The determination of the hSNF5 target genes and the clarification of the transcriptional mechanism of hSNF5

hSNF5靶基因的确定及hSNF5转录机制的阐明

基本信息

批准号：
22890157
负责人：
KUWAHARA Yasumichi
金额：
$ 1.89万
依托单位：
Kyoto Prefectural University of Medicine
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
财政年份：
2010
资助国家：
日本
起止时间：
2010 至 2011
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22890157/
关键词：
ラブドイド腫瘍 hSNF5 NOXA SWI/SNF複合体 Mcl-1 p21 p53

项目摘要

Malignant rhabdoid tumor(MRT), a highly aggressive cancer of young children, displays inactivation of the hSNF5 gene in primary tumors and cell lines. We have previously reported that reexpression of hSNF5 in MRT cell lines causes a G1 arrest via p21WAF1/CIP1(p21) mRNA induction. However, the mechanisms of p21 promoter activation by hSNF5 remain unclear.Because p21 is a transcriptional target of the p53 tumor suppressor gene, we determined the role of p53 in hSNF5-induced p21 activation. We reexpressed hSNF5 in the A204 and TTC642 MRT cell lines, with or without stable knockdown of p53 expression, using adenoviral vectors expressing either hSNF5 and GFP or GFP. While loss of p53 expression significantly inhibited p21 transcriptional activity induced by hSNF5 in A204 cells at 24 hours, it did not alter its activity by hSNF5 after 24 hours in the TTC642 cells. These results suggested that the up-regulation p21 transcription by hSNF5 operated through p53-dependent and. independent mechani … More sms in the A204 and TTC642 cell lines, respectively. Next, we used chromatin immunoprecipitation(ChIP) analysis of the p21 promoter to determine where hSNF5 appeared at the p21 promoter and whether its recruitment altered binding of other transcription factors or the chromatin landscape. Our results indicated that reexpressed hSNF5 binds within 1 kb of transcript start site(TSS), with maximal enrichment at the TSS in both cell lines. Furthermore, histone acetyltransferases(HATs), RNA polymerase II(RNAPII), and BRG-1 are assembled with p53 and CDK8(co-activator of p53 transcriptional program) by reexpression of hSNF5 in A204 cells. In contrast, while p53 and CDK8 occupancy did not change after hSNF5 reexpression in the TTC642 cells, HATs, RNAPII, and BRG-1 levels increased at the p21 promoter. These findings correlated with the results of p53 knock-down experiments. Furthermore, histone H3K36 tri-methylation increased downstream of the TSS in both cell lines. These results suggested hSNF5 regulates the initiation activity of the p21 promoter by either itself or p53 recruitment, resulting in the mRNA elongation.Our findings demonstrate that while induction of p21 transcription by hSNF5 in A204 cells depends on p53, it occurs independently of p53 in TTC642 cells. The lack of dependence upon p53 appears to extend to other MRT cell lines tested in our laboratory. Furthermore, our results suggest that hSNF5 may alter p21 transcriptional initiation by itself or through the recruitment of other uncharacterized transcription factors. Less

恶性横纹肌样瘤 (MRT) 是一种高度侵袭性的幼儿癌症，在原发肿瘤和细胞系中表现出 hSNF5 基因失活。我们之前曾报道过，MRT 细胞系中 hSNF5 的重新表达通过 p21WAF1/CIP1(p21) 导致 G1 期停滞。 ) mRNA 诱导。然而，hSNF5 激活 p21 启动子的机制仍不清楚。因为 p21 是 p53 肿瘤抑制基因的转录靶标，我们确定了 p53 在 hSNF5 诱导的 p21 激活中的作用，我们使用表达 hSNF5 和 GFP 或 GFP 的腺病毒载体在 A204 和 TTC642 MRT 细胞系中重新表达 hSNF5，无论是否稳定敲低 p53 表达。 24 小时显着抑制 hSNF5 在 A204 细胞中诱导的 p21 转录活性，但不会改变其活性在 TTC642 细胞中 24 小时后，这些结果表明 hSNF5 的上调 p21 转录分别通过 p53 依赖性和独立机制在 A204 和 TTC642 细胞系中进行。 ChIP）对 p21 启动子进行分析，以确定 hSNF5 出现在 p21 启动子上的位置以及其招募是否改变了其他转录因子的结合或我们的结果表明，重新表达的 hSNF5 在转录起始位点 (TSS) 的 1 kb 范围内结合，并且在两种细胞系中的 TSS 处具有最大富集。 -1通过在A204中表达hSNF5与p53和CDK8（p53转录程序的共激活子）组装相反，虽然 TTC642 细胞中 hSNF5 重新表达后 p53 和 CDK8 占据没有变化，但 p21 启动子的 HAT、RNAPII 和 BRG-1 水平增加，这些发现与 p53 敲低实验的结果相关。两种细胞系中 TSS 下游的组蛋白 H3K36 三甲基化增加，这些结果表明 hSNF5 通过自身调节 p21 启动子的起始活性。我们的研究结果表明，虽然 A204 细胞中 hSNF5 对 p21 转录的诱导依赖于 p53，但在 TTC642 细胞中，它的发生独立于 p53。对 p53 的依赖的缺乏似乎延伸到了其他 MRT 细胞。此外，我们的结果表明 hSNF5 可能会通过自身或通过招募其他未表征的转录因子来改变 p21 转录起始。

项目成果

期刊论文数量（10）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

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专利数量（0）

Reexpression of hSNF5 regulates the transcriptional activity of the p21 promoter through p53 dependent or independent mechanisms in malignant rhabdoid tumors

在恶性横纹肌瘤中，hSNF5 的重新表达通过 p53 依赖或独立机制调节 p21 启动子的转录活性

DOI：
发表时间：
2011
期刊：
影响因子：
0
作者：
Kuwahara Y;Durand J
通讯作者：
Durand J

Reexpression of hSNF5 regulates the transcriptional activity of the NOXA promoter through p53 independent mechanisms in malignant rhabdoid tumors

在恶性横纹肌瘤中，hSNF5 的重新表达通过 p53 独立机制调节 NOXA 启动子的转录活性

DOI：
发表时间：
2011
期刊：
影响因子：
0
作者：
Kuwahara Y;Durand J;Weissman BE
通讯作者：
Weissman BE

Sensitivity of malignant rhabdoid tumor cell lines to PD0332991 is inverserly correlated with p16 expression

恶性横纹肌瘤细胞系对 PD0332991 的敏感性与 p16 表达呈负相关

DOI：
发表时间：
2011
期刊：
Biochem Biophys Res Commun
影响因子：
0
作者：
Katsumi Y;Iehara T;Miyachi M;Yagyu Y;Tsubai-Shimizu T;Kikuchi K;Tamura S;Itoh H;Kuwahara Y;Tsuchiya K;Kuroda H;Sugimoto T;Houghton PJ;Hosoi H
通讯作者：
Hosoi H

hSNF5はp53依存性機序とp53非依存性機序でp21の転写を制御する

hSNF5 通过 p53 依赖和 p53 独立机制调节 p21 转录