耐性遺伝子を指標とした微生物資源からの新規薬剤シーズの探索

以抗性基因为指标从微生物资源中寻找新药种子

基本信息

批准号：
22K15305
负责人：
堤隼馬
金额：
$ 2.91万
依托单位：
Kitasato University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K15305/
关键词：
天然物耐性遺伝子ゲノムマイニング

项目摘要

近年の微生物ゲノム配列解読により、微生物は実際に取得されている数以上の天然物の生産能力を有していることが明らかになってきた。そのため、ゲノムデータを利用した天然物探索も盛んに行われるようになった。しかし、ゲノムベースが膨大であることもあり、探索標的の選定に工夫が必要で、労力もかかるため、効率的かつ有効にデータを利用した天然物探索は行うことができていない。本研究ではゲノムデータベースに登録されているゲノムデータの中から、耐性遺伝子を指標に天然物の生合成遺伝子クラスター (BGC) を探索することを目的とした。探索には網羅的に様々な標的BGCを探索するため、目的の耐性遺伝子を含むBGCを自動で探索プログラミングを構築し、効率的かつ網羅的にゲノムベース探索を行う。

最近的微生物基因组序列表明，微生物具有比实际获取的数量更多的天然产物的能力。结果，使用基因组数据的天然产品搜索也变得流行。但是，由于基因组基础的巨大基础，有必要在选择搜索目标时开发和劳动密集型，因此不可能使用数据有效，有效地搜索天然产品。这项研究旨在使用抗性基因作为基因组数据库注册的基因组数据中的指标探索天然产物的生物合成基因簇（BGC）。为了全面搜索各种目标BGC，我们会自动为包含所需电阻基因的BGC构建搜索编程，并有效，全面地执行基于基因组的搜索。

项目成果

期刊论文数量（10）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

SELECTIVE ISOLATION OF RARE ACTINOMYCETES USING AGAR MEDIUM CONTAINING LYSOZYME AND SEARCH FOR NOVEL BIOACTIVE COMPOUNDS

利用含溶菌酶的琼脂培养基选择性分离稀有放线菌并寻找新型生物活性化合物

DOI：
发表时间：
2023
期刊：
影响因子：
0
作者：
Yuta Awano;Hiroki Kanto;Akira Take;Yuta Kikuchi;Aoi Kimishima;Hayama Tsutsumi;Masato Iwatsuki;Yukihiro Asami;Yuki Inahashi
通讯作者：
Yuki Inahashi

Insights into the structure?activity relationship of a type III secretion system inhibitor, aurodox

深入了解 III 型分泌系统抑制剂 aurodox 的构效关系

DOI：
10.1016/j.bmcl.2022.128779
发表时间：
2022
期刊：
Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters
影响因子：
0
作者：
Kimishima Aoi;Hagimoto Daichi;Honsho Masako;Watanabe Yoshihiro;Iwatsuki Masato;Tsutsumi Hayama;Inahashi Yuki;Naher Kamrun;Sakai Kazunari;Kuwae Asaomi;Abe Akio;Asami Yukihiro
通讯作者：
Asami Yukihiro

Lysozyme添加寒天培地により分離される放線菌の網羅的解析

添加溶菌酶的琼脂培养基上分离的放线菌的综合分析