docking and hit-compounds selection in structure-based virtual screening

人类对药物发现的洞察：蛋白质-配体对接中的对接姿势选择和基于结构的虚拟筛选中的命中化合物选择

DOI：
发表时间：
2016
期刊：
影响因子：
0
作者：
Kazuki Yamamoto;Yoshitaka Moriwaki;Keita Oda;Masahito Ohue;Itsuo Nakane;Ryunosuke Yoshino;Hayase Hakariya;Tadaaki Mashimo;Mitsuhito Wada;Yoshifumi Fukunishi
通讯作者：
Yoshifumi Fukunishi

Prediction of Protein-Protein Interactions with MEGADOCK: Parallelization, Application, and Open Database

使用 MEGADOCK 预测蛋白质-蛋白质相互作用：并行化、应用程序和开放数据库

DOI：
发表时间：
2018
期刊：
影响因子：
0
作者：
Liu Shiyun;Murata Satoshi;Kawamata Ibuki;Masahito Ohue
通讯作者：
Masahito Ohue

DOI：
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作者：
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Ohue Masahito其他文献

Development of fragment linking method for beyond rule of five

超越五规则的片段链接方法的开发

DOI：
发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
0
作者：
Tsushima Yuki;Ohue Masahito;Akiyama Yutaka
通讯作者：
Akiyama Yutaka

Prediction of plasma protein binding for cyclic peptides by deep learning and molecular docking

通过深度学习和分子对接预测血浆蛋白与环肽的结合

DOI：
发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
0
作者：
Li Jianan;Yoshikawa Yasushi;Ohue Masahito;Akiyama Yutaka
通讯作者：
Akiyama Yutaka

A playful tool for predicting protein-protein docking

预测蛋白质-蛋白质对接的有趣工具

DOI：
10.1145/3365610.3368409
发表时间：
2019
期刊：
In Proceedings of the 18th International Conference on Mobile and Ubiquitous Multimedia (MUM 2019)
影响因子：
0
作者：
Jiang Keren;Zhang Di;Iino Tsubasa;Kimura Risa;Nakajima Tatsuo;Shimizu Kana;Ohue Masahito;Akiyama Yutaka
通讯作者：
Akiyama Yutaka

作業者の「自信」を用いたクラウドソーシングの品質制御

利用工人的“信心”进行众包质量控制

DOI：
发表时间：
2017
期刊：
影响因子：
0
作者：
Suzuki Shogo D.;Ohue Masahito;Akiyama Yutaka;小山聡
通讯作者：
小山聡

Endurance of the Temple: Revisiting the History of Kashi Vishwanath Temple and Ongoing Kashi Vishwanath Corridor Project

寺庙的坚忍：重温喀什黄金庙的历史和正在进行的喀什黄金走廊项目

DOI：
发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
0
作者：
Ito Sho;Senoo Akinobu;Nagatoishi Satoru;Ohue Masahito;Yamamoto Masaki;Tsumoto Kouhei;Wakui Naoki;Kensuke Akita;中田直樹;Mahesh Gogate
通讯作者：
Mahesh Gogate