Elucidation of the molecular mechanism of the malignant transformation by epigenetic alteration
通过表观遗传改变阐明恶性转化的分子机制
基本信息
- 批准号:22H02907
- 负责人:
- 金额:$ 11.07万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
- 财政年份:2022
- 资助国家:日本
- 起止时间:2022-04-01 至 2025-03-31
- 项目状态:未结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
本研究では、申請者が見出した炎症性遺伝子群(SASP遺伝子群)の発現誘導の引き金となる特徴的なエピゲノム修飾と染色体構造が、がんの悪性化へ与える影響を明らかにすることを目的として、細胞老化を誘導する前後の間質の細胞と、乳がん細胞を用いてエピゲノム解析を行った。DNA-FISH解析とATACシークエンス解析の結果から、老化間質細胞と一部の乳がん細胞では共通して特徴的な染色体構造変化の表現型を検出できた。そこで、乳がん患者検体を用いて全クロマチン領域の活性化・不活性化状態をsingle cell ATACシークエンス法によって解析することで、エピゲノム情報から炎症性遺伝子群の発現を予測できるかどうか検討をおこなった。さらに、同一患者検体を用いたDNA-FISH解析も行い、scATACシークエンスとの結果の比較検討を行った。また、乳がん細胞だけでなく患者のがん微小環境に存在する間質の細胞(CAFs、血管内皮細胞、免疫細胞)においても、エピゲノム解析を行った。
本研究的目的是阐明申请人发现的引发炎症基因组(SASP基因组)表达诱导的特征性表观基因组修饰和染色体结构对癌症恶性转化的影响。诱导细胞衰老前后的间质细胞和乳腺癌细胞。根据DNA-FISH分析和ATAC序列分析的结果,我们能够检测到衰老基质细胞和一些乳腺癌细胞中共同的特征性染色体结构变化表型。因此,我们研究了是否可以通过使用乳腺癌患者样本的单细胞 ATAC 测序分析所有染色质区域的激活和失活状态,从表观基因组信息预测炎症基因的表达。此外,我们还使用同一患者标本进行了 DNA-FISH 分析,并将结果与 scATAC 测序进行了比较。此外,不仅对乳腺癌细胞进行了表观基因组分析,还对患者癌症微环境中存在的基质细胞(CAF、血管内皮细胞和免疫细胞)进行了表观基因组分析。
项目成果
期刊论文数量(13)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
老化細胞におけるエピゲノム変化が炎症性SASP遺伝子を誘導する
衰老细胞的表观基因组变化诱导炎症 SASP 基因
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:碇 直樹;荒川 博文;高橋暁子
- 通讯作者:高橋暁子
細胞老化研究で疾患のメカニズム解明に挑む
通过细胞衰老研究阐明疾病机制
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Wu Z;Yoshikawa T;Inoue S;Ito Y;Kasuya H;Nakashima T;Zhang H;Kotaka S;Hosoda W;Suzuki S;Kagoya Y.;加藤千賀,新谷直樹,貞任大地,平間千津子,近藤花織,貞賀泰孝,酒井知史,神原康弘,熱田雄也,小沼亮介,島袋将志,神宮司淳史,細田 譲,厚井聡志,尾内大志,濱村貴史,遠矢 嵩,清水啓明,名島悠峰,小林 武,原口京子,奥山美樹,原田浩徳,原田結花,土岐典子;高橋暁子
- 通讯作者:高橋暁子
老化細胞による炎症惹起メカニズム
衰老细胞诱发炎症的机制
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Toshiaki Yoshikawa;Zhiwen Wu;Satoshi Inoue;Hitomi Kasuya;Hirokazu Matsushita;Yusuke Takahashi;Hiroaki Kuroda;Waki Hosoda;Shiro Suzuki;Yuki Kagoya;高橋暁子
- 通讯作者:高橋暁子
Tumorigenic roles of senescent cells in the cancer microenvironment
癌症微环境中衰老细胞的致瘤作用
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
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- 通讯作者:Akiko Takahashi
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