The role of the SUMO pathway in regulation of the nuclear function.

SUMO 途径在核功能调节中的作用。

基本信息

  • 批准号:
    15510164
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.5万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 财政年份:
    2003
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2003 至 2004
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

1)We developed a binary vector system that introduces a synthetic SUMO-1 conjugation pathway into Escherichia coli and demonstrated that large amounts of sumoylated Ran GTPase activating protein 1 C-terminal region(RanGAP1-C2), Ran binding protein 2 internal repeat domain, p53 and promyelocytic leukemia were efficiently produced. The sumoylated recombinant RanGAP1-C2 appeared to retain the in vivo properties, since it was specifically sumoylated at lysine 517 as expected from in vivo studies. Our findings indicate the establishment of a biosynthetic route for producing large amounts of sumoylated recombinant proteins that will open up new avenues for studying the biochemical and structural aspects of the SUMO-1 modification pathway.(see FEBS Lett.564,85-90,2004 and Anal.Biochem.331,204-206,2004)2)We show that RanBP2's 30-kDa catalytic fragment is a largely unstructured protein. Despite two distinct but partially overlapping 79-residue catalytic domains, one of which is sufficient for maximal activity, RanBP2 binds to Ubc9 in a 1:1 stoichiometry. The identification of nine RanBP2 and three Ubc9 side chains that are important for RanBP2-dependent SUMOylation indicates largely hydrophobic interactions. These properties distinguish RanBP2 from all other known E3 ligases, and we speculate that RanBP2 exerts its catalytic effect by altering Ubc9's properties rather than by mediating target interactions.(see Nat.Struct.Mol.Biol.11,984-989,2004)
1)我们开发了一个二进制矢量系统,该系统将合成的SUMO-1结合途径引入大肠杆菌中,并证明大量的sumoyated Ran ran ran gtpase激活蛋白1 c末端区域(rangap1-c2),ran ran ran ran ran ran结合蛋白2内部重复结构域,p53,p53和promyElocycytic prodignity wayeremia waysemia waysemia。 sumoy的重组rangap1-c2似乎保留了体内特性,因为它是在体内研究中所预期的,在赖氨酸517处得到了特异性sumoyly。我们的发现表明,建立了一种生物合成途径,用于生产大量的Sumoymet重组蛋白,该蛋白将为SUMO-1修改途径的生化和结构方面开放新的途径。 RANBP2的30 kDa催化片段是一种非结构化的蛋白质。尽管有两个不同但部分重叠的79个残留催化域,其中一个足以达到最大活性,但RANBP2在1:1的化学计量学中与UBC9结合。鉴定9个RANBP2和三个UBC9侧链对RANBP2依赖性Sumoylation很重要,这在很大程度上表明了疏水相互作用。这些特性将RANBP2与所有其他已知的E3连接酶区分开来,我们推测RANBP2通过改变UBC9的性质而不是通过介导目标相互作用来发挥其催化作用(请参阅Nat.Struct.Mol.BIOL.11,11,984-989,2004))

项目成果

期刊论文数量(52)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Y.Uchimura: "Overproduction of Eukaryotic SUMO-1- and SUMO-2-conjugated Proteins in Escherichia coli"Anal.Biochem.. (in press). (2004)
Y.Uchimura:“大肠杆菌中真核 SUMO-1 和 SUMO-2 缀合蛋白的过量生产”Anal.Biochem..(出版中)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
SUMO meets ubiquitin.
SUMO 遇上泛素。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2004
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Kumamoto K;Hirai T;Kishioka S;Iwahashi H;Y.Uchimura;斉藤寿仁
  • 通讯作者:
    斉藤寿仁
Sumoylation : Molecular Biology and Biochemistry Chanter 6: (Edited by V.G.Wilson)
Sumoylation : 分子生物学和生物化学 Chanter 6: (V.G.Wilson 编辑)
  • DOI:
  • 发表时间:
    2004
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Isik;S.;Sano;K;Seki;M.;Enomoto;T.;Saitoh;H.;Tsutsui;K.;Tsutsui;K.;H.Saitoh;H.Saitoh
  • 通讯作者:
    H.Saitoh
H.Saitoh: "Sumoylation, molecular biology and biochemistry. Chapter 6: Unraveling the SUMO-2/3 conjugation and de-conjugation pathways(V.G.Wilson(Ed))"Horizon Bioscience, Norfolk, U.K.. 33(175-208) (2004)
H.Saitoh:“Sumoylation、分子生物学和生物化学。第 6 章:解开 SUMO-2/3 缀合和解缀合途径(V.G.Wilson(编辑))”Horizo​​n Bioscience,诺福克,英国。33(175-208)(
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
S.Isik: "The SUMO pathway is required for selective degradation of DNA topoisomerase IIb induced by a catalytic inhibitor ICRF-193"FEBS Lett.. 546. 347-378 (2003)
S.Isik:“催化抑制剂 ICRF-193 诱导的 DNA 拓扑异构酶 IIb 的选择性降解需要 SUMO 途径”FEBS Lett.. 546. 347-378 (2003)
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