Importance of introgressive hybridization in the evolution, ecology, and conservation of Southeast Asian rainforest trees

渐渗杂交在东南亚雨林树木的进化、生态和保护中的重要性

• 批准号: 22H02388
• 负责人: 伊東 明
• 金额: $ 10.98万
• 依托单位: Osaka Metropolitan University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2026-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22H02388/
• 关键词: 熱帯雨林; 浸透交雑; ボルネオ; 進化; MIGseq; ddRADseq; ボルネオ島; 種間交雑; 生物多様性; 熱帯林保全

2022年度は、以下の内容を実施した。1) サラワク州に生育する種全体の系統関係と過去の交雑の推定：Santubong国立公園の低地フタバガキ林とケランガス林の移行帯に生育する100科543種から柵葉標本とDNA用の葉サンプルを採取した。特にケランガス林に特異的に生育するフタバガキ科２種とアカネ科数種（未同定）については複数個体からDNA用サンプルを採取した。また、予備解析に用いたLambir 国立公園のフトモモ科Syzigium属のddRADseqデータを使って、より詳細な交雑解析を進めた。特にstacksによるSNPs抽出方法の最適化と交雑解析ソフトDsuiteによるPatterson's Dとf4-ratioを用いた交雑解析を行い、交雑解析方法の確立を進めた。2) 同所的に見られる複数の個体群の個体間での最近の交雑の推定：Santubong国立公園とLambir国立公園の２か所に生育するフタバガキ科２種とアカネ科Ixora属の各種2～13個体から柵葉標本とDNA用の葉サンプルを採取した。Lambir国立公園のIxora属５種について、DNAを抽出し、葉緑体DNA３領域（rbcL、matK、trnH-psbA）とMIGseqで得た塩基配列から系統解析と交雑解析を行い、種間交雑を支持する結果が得られた。また、既存のIxora属のSSRマーカ24セットについて予備実験を行い、調査地の種に有効な8セットのSSRマーカを選んだ。さらに、Lambir国立公園に生育するウツボカズラ科Nepenthes属４種と雑種と思われる個体についてMIGseqデータを用いた交雑解析を行い、F1と推定される雑種個体を確認した。3) 天然林と二次林での最近の種間交雑頻度の比較：サラワク州の二次林に設置された調査区の種組成データを入手し、天然林と二次林の両方に生育している種をリストアップした。

2022年度实施了以下内容。 1）对砂拉越生长的所有物种的系统发育关系和过去杂交的估计：从生长在山都望国家公园的低地龙脑香科植物森林和Kerangas森林之间的过渡带的100个科的543个物种中收集了栅栏叶标本和DNA叶样本。 。特别是，DNA 样本是从两种龙脑香科和几种茜草科（身份不明）的多个个体中采集的，这些物种专门生长在 Kerangas 森林中。此外，我们使用来自兰比尔国家公园的桃金娘科、丁香属的ddRADseq数据进行了更详细的杂交分析，该数据用于初步分析。特别是，我们使用stacks优化了SNP提取方法，并使用交叉分析软件Dsuite使用Patterson的D和f4-ratio进行交叉分析，并继续建立混合分析方法。 2) 多个同域种群个体之间近期杂交的估计：两种龙脑香科物种和两种茜草科龙船属物种，生长在两个地点：山都望国家公园和兰比尔国家公园叶子标本和 DNA 叶子样本。收集自 13 个人。提取兰比尔国家公园龙船属5种植物的DNA，根据叶绿体DNA的3个区域（rbcL、matK、trnH-psbA）和MIGseq得到的碱基序列进行系统发育分析和杂交分析，支持种间杂交得到了结果。此外，我们对龙船花属现有的24组SSR标记进行了初步实验，筛选出8组对研究区该物种有效的SSR标记。此外，我们使用 MIGseq 数据对被认为与生长在兰比尔国家公园的猪笼草科中的四种猪笼草杂交的个体进行了杂交分析，并确认了推测为 F1 的杂交个体。 3）天然林和次生林近期种间杂交频率的比较：从砂拉越次生林建立的调查样地获得物种组成数据，我们列出了存在的物种。

项目成果

Morphological and molecular evidence of natural interspecific hybridization between Dyera polyphylla and D. costulata in Sumatra and Kalimantan

苏门答腊岛和加里曼丹岛重叶植物与多叶植物自然种间杂交的形态学和分子证据

• 发表时间: 2022
• 作者: Aulianisa EN;Siregar UJ;Siregar IZ;Hamzah H;Ogasahara M;Kamiya K
• 通讯作者: Kamiya K

サラワク森林局(マレーシア)

砂拉越林业局（马来西亚）

ボルネオ熱帯雨林樹木におけるニッチ分割とその進化的プロセス

婆罗洲雨林树木的生态位划分及其进化过程

• 发表时间: 2023
• 作者: 奥野聖也;殷亭亭;名波哲;上谷浩一;松山周平;Sylvester TAN;Mohizah Bt. MOHAMAD;山倉拓夫;伊東明
• 通讯作者: 伊東明

Genetic structure and population history of a peat swamp forest tree species, Shorea albida (Dipterocarpaceae), in Brunei Darussalam

文莱达鲁萨兰国泥炭沼泽森林树种 Shorea albida（龙脑香科）的遗传结构和种群历史

• 发表时间: 2023
• 期刊: Genes & Genetic Systems
• 影响因子: 1.1
• 作者: Ogasahara M;Cobb AR;Sukri RS;Metali F;Kamiya K
• 通讯作者: Kamiya K

Leaf morphological traits of nine major tropical trees of Shorea species (Dipterocarpaceae)

龙脑香科九种主要热带乔木的叶片形态特征

• DOI: 10.13057/biodiv/d240344
• 发表时间: 2023
• 期刊: Biodiversitas Journal of Biological Diversity
• 作者: MUFARHATUN NUR;SUSILOWATI ARIDA;HILWAN IWAN;ARROFAHA NAWWALL;YULITA KUSUMADEWI SRI;DWIYANTI FIFI GUS;HIDAYAT ASEP;KAMIYA KOICHI;RACHMAT HENTI HENDALASTUTI
• 通讯作者: RACHMAT HENTI HENDALASTUTI