精神分裂病における新しい細胞内セカンドメッセンジャー標的遺伝子群の遺伝解析

精神分裂症细胞内第二信使新靶基因的遗传分析

基本信息

批准号：
14657233
负责人：
川嵜弘詔
金额：
$ 2.05万
依托单位：
Kyushu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2002
资助国家：
日本
起止时间：
2002 至 2004
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-14657233/
关键词：
統合失調症細胞内情報伝達システム遺伝子解析セカンドメッセンジャーシステム相関解析ハプロタイプ SNP ゲノタイピング精神分裂病セカンドメッセンジャー系細胞内情報伝達中枢神経系遺伝解析一塩基多型ハプロタイプ解析

项目摘要

平成14年度より開始した本研究について、その成果について以下に記した。1)候補遺伝子の遺伝子構造の決定:cAMP-GEFI、cAMP-GEFII、CalDAG-GEFI、CalDAG-GEFII、それぞれの遺伝子の遺伝子構造の決定に関しては終了した。手法は、データベースに登録されている、Human Genome Projectのドラフトシーケンスとそれぞれの遺伝子のmRNAの配列を比較し、エクソン領域、イントロン領域、プロモータ領域の決定を行った。2)SNPの分離:それぞれの遺伝子に関して、エクソン領域をはさむ領域及びプロモータ領域についてプライマー対の作成を行い、それぞれの領域を増幅し、塩基配列の決定を行った。約100名の配列を比較し、データベースの情報とともにSNPの同定を行った。3)統合失調症罹患群・対照群の検体収集:統合失調症の患者及び非罹患対照群のサンプル収集は、九大病院・精神科神経科及び関連病院で行い、総数約900名となった。4)多型のゲノタイピングの決定:ゲノタイピングの決定は、上記のSNPのデータをもとにそれぞれの個人の遺伝子の特定領域を直接塩基配列を決定することにより行った。統合失調症400名、非罹患健常群400名を用い、cAMP-GEFI、cAMP-GEFII、CalDAG-GEFI、CalDAG-GEFII全ての遺伝子についてタイピングを行った。5)ゲノタイプのデータの統計処理、ハプロタイプを使った相関解析:統計解析は、カイニ乗検定を用いて、それぞれの多型に関して対照群、統合失調症群でアレル頻度に有意差がないかを検討した。また、それぞれの遺伝子群における、多型同士の相関がないかの検討もロジスティック回帰分析にて行った。ゲノタイプデータをもとに、ハプロタイプを推定し、推定されたハプロタイプの頻度におけるさも検討した。

这项研究的结果始于2002年，如下所述。 1）确定候选基因的基因结构：我们已经确定了营地GEFI，Camp-Gefii，Caldag-Gefi，Caldag-Gefii和Caldag-Gefii的基因结构。该方法比较了在数据库中注册的人类基因组项目的草稿序列与每个基因的mRNA序列，并确定了外显子，内含子和启动子区域。 2）SNP分离：对于每个基因，为适合外显子区域和启动子区域的区域创建了底漆对，并将每个区域放大，并确定碱基序列。比较了大约100人的序列，并确定了SNP以及数据库中的信息。 3）精神分裂症感染和对照组的样本收集：精神分裂症患者的样本收集和非影响对照组的样本是在京都大学医院，精神神经病学和附属医院进行的，共有约900名患者。 4）测定多态性基因分型：基因分型的测定是通过基于上述SNP数据直接对每个个体基因的特定区域进行测序的确定。 Camp-Gefi，Camp-Gefii，Caldag-Gefi和Caldag-Gefii的所有基因都使用400例精神分裂症患者和400例未受影响的健康群体的患者进行了分类。 5）基因型数据的统计处理，使用单倍型的相关分析：使用Kaini的功率测试进行统计分析，以确定每个多态性的对照组和精神分裂症组的等位基因频率是否存在显着差异。此外，还进行了逻辑回归分析，以确定每组基因中多态性之间是否没有相关性。基于基因型数据估算单倍型，还检查了估计单倍型的频率。