精神分裂病における新しい細胞内セカンドメッセンジャー標的遺伝子群の遺伝解析

精神分裂症细胞内第二信使新靶基因的遗传分析

基本信息

批准号：
14657233
负责人：
川嵜弘詔
金额：
$ 2.05万
依托单位：
Kyushu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2002
资助国家：
日本
起止时间：
2002 至 2004
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-14657233/
关键词：
統合失調症細胞内情報伝達システム遺伝子解析セカンドメッセンジャーシステム相関解析ハプロタイプ SNP ゲノタイピング精神分裂病セカンドメッセンジャー系細胞内情報伝達中枢神経系遺伝解析一塩基多型ハプロタイプ解析

项目摘要

平成14年度より開始した本研究について、その成果について以下に記した。1)候補遺伝子の遺伝子構造の決定:cAMP-GEFI、cAMP-GEFII、CalDAG-GEFI、CalDAG-GEFII、それぞれの遺伝子の遺伝子構造の決定に関しては終了した。手法は、データベースに登録されている、Human Genome Projectのドラフトシーケンスとそれぞれの遺伝子のmRNAの配列を比較し、エクソン領域、イントロン領域、プロモータ領域の決定を行った。2)SNPの分離:それぞれの遺伝子に関して、エクソン領域をはさむ領域及びプロモータ領域についてプライマー対の作成を行い、それぞれの領域を増幅し、塩基配列の決定を行った。約100名の配列を比較し、データベースの情報とともにSNPの同定を行った。3)統合失調症罹患群・対照群の検体収集:統合失調症の患者及び非罹患対照群のサンプル収集は、九大病院・精神科神経科及び関連病院で行い、総数約900名となった。4)多型のゲノタイピングの決定:ゲノタイピングの決定は、上記のSNPのデータをもとにそれぞれの個人の遺伝子の特定領域を直接塩基配列を決定することにより行った。統合失調症400名、非罹患健常群400名を用い、cAMP-GEFI、cAMP-GEFII、CalDAG-GEFI、CalDAG-GEFII全ての遺伝子についてタイピングを行った。5)ゲノタイプのデータの統計処理、ハプロタイプを使った相関解析:統計解析は、カイニ乗検定を用いて、それぞれの多型に関して対照群、統合失調症群でアレル頻度に有意差がないかを検討した。また、それぞれの遺伝子群における、多型同士の相関がないかの検討もロジスティック回帰分析にて行った。ゲノタイプデータをもとに、ハプロタイプを推定し、推定されたハプロタイプの頻度におけるさも検討した。

这项研究的结果始于2002年。 1）确定候选基因的基因结构：Camp-Gefi，Camp-Gefii，Caldag-Gefi，Caldag-Gefii，每个基因的每个基因结构都已完成。该方法比较了在数据库中注册的每个基因的人类基因组项目草稿序列和mRNA序列，以确定外显子区域，内部区域和启动子区域。 2）SNP的分离：关于每个基因，为伸出exonson区域的区域和启动子区域创建了底漆对，并确定了每个区域的扩增，并确定了碱基序列。比较了大约100人的数组，并确定了SNP以及数据库信息。 3）精神分裂症组和对比组的收集者：在九州大学，精神分裂症和非影响对比组的患者的样本收集，精神病学和相关医院，总共进行了约900人。 4）多种型基因交流决策：基于上述SNP数据直接确定每个基因的基本序列做出了基因交流决策。我们打字了400个精神分裂症和400个非心态的团体，我们打字了营地，Camp-Gefi，Caldag-Gefi，Caldag-Gefii都是基因。 5）Geno类型数据的统计处理，使用单型类型的相关分析：统计分析研究了使用Cainini -riding检验的每个多态性的变化组和精神分裂症组是否没有显着差异。还检查了逻辑回归分析，以了解每个基因组之间的多方面之间存在相关性。基于基因型数据，估计了单型类型，还检查了估计的单型类型的频率。