亜集団に発現するesp遺伝子群が担う新たな細菌特性の解明

阐明亚群中表达的 esp 基因所发挥的新细菌特征

基本信息

批准号：
22H02863
负责人：
森川一也
金额：
$ 10.98万
依托单位：
University of Tsukuba
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2026-03-31
项目状态：
未结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22H02863/
关键词：
黄色ブドウ球菌 esp 不均一性限定的発現遺伝子

项目摘要

申請者らは数%以下の亜集団に発現するブドウ球菌遺伝子を見出し、限定的発現遺伝子esp (expression in minor subpopulation)と名付けた。しかし幾つかのespを除いて多くのesp遺伝子の役割は不明であり、このことは集団多様性に基づく未知のシステムが多数存在することを示唆している。本研究は、これら機能未知esp遺伝子群が担う役割を「espと同時に発現する遺伝子セット」という新たな視点から解明することを目的としており、当該年度は以下を行った。・先行して研究が進んでいるesp15（自然形質転換における遺伝子取り込み装置関連の遺伝子）と同時に発現する遺伝子セットを明らかにしているが、その中に２種類の機能未知遺伝子が含まれてる。これら機能未知遺伝子群の破壊株を作成して、自然形質転換に影響するかどうかを検討したところ、これらは形質転換に必須ではないが効率に影響するという結果を得た。・espの一つで、転写抑制因子と予想されている遺伝子について検討を進めた。本遺伝子は通常培養条件では数パーセント以下の発現であるが、様々な培養条件を検討したところ、特定条件でほぼ全ての細胞で発現する条件が見出された。この条件に関連する機能について、検討を開始した。・幾つかのesp遺伝子について、レポータ強度の最適化を進めた。

申请人发现在少数百分之几的亚群中表达的葡萄球菌基因，并命名为有限的表达基因ESP（在次要亚群中的表达）。但是，除某些ESP外，许多ESP基因的作用尚不清楚，这表明基于人口多样性有许多未知系统。这项研究旨在从新的角度阐明这些未知的ESP基因组扮演的角色：“一组与ESP同时表达的基因”，在今年，进行了以下内容。 - 已经揭示了与ESP15同时表达的基因（与自然转化中的基因摄取器件有关的基因），这些基因已经进行了研究，并且已经揭示了两种类型的未知功能基因。当我们创建了这些未知功能基因组的破坏菌株并检查它们是否影响自然转化时，我们发现它们对于转化不是必不可少的，而是影响效率。 - 我们已经研究了预测将是转录阻遏物为ESP的基因。该基因在正常培养条件下以几个或更少的百分比表示，但是在检查各种培养条件时，在特定条件下几乎在所有细胞中都表达了条件。我们已经开始考虑与这种情况有关的功能。 - 针对多个ESP基因优化了记者强度。