プラナリア成体多能性幹細胞の維持を可能とする分子の探索

寻找能够维持涡虫成体多能干细胞的分子

• 批准号: 22K15127
• 负责人: 鹿島 誠
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Aoyama Gakuin University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K15127/
• 关键词: 幹細胞; プラナリア; 全能性; 化合物; スクリーニング; RNA-Seq; ケミカルスクリーニング

プラナリアを含む一部の無脊椎動物では成体多能性幹細胞(aPSC)が維持され、組織恒常性の維持や再生に利用されているが、「aPSCの分子実体」や「成体内でなぜaPSC維持できるのか？」という問いには答えが出ていない。本研究計画では、独自のオミクス解析技術とプラナリアの再生個体用いた大規模なin vivo化合物スクリーニングを行い、aPSCの維持に寄与する化合物の同定を目指す。さらに、同定した化合物の機序を経時一個体RNA-Seqによって解明していく。最終的には、同定した化合物を利用したaPSC培養系の開発を行い、プラナリアaPSCの同定とその維持に重要な分子基盤の解明を目指す。プラナリア個体を対象とした化合物スクリーニングを開始し、2940化合物の再生個体に対するスクリーニングの結果、再生不全89種、死亡745種のヒット化合物候補を得ている。RNA-Seqによる薬効評価を開始し、幹細胞の維持促進や分化抑制を行っている可能性がある化合物候補を得ることに成功している。また、プラナリアDugesia japonicaゲノム解読を行い、従来のゲノムアセンブリーの2.5倍以上長い結果を取得し、遺伝子カタログの完成に大きく近づいた。

一些无脊椎动物，包括平面物，在成人多能干细胞（APSC）中保持，并用于维持和再生组织常数，但是为什么要在“ APSC分子物质”中维持APSC以及“为什么在成年人中保持APSC”。问问题？在本研究计划中，我们旨在确定一种有助于维持APSC的化合物，该化合物使用其自己的OMICS分析技术以及使用其自身的OMICS分析技术和Planaria的体内化合物筛选大型体内化合物。此外，随着时间的推移，一个单独的RNA-Seq阐明了所鉴定化合物的机制。最终，我们将使用已鉴定的化合物开发APSC培养系统，旨在阐明对于识别和维持Pranaria APSC很重要的分子基础设施。 Planaria个体的化合物筛查已经开始，并且由于对2940个复合播放个体的筛查，89种播放失败和745例死亡。它已通过RNA-Seq成功评估，并成功地获得了可能促进干细胞并抑制分化的复合候选者。此外，Dugesia japonica基因组进行了解码，获得的比常规基因组组装长2.5倍以上，并且更接近遗传目录的完成。

项目成果

成体多能性幹細胞の制御メカニズム解明に向けたケミカルスクリーニング

化学筛选阐明成体多能干细胞的调节机制

• 发表时间: 2022
• 作者: 河村 嶺;鹿島 誠;平田 普三
• 通讯作者: 平田 普三

WET と DRYハイブリッド研究者になるまで

如何成为干湿混合研究员

• 发表时间: 2022
• 作者: Si Jing Chen;Naoshi Sugimoto;Koji Eto;Si Jing Chen;鹿島 誠
• 通讯作者: 鹿島 誠

Intercellular and intracellular gene regulatory networks inference with individual-difference correction from time-course bulk RNA-Seq of whole embryo

通过整个胚胎的时间过程批量 RNA 测序进行个体差异校正的细胞间和细胞内基因调控网络推断

• 发表时间: 2022
• 作者: Makoto Kashima;Yuki Shida;Takashi Yamashiro;Hiromi Hirata;Hiroshi Kurosaka
• 通讯作者: Hiroshi Kurosaka

Transcriptomic landscape during regeneration revealed turning point of anterior-posterior information in a planarian, Dugesia japonica.

再生过程中的转录组景观揭示了真涡虫 Dugesia japonica 前后信息的转折点。

• 发表时间: 2022
• 作者: Miho Hosaka;Makoto Kashima;Hiromi Hirata
• 通讯作者: Hiromi Hirata

時系列一個体RNA-Seqによるプラナリアの再生プロセスの観察

使用时间序列单个体 RNA-Seq 观察涡虫再生过程

• 发表时间: 2022
• 作者: 保坂 美朋;鹿島 誠;平田 普三
• 通讯作者: 平田 普三