Establishment of methods for prediction of the function of functionally-unknown gene products by the analysis of the posttranslational protein modifications.

建立通过分析翻译后蛋白质修饰来预测功能未知的基因产物的功能的方法。

基本信息

批准号：
15580080
负责人：
UTSUMI Toshihiko
金额：
$ 2.5万
依托单位：
Yamaguchi University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2003
资助国家：
日本
起止时间：
2003 至 2004
项目状态：
已结题

项目摘要

Upon the completion of the Human Genome Project, huge numbers of genetic sequences are now available. However, the function of many of these genes has not been identified. Therefore, the identification of the function of these genes is one of the most important purposes of the study of Proteomics.Now, it is well known that many of the posttranslational modifications such as proteolytic processing, phosphorylation, glycosylation, lipid modifications, ADP-ribosylation etc. play critical roles in the structure and function of protein and regulate many cellular events such as intracellular signal transduction. However, systematic method to analyze the posttranslational modification of protein has not been established.In the present study, we have shown that targeting, processing and modification of a distinct protein could be successfully detected by using metabolic labeling in an in vitro translation system or in transfected cells. Since many of these posttranslational modifications play specific roles in the structure and function of protein, it might be possible to predict the function of the protein from these experimental observations.

人类基因组计划完成后，现在可以获得大量基因序列。然而，其中许多基因的功能尚未确定。因此，鉴定这些基因的功能是蛋白质组学研究最重要的目的之一。现在，众所周知，许多翻译后修饰，如蛋白水解加工、磷酸化、糖基化、脂质修饰、ADP-核糖基化等在蛋白质的结构和功能中发挥着关键作用，并调节细胞内信号转导等许多细胞事件。然而，尚未建立分析蛋白质翻译后修饰的系统方法。在本研究中，我们表明，通过在体外翻译系统或在体外翻译系统中使用代谢标记，可以成功检测不同蛋白质的靶向、加工和修饰。转染的细胞。由于许多翻译后修饰在蛋白质的结构和功能中发挥特定作用，因此可以从这些实验观察中预测蛋白质的功能。

项目成果

期刊论文数量（48）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Utsumi, T. et al.: "Vertical-scanning mutagenesis of amino acids in a model N-myristoylation motif reveals the major amino-terminal sequence requirements for protein N-myristoylation"Eur.J.Biochem.. 271. 863-874 (2004)

Utsumi, T. 等人：“模型 N-肉豆蔻酰化基序中氨基酸的垂直扫描诱变揭示了蛋白质 N-肉豆蔻酰化的主要氨基末端序列要求”Eur.J.Biochem.. 271. 863-874（

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

内海俊彦: "「膜局在性のタンパク質工学的改変による生理活性タンパク質の機能変換」タンパク質工学"医学書院. 165-204 (2003)

Toshihiko Utsumi：“通过膜定位蛋白质工程修饰实现生理活性蛋白质的功能转换”蛋白质工程，Igaku Shoin 165-204（2003）。

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

N-ミリストイル化によるタンパク質の膜局在化と機能調節

N-肉豆蔻酰化对蛋白质的膜定位和功能调节

DOI：
发表时间：
2004
期刊：
実験医学 22
影响因子：
0
作者：
Utsumi;T. et al.;内海俊彦
通讯作者：
内海俊彦

Kanno, T. et al.: "Oxidative stress underlies the mechanism for Ca^<2+>-induced permeability transition of mitochondria"Free Rad. Res.. 38. 27-35 (2004)

Kanno，T.等人：“氧化应激是Ca^2诱导的线粒体通透性转变机制的基础”Free Rad。

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

Mechanism of enhanced apoptosis in HL-60 cells by UV-irradiated n-3 and n-6 polyunsaturated fatty acids.

紫外线照射的 n-3 和 n-6 多不饱和脂肪酸增强 HL-60 细胞凋亡的机制。

DOI：
发表时间：
2003
期刊：
Free Radic.Biol.Med. 35
影响因子：
0
作者：
Arita;K.;Yamamoto;Y.;Takehara;Y.;Utsumi;T.;Kanno;T.;Miyaguchi;C.;Akiyama;J.;Yoshioka;T.;Utsumi;K.
通讯作者：
K.