DNAポリメラーゼ研究におけるゲノム科学的,分子科学的アプローチの融合

DNA 聚合酶研究中基因组和分子科学方法的融合

基本信息

  • 批准号:
    15H06032
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 0.92万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
  • 财政年份:
    2015
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2015-08-28 至 2016-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

<Polζゲノム科学的解析に必要な分裂酵母株の作成>リボヌクレオチドを高頻度の取り込むPolζをコードする変異遺伝子の作成に着手した.第一に,Polε,PolδとPolζのカタリティックドメインのアライメントを作成し,Polζの変異されるべきアミノ酸を特定した.その後,Polζをコードする遺伝子(rev3)をプラスミドにクローニング後,当該アミノ酸が変異した遺伝子を作成した.その遺伝子をcre-loxシステムを用いて,分裂酵母の内在のrev3遺伝子と置換した.この酵母を使用して,細胞内での変異Polζの機能を解析した結果,多少の機能低下は観察されるものの,PolζのDNA合成能は失われていないことが判明した.現在,変異PolζのDNA合成によるリボヌクレオチドの取り込み定量を行っている.今後は,この株を利用して,ゲノムワイドにPolζ合成領域の特定(Pu-seq)を行う.変異Polζ遺伝子をコードする酵母株の作成と並行して,PolζによるDNA合成が必要となる細胞株の樹立もおこなった.Polζ欠損株とPolεの機能が低減した株をかけ合せて結果,PolεとPolζの二重変異株において顕著な増殖阻害が観察された.これは,Polε変異体でゲノム中のPolζの合成領域が拡大していることを示している.よって,Polε変異体において,Polζを対象としたPu-seq実験を行い,Polζがリーディング鎖合成を担うPolεを補助する仕組みを今後検証する.<細胞内でのPolζの1分子レベルでの観察に必要な酵母株の作成>PALM法を用いて,Polζの細胞内1分子観察を行うため,Polζのカタリティック因子のN末端にmEos蛍光体が結合した遺伝子の作成に着手した.現在までに,Polζ遺伝子とmEos遺伝子が結合した配列のプラスミド上へのクローニングが完了し,現在,酵母株への導入を行っている.
<创建对POLζ基因组的科学分析所需的裂变酵母菌菌株>我们已经开始创建一个编码POLζ的突变基因,该基因经常结合核糖核苷酸。首先,我们创建了POLε,POLδ和POLζ的催化结构域的比对,以鉴定要在Polζ中突变的氨基酸。之后,将编码POLζ的基因(Rev3)克隆到质粒中,并产生了突变氨基酸的基因。使用Cre-Lox系统,将基因用裂变酵母的内源性Rev3基因代替。使用该酵母,我们分析了突变体Polζ在细胞中的功能,发现尽管观察到了某些功能下降,但Polζ合成DNA的能力并未丢失。目前,核糖核苷酸摄取取决于突变polζ的DNA合成。将来,该菌株将用于识别范围内的Polζ合成区域(PU-SEQ)。与编码突变体Polζ基因的酵母菌菌株的产生同时,还建立了需要通过POLζ合成DNA的细胞系。通过将POLζ缺陷株与POLε功能降低的应变结合,在Polε和Polζ的双突变菌株中观察到了显着的生长抑制作用。这表明基因组中POLζ的合成区域在POLζ突变体中扩展。因此,在Polε突变体中,我们将对POLζ进行PU-SEQ实验,并研究Polε支持Polε的机制,Polε支持Polε,该机制负责领先链的合成。 <创建在细胞中观察Polζ的酵母菌菌株>在单个分子水平上观察到,以便使用棕榈法观察一个细胞内分子,我们开始创建一个基因,其中Meos磷与POLζ催化因子的N末端结合。迄今为止,将POLζ和MEOS基因结合的序列克隆到质粒上,目前正在引入酵母菌菌株。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
ゲノム複製におけるDNAポリメラーゼ間での機能分担と協調性
基因组复制中DNA聚合酶的功能分工与协作
  • DOI:
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    大学 保一;Andrea Keszthelyi;宮部 泉;Antony M. Carr
  • 通讯作者:
    Antony M. Carr
Mapping ribonucleotides in genomic DNA and exploring replication dynamics by polymerase usage sequencing (Pu-seq)
  • DOI:
    10.1038/nprot.2015.116
  • 发表时间:
    2015-11-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    14.8
  • 作者:
    Keszthelyi, Andrea;Daigaku, Yasukazu;Carr, Antony M.
  • 通讯作者:
    Carr, Antony M.
University of Sussex(英国)
萨塞克斯大学(英国)
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
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大学 保一其他文献

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