シロイヌナズナのフェノーム解析と4000遺伝子についての破壊株の作製

拟南芥表型分析和 4000 个基因的破坏菌株的创建

• 批准号: 16011265
• 负责人: 黒森 崇
• 金额: $ 3.84万
• 依托单位: The Institute of Physical and Chemical Research
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16011265/
• 关键词: シロイヌナズナ; タグライン; フェノーム解析

1.シロイヌナズナのトランスポゾン挿入変異体の育成と発芽率の測定植物変異開発研究チームがこれまでに作製していたトランスポゾン挿入変異株の中で、遺伝子への挿入が予測されるラインを選別し、1,478ライン(合計4,768ライン)について種子50粒ずつをプレート培地に播種し、発芽率・初期育成率を測定した。これまでの結果を合計すると発芽率については、4,215ライン(88%)が80%以上の発芽率を示したのに対し、212ライン(4.4%)については発芽率70%未満であり、発芽に影響のある遺伝子変異体の候補と考えられた。育成率については110ライン(2.3%)が50%未満の育成率を示し、これらの変異体は致死表現型の候補と考えられた。2.シロイヌナズナの形態観察による表現型データの記録プレートで約3週間育成の後、各ライン8個体ずつを土に植え換え植物体を育て、形態に異常の観察されるラインについてデジタル画像によって記録を取った。これまでに行った植物体地上部の観察で比較的はっきりした表現型を示したのは265ライン(5.5%)だった。その中には、植物体の矮性・アルビノ形質・植物体の色が薄い・遅咲き・葉の形態異常・茎の形態異常・花の形態異常・さやの形態異常など様々な表現型が含まれていた。3.シロイヌナズナの遺伝子破壊系統の選別と各種スクリーニング上記表現型解析の過程で、647ライン(合計1,965ライン)はトランスポゾンがホモに挿入されており、遺伝子破壊株系統になっていると予測された。それらの植物個体から種子回収を行い、地上部観察では見ることのできなかった根・根毛・胚軸・トライコームの定量的表現型スクリーニングと、環境ストレス条件下での耐性変異体のスクリーニングを始めた。

1.拟南芥转座子插入突变体的培养和发芽率的测量在植物突变开发研究小组迄今为止创建的转座子插入突变体中，我们选择了预测具有插入基因的品系（4,768个品系）。总计），将50粒种子播种在平板培养基上，并测量发芽率和初始生长率。结合迄今为止的结果，4,215个品系（88%）的发芽率达到80%或更高，而212个品系（4.4%）的发芽率低于70%，表明发芽速度较慢，被认为是候选品系。寻找有影响力的遗传变异。在育种率方面，有110个品系（2.3%）的育种率低于50%，这些突变体被认为是致死表型的候选突变体。 2.通过观察拟南芥的形态记录表型数据在平板上生长约3周后，将每个品系8个个体​​移植到土壤中，使植物生长，并使用数字图像记录形态异常的品系。 。迄今为止对植物地上部分的观察表明，有265个品系（5.5%）表现出相对清晰的表型。这些包括各种表型，例如植物矮化、白化性状、植物颜色苍白、开花晚、叶形态异常、茎形态异常、花形态异常和豆荚形态异常。 3.拟南芥基因破坏品系的选择和各种筛选在上述表型分析中，预测647个品系(总共1,965个品系)具有纯合转座子插入并且是基因破坏品系。从这些单株植物中收集种子，对地上观察中看不到的根、根毛、下胚轴和毛状体进行定量表型筛选，并筛选环境胁迫条件下的抗性突变体。 。

项目成果

The HALTED ROOT (HLR) gene encoding the 26S proteasome subunit RPT2a is essential for the maintenance of Arabidopsis meristems.

编码 26S 蛋白酶体亚基 RPT2a 的 HALTED ROOT (HLR) 基因对于拟南芥分生组织的维持至关重要。

• 发表时间: 2004
• 期刊: Development 131
• 作者: Susumu Mochizuki;Minako Ueda
• 通讯作者: Minako Ueda

Quantitative trait loci analysis of nitrate storage in Arabidopsis leading to an investigation of the contribution of the anion channel gene, AtGLC-c, to variation

拟南芥硝酸盐储存的数量性状位点分析导致研究阴离子通道基因 AtGLC-c 对变异的贡献

• 发表时间: 2004
• 期刊: Journal of Experimental Botany 55
• 作者: Kiyosawa H.;Mise N.;Iwase S.;Hayashizaki H.;Abe K.;Sakurai T;Takei K;Harada H
• 通讯作者: Harada H

AtJPT3 is a key determinant of nitrate-dependent cytokinin biosynthesis in Arabidopsis.

AtJPT3 是拟南芥中硝酸盐依赖性细胞分裂素生物合成的关键决定因素。

• 发表时间: 2004
• 期刊: Plant and Cell physiology 45
• 作者: Kiyosawa H.;Mise N.;Iwase S.;Hayashizaki H.;Abe K.;Sakurai T;Takei K
• 通讯作者: Takei K

LARGE : a large-scale database of RIKEN Arabidopsis resources ranging from transcriptome to phenome.

LARGE：从转录组到表型组的 RIKEN 拟南芥资源的大型数据库。

• 发表时间: 2005
• 期刊: Nucleic Acids Research 33
• 作者: Kiyosawa H.;Mise N.;Iwase S.;Hayashizaki H.;Abe K.;Sakurai T
• 通讯作者: Sakurai T