水田土壌の鉄およびマンガン集積層の生成に関与する細菌群集の解明

阐明参与稻田铁和锰积累层形成的细菌群落

• 批准号: 19658026
• 负责人: 木村 眞人
• 金额: $ 2.18万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19658026/
• 关键词: マンガン酸化細菌; マンガン結核; 鉄集積層; 鉄還元細菌; 鉄酸化細菌; 16S rRNA; エネルギー獲得反応; DGGE; マンガン集積層; マンガン還元細菌; 16SrRNA; Proteobacteria

1)わが国の水田鋤床層に形成された斑鉄中の細菌群集を16S rDNAを対象にPCR-DGGE法を用いて解析した。DGGEバンドパターンより、斑鉄中には特有の細菌群集が生育し、多様性は低いことがDGGEバンドパターンより明らかとなった。また、塩基配列を決定した29クローン中12クローンは、鉄の酸化や還元に関係することが知られているSiderooxidans ghiorsii, Azoarcus sp., Azovibrio sp., Dechloromonas sp., Acidimicrobium ferrooxidans, Geobacter psychrophilus, Clostridium sp., Desulfovibrio sp., Desulfonatronum cooperativumに近縁であった。これらの結果より、鉄の動態に関与する特異な細菌が斑鉄中に生育していると結論した。2)我が国の水田から、2価のマンガンを酸化する39株の細菌と25株の糸状菌をマンガン結核から分離し、16SrDNA、18SrDNAの塩基配列から解析したところ、最も多くの株がそれぞれBurkholderiaとAcremoniumに属していた。2価のマンガンを含む寒天培地上で分離菌を増殖させたところ、二酸化マンガンの生成は、増殖後に進行したことから、マンガン酸化に伴うエネルギーは、これら分離菌に利用されていないと推察した。

1）使用PCR-DGGE方法分析了16S rDNA的PCR-DGGE方法，分析了日本稻田床层形成的石膏犁层中的细菌群落。 DGGE带模式表明，具有独特的细菌群落在石膏中生长，并且多样性较低。 Furthermore, 12 of the 29 clones that had their base sequences were closely related to Siderooxidans ghiorsii, Azoarcus sp., Azovibrio sp., Dechloromonas sp., Acidimicrobium ferrooxidans, Geobacter psychromphilus, Clostridium sp., Desulfovibrio sp., and Desulfonatronum cooperativum, which are known to参与铁氧化和还原。这些结果得出的结论是，黄斑中涉及铁动力学的独特细菌正在生长。 2）从日本的帕迪田中，从锰结核病中分离出39种氧化的细菌和25种丝状真菌菌株，并基于16srDNA和18SRDNA的碱基序列进行了分析，并发现最多的菌株属于Burkholderia和cearemonia and Cearemonium and Cearemonium and Cearemonium。当分离株在含有二价锰的琼脂培养基上生长时，生长后的二氧化碳的产生就会发展，并且假定这些分离物未使用与锰氧化相关的能量。

项目成果

Bacterial communities in manganese nodules in rice field subsoils: Estimation using PCR-DGGE and sequencing analyses

• DOI: 10.1111/j.1747-0765.2007.00176.x
• 发表时间: 2007-10
• 期刊: Soil Science and Plant Nutrition
• 影响因子: 2
• 作者: V. Cahyani;J. Murase;E. Ishibashi;S. Asakawa;M. Kimura

Phyologenetic positions of Mn-oxidizing bacteria and fungi inhabiting Mn nodules in rice field subsoils.

稻田底土锰结核中锰氧化细菌和真菌的系统发育位置。

• 发表时间: 2009
• 期刊: Biology and Fertility of soils 45
• 作者: 田中 重光;人村 敏志;中山 二郎;Vita Ratri Cahyani
• 通讯作者: Vita Ratri Cahyani