転移性去勢感受性前立腺癌の分子生物学的解析に基づくプレシジョン医療の実現

基于转移性去势敏感前列腺癌分子生物学分析实现精准医疗

• 批准号: 22K20789
• 负责人: 住吉 崇幸
• 金额: $ 1.83万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-08-31 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K20789/
• 关键词: ゲノム解析; トランプスクリプトーム解析; ホルモン感受性前立腺癌; 前立腺癌; プレシジョン医療

本研究に登録されたmHSPC患者203例から採取した生検組織のうち、57サンプルからDNAを、34サンプルからRNAを抽出した。DNA収量は平均2.6ugで、全サンプルがエクソンシーケンスに求められるクオリティ（DIN≧7）を満たしていた。現在34サンプルまで変異またはコピー数の解析を行い、変異は主にSPOP（n=7）、FOXA1（n=4）、CDK12（n=3）などに認められ、コピー数異常もNKX3-1やRB1の欠失、MYC増幅など、前立腺癌の特徴を現わしていた。MSH2のコピー数が著明に低下していたサンプルでは約1000個の変異が認められ、ミスマッチ修復遺伝子異常の特徴を示していた。RNAシーケンスは約90%のサンプル（34サンプル中31サンプル）で問題なく施行することができた。遺伝子発現のパターンが3 種類に分類され、そのうち1つのグループは他2つのグループと比べてアンドロゲン依存性が低く、生存期間が不良な傾向を示した。本研究で収集したほとんどの生検組織でゲノムおよびトランスクリプトーム解析を施行することが示された。

在这项研究中入学的203名MHSPC患者中收集的活检组织中，从57个样品中提取DNA，并从34个样品中提取RNA。平均DNA产量为2.6 ug，所有样品都符合外显子序列所需的质量（DIN≧7）。目前，已经分析了多达34个样本的突变或拷贝数，突变主要在SPOP（n = 7），FOXA1（n = 4），CDK12（n = 3）中观察到，并且拷贝数异常也表现出了前列腺癌的特征，例如NKX3-1和RB1和RB1和Myc Amplifience的缺失。在MSH2的拷贝数显着降低的样本中，观察到了大约1,000个突变，表明了不匹配修复基因异常的特征。进行RNA测序没有任何问题，大约90％的样品（34个样品中有31个）。与其他两组相比，基因表达的模式分为三种类型，其中一种显示出较低的雄激素依赖性和较差的存活率。结果表明，在本研究中收集的大多数活检组织中进行了基因组和转录组分析。

项目成果

The feasibility of molecular profiling of prostate tissue samples obtained from patients with metastatic castration-resistant prostate cancer

对从转移性去势抵抗性前列腺癌患者获得的前列腺组织样本进行分子分析的可行性

• 发表时间: 2023
• 作者: Naoki Oike;Ryota Shirai;Taylor Gillis;Deandra Walker;Avery Bodlak;Timothy Porfilio;Michael Verneris;Masanori Hayashi;住吉 崇幸
• 通讯作者: 住吉 崇幸