転移性去勢感受性前立腺癌の分子生物学的解析に基づくプレシジョン医療の実現

基于转移性去势敏感前列腺癌分子生物学分析实现精准医疗

基本信息

批准号：
22K20789
负责人：
住吉崇幸
金额：
$ 1.83万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-08-31 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究に登録されたmHSPC患者203例から採取した生検組織のうち、57サンプルからDNAを、34サンプルからRNAを抽出した。DNA収量は平均2.6ugで、全サンプルがエクソンシーケンスに求められるクオリティ（DIN≧7）を満たしていた。現在34サンプルまで変異またはコピー数の解析を行い、変異は主にSPOP（n=7）、FOXA1（n=4）、CDK12（n=3）などに認められ、コピー数異常もNKX3-1やRB1の欠失、MYC増幅など、前立腺癌の特徴を現わしていた。MSH2のコピー数が著明に低下していたサンプルでは約1000個の変異が認められ、ミスマッチ修復遺伝子異常の特徴を示していた。RNAシーケンスは約90%のサンプル（34サンプル中31サンプル）で問題なく施行することができた。遺伝子発現のパターンが3 種類に分類され、そのうち1つのグループは他2つのグループと比べてアンドロゲン依存性が低く、生存期間が不良な傾向を示した。本研究で収集したほとんどの生検組織でゲノムおよびトランスクリプトーム解析を施行することが示された。

在从参与本研究的 203 名 mHSPC 患者收集的活检组织中，从 57 个样本中提取了 DNA，从 34 个样本中提取了 RNA。平均DNA产量为2.6ug，所有样品均满足外显子测序要求的质量（DIN≥7）。目前已对34个样本进行了突变或拷贝数分析，突变主要发现于SPOP（n=7）、FOXA1（n=4）和CDK12（n=3），NKX3也发现拷贝数异常-1和It表现出前列腺癌的特征，包括RB1缺失和MYC扩增。样本中观察到约1000个突变，其中MSH2的拷贝数显着减少，表明错配修复基因异常的特征。约 90% 的样本（34 个样本中的 31 个）成功进行了 RNA 测序。基因表达模式分为三种类型，其中一组表现出对雄激素依赖性较低的趋势，并且比其他两组的生存时间更短。本研究中收集的大多数活检组织均进行了基因组和转录组分析。

项目成果

期刊论文数量（1）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

The feasibility of molecular profiling of prostate tissue samples obtained from patients with metastatic castration-resistant prostate cancer

对从转移性去势抵抗性前列腺癌患者获得的前列腺组织样本进行分子分析的可行性

DOI：
发表时间：
2023
期刊：
影响因子：
0
作者：
Naoki Oike;Ryota Shirai;Taylor Gillis;Deandra Walker;Avery Bodlak;Timothy Porfilio;Michael Verneris;Masanori Hayashi;住吉崇幸
通讯作者：
住吉崇幸