抵抗性関連候補遺伝子マーカー群を用いた国内抵抗性クロマツ集団の遺伝子多様性の解明

利用抗性相关候选基因标记阐明国内抗性日本黑松种群的遗传多样性

• 批准号: 22H02397
• 负责人: 岩泉 正和
• 金额: $ 10.82万
• 依托单位: Forest Research and Management Organization
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22H02397/
• 关键词: クロマツ; マツノザイセンチュウ抵抗性育種; 遺伝子多様性; 抵抗性候補関連遺伝子群; 一塩基多型（SNP）; Amplicon-Sequence; 次世代育種; マツノザイセンチュウ抵抗性; 遺伝的多様性

【概要】抵抗性集団と非抵抗性集団について、クロマツとアカマツをあわせて、従来の中立遺伝マーカーによる遺伝的多様性の評価を進めたとともに、クロマツについてはSNPジェノタイピングシステムの構築を進めた。【具体的内容】抵抗性集団と非抵抗性集団（精英樹・野外集団）における、従来の中立遺伝マーカーによる遺伝的多様性を把握するため、主に東北・関西・九州の各育種基本区において未タイピングの抵抗性・精英樹クロマツ・アカマツについてジェノタイピングを行い、系統整理を進めた。過去の野外集団の研究で利用されたクロマツ・アカマツの核SSRマーカー（それぞれ7マーカー・8マーカー）に基づき、既に遺伝子型評価された抵抗性集団と野外集団のSSR遺伝子型を整理するとともに、系統整理された抵抗性・精英樹集団についてはレファレンスDNAを用いてSSR遺伝子型を決定した。令和4年度末までに、関東育種基本区の抵抗性・精英樹アカマツ以外についてはひととおり、クロマツ・アカマツの両樹種において全国の抵抗性・精英樹・野外集団の3者のSSR遺伝子型を取得した。またクロマツについて、抵抗性関連候補遺伝子座群に基づくゲノムワイドDNAマーカー（SNP）を用いて予備的分析を行い、ゲノムワイドSNP分析（Amplicon-Sequence）実施のためのマーカーセットとジェノタイピングシステムの構築を進めた。既にレファレンス針葉サンプルのある抵抗性・野外集団クロマツについては、上記分析システムに供試する高収量DNAの抽出と精製を進めた。また、近く得られる大量SNPジェノタイプデータと上記マツ群における利用上の繁殖形質・特性との関連性を評価するため、全国の育種場で保存されている抵抗性・精英樹クロマツのうち約100系統から球果を採取して、球果サイズや鱗片形態、種子サイズ等の球果諸形質データを得た。

[摘要]在耐药和非耐药组中，我们还开始使用常规的中性遗传标记（包括黑松木和黑松树）来评估遗传多样性，并为黑松树建立SNP基因分型系统。 [特定含量]为了了解耐药和非耐药组中常规中性遗传标记（海叶树和室外群）引起的遗传多样性，在抗抗抗抑素的，kyushu和kyushu的基本繁殖区域中，对抗抗抑郁，黑色的松树和红色的松树进行了基因分型，并进行了系统的重组。基于在先前的现场人群研究中使用的黑松和红松的核SSR标记（分别为7和8标记），使用参考DNA确定了已经基因分型的抗性和室外种群的SSR基因型，并用于基因型基因型的SSR基因型。到2022财政年度末，获得了三种耐药，新鲜的松树的所有SSR基因型，包括坎托基本繁殖区的耐药，新鲜的松树，包括耐药的新鲜的松树和室外群。此外，使用基于抗性相关的候选基因座的基因组DNA标记（SNP）对发色酚进行初步分析，并构建标记物集和用于全基因组SNP SNP分析（Amplicon-Squerence）的基因分型系统。对于已经有参考针样样品的耐药性，室外种群松树，用于上面的分析系统进行高收益DNA的提取和纯化。此外，为了评估在近乎吸收的松树组中获得的大量SNP基因型数据与上述松树组中使用的繁殖特征和特征之间的关系，从大约100棵抗性和肥沃的松树中收集了锥体，这些蛋白是在全国范围内保存的大约100棵抗性和肥沃的松树，以及全国各地的繁殖地点，以及锥形性状数据，例如锥尺寸大小，尺寸尺寸，尺寸尺寸，尺度质量，种子的种子和种子的种子和种子的种子，均可及。

项目成果

血縁関係のある系統を含む採種園における植栽配置の設計支援プログラムの開発

制定一项计划，支持种子园种植安排的设计，其中包括相关品系

• 发表时间: 2022
• 作者: 岩泉正和・三浦真弘・片桐智之・吉岡寿・大池航史・杉本博之;松永孝治・武津英太郎・井城泰一・平尾知士・岩泉正和・大平峰子・山野邉太郎・木村恵・高島有哉・三浦真弘・福田有樹・倉原雄二・久保田正裕・高橋誠
• 通讯作者: 松永孝治・武津英太郎・井城泰一・平尾知士・岩泉正和・大平峰子・山野邉太郎・木村恵・高島有哉・三浦真弘・福田有樹・倉原雄二・久保田正裕・高橋誠

マツノザイセンチュウ抵抗性アカマツ6採種園産種苗の抵抗性に対する母樹系統と園齢に伴う花粉親の効果

不同母树谱系和园龄花粉亲本对种子园抗线虫红松6号幼苗抗性的影响

• 发表时间: 2022
• 期刊: 日本森林学会誌
• 作者: 岩泉正和・三浦真弘・片桐智之・吉岡寿・大池航史・杉本博之