Plastid genome evolution in serial secondary plastids of a green-colord dinoflagellate

绿色甲藻连续次级质体的质体基因组进化

• 批准号: 24870004
• 负责人: KAMIKAWA Ryoma
• 金额: $ 1万
• 依托单位: University of Tsukuba
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-24870004/
• 关键词: 葉緑体; ゲノム; 進化; 細胞内共生; 葉緑体置換; ゲノム進化; 分子系統解析

In this study, in order to retrace origin and evolution of plastids in the green colored dinoflagellate Lepidodinium, its plastid genome was sequenced. Nearly complete sequence of the plastid genome was obtained by the next generation sequencing analysis. Phylogenetic analysis with a large plastid gene dataset and comparative genomics revealed that the Lepidodinium plastids are derived from a green alga closely related to Pedinophyceae and drastic genome rearrangement has been occurred after the plastid acquisition.

在这项研究中，为了追溯绿色甲藻鳞甲藻质体的起源和进化，对其质体基因组进行了测序。通过下一代测序分析获得了几乎完整的质体基因组序列。利用大型质体基因数据集和比较基因组学进行的系统发育分析表明，鳞甲藻质体源自与片藻纲密切相关的绿藻，并且在获得质体后发生了剧烈的基因组重排。

项目成果

Searching for missing pieces in natural environments: With the emphasis on the importance of culture strains of enigmatic eukaryotes for global eukaryotic phylogeny.

寻找自然环境中缺失的片段：强调神秘真核生物培养株对于全球真核系统发育的重要性。

• 发表时间: 2012
• 作者: Kamikawa R;Yabuki A;Hashimoto T;Nishimura Y;Inagaki Y
• 通讯作者: Inagaki Y

Monitoring harmful microalgae by using a molecular biological techneque.

使用分子生物学技术监测有害微藻。

• DOI: 10.5772/34251
• 发表时间: 2012
• 期刊: Food Quality
• 作者: Shiraishi T;Kamikawa R;Sako Y;Imai I.
• 通讯作者: Imai I.

Mitohondrial evolution: from genomes to metabolisms

线粒体进化：从基因组到新陈代谢

• 发表时间: 2012
• 作者: 神川龍馬、Kolisko M;Andersson JO;Simpson AGB、Roger AJ;稲垣祐司、橋本哲男;神川龍馬
• 通讯作者: 神川龍馬

真核生物における翻訳伸長因子EF-1alphaとEFLを両有するゲノムの分布

真核生物中含有翻译延伸因子 EF-1α 和 EFL 的基因组分布

• 发表时间: 2012
• 作者: 神川 龍馬;西村 祐貴;左子 芳彦;橋本哲男;稲垣 祐司
• 通讯作者: 稲垣 祐司

ミトコンドリアにおける機能縮退進化

线粒体的功能简并进化

• 发表时间: 2012
• 作者: 神川 龍馬;Kolisko M;Andersson J;Simpson AGB;Roger AJ;稲垣 祐司;橋本 哲男;神川龍馬. 断捨離
• 通讯作者: 神川龍馬. 断捨離