肺MAC症の病態進行に関わる病原性因子の解明

阐明肺部 MAC 疾病进展的致病因素

• 批准号: 22K16382
• 负责人: 深野 華子
• 金额: $ 1.83万
• 依托单位: National Institute of Infectious Diseases
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2026-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K16382/
• 关键词: 非結核性抗酸菌症; 肺MAC症; 病原性; 病原性因子

本研究においては、国内において患者数が著しい増加傾向にある肺MAC症について、菌側因子に焦点を当て、病態の進行に関わる病原性因子の探索を目的としている。今年度においては、肺MAC症発症患者および症状のない患者から分離された臨床分離株約200 株についてのショートリードシーケンスデータの取得を終了している。更にそれらを使用した予備的なゲノム解析の結果、肺MAC症原因菌として分類される菌種の中でも希少な菌種また亜種が分離されていることを見出している。また、それらの菌株の病原性評価の表現型解析試験としてマクロファージ内への侵入効率・細胞内での増殖能を定量的に解析するため、プラスミド上に蛍光タンパク質(YFP)を発現させた標準株を使って、ハイコンテントイメージングシステムとマシンラーニングを使用した細胞内菌量の定量評価システムの構築に成功した。また同様の手法を使いながら、菌体特異的脂質成分に対する抗体染色により、蛍光タンパクを発現しない臨床分離株を使用した定量解析にも成功している。この手法の確立により、臨床分離株を使ったハイスループットな解析が可能となった。更には、細胞内菌数の変化だけでなく細胞数の現象をイメージングシステムにより定量評価できる評価系を構築中である。これにより、株間による細胞障害性の違いを見出すことが可能となる。また、標準株を使用した抗菌薬スクリーニングの評価系を確立中である。

在本研究中，我们旨在寻找与疾病进展相关的致病因素，重点关注肺 MAC 疾病的细菌因素，该疾病在日本的患者数量正在迅速增加。本财年，我们完成了约 200 个来自肺 MAC 疾病患者和无症状患者的临床分离株的短读序列数据的获取。此外，使用这些进行初步基因组分析的结果是，在被归类为肺部MAC致病菌的细菌种类中分离出了稀有细菌种类和亚种。此外，为了定量分析巨噬细胞的侵袭效率和细胞内增殖能力，作为评估这些菌株致病性的表型分析测试，我们开发了一种标准菌株，其中荧光蛋白（YFP）表达于我们利用高内涵成像系统和机器学习成功构建了细胞内细菌数量的定量评估系统。使用类似的方法，我们还成功地使用不表达荧光蛋白的临床分离株，使用抗体染色对细菌细胞特异性脂质成分进行定量分析。该方法的建立使得能够使用临床分离株进行高通量分析。此外，我们正在构建一个评估系统，该系统不仅可以使用成像系统定量评估细胞内细菌数量的变化，还可以定量评估细胞数量的现象。这使得发现菌株之间细胞毒性的差异成为可能。我们还在建立标准菌株抗菌药物筛选评价体系。

项目成果

evelopment of a new screening method attacks intracellular NTM

开发一种攻击细胞内 NTM 的新筛选方法

• 发表时间: 2022
• 作者: 深野華子;山本健太郎;松本靖彦;星野仁彦;深野華子;深野華子
• 通讯作者: 深野華子

Complete Chromosomal Genome Sequence of Mycobacterium sp. Strain IWGMT90018-18076.

• DOI: 10.1128/mra.00078-22
• 发表时间: 2022-06-16
• 期刊: MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS
• 影响因子: 0.8
• 作者: Fukano, Hanako;Yoshida, Mitsunori;Kazumi, Yuko;Sakagami, Nobuya;Ato, Manabu;Mitarai, Satoshi;Hoshino, Yoshihiko
• 通讯作者: Hoshino, Yoshihiko

Mycobacterial mycolic acids trigger inhibitory receptor Clec12A to suppress host immune responses.

分枝杆菌分枝酸触发抑制性受体 Clec12A 来抑制宿主免疫反应。

• DOI: 10.1016/j.tube.2022.102294
• 发表时间: 2023
• 期刊: Tuberculosis
• 影响因子: 3.2
• 作者: Nishimura N#;Tomiyasu N#;Torigoe S;Mizuno S;Fukano H;Ishikawa E;Katano H;Hoshino Y;Matsuo K;Takahashi M;Izumi Y*;Bamba T;Akashi K;Yamasaki S*.
• 通讯作者: Yamasaki S*.

Genomic Epidemiological Analysis of Antimicrobial-Resistant Bacteria with Nanopore Sequencing

利用纳米孔测序对耐药细菌进行基因组流行病学分析

• DOI: 10.1007/978-1-0716-2996-3_16
• 发表时间: 2023
• 期刊: Methods in molecular biology
• 作者: Suzuki Masato;Hashimoto Yusuke;Hirabayashi Aki;Yahara Koji;Yoshida Mitsunori;Fukano Hanako;Hoshino Yoshihiko;Shibayama Keigo;Tomita Haruyoshi
• 通讯作者: Tomita Haruyoshi

細胞内寄生抗酸菌を標的とする新たな抗菌薬スクリーニング手法開発研究

针对细胞内寄生分枝杆菌的抗菌新药筛选方法开发研究

• 发表时间: 2023
• 作者: 深野華子;山本健太郎;松本靖彦;星野仁彦
• 通讯作者: 星野仁彦