次世代シーケンサーを用いた歯周炎の治療反応性を予知するGCF中miRNAの探索

使用下一代测序仪在 GCF 中搜索可预测牙周炎治疗反应的 miRNA

基本信息

批准号：
21K16997
负责人：
笠井信吾
金额：
$ 3万
依托单位：
Kyushu Dental College
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K16997/
关键词：
GCF miRNA Seq解析歯周炎 NGS解析

项目摘要

慢性歯周炎に対して、炎症の除去を目的としてSRPを主体とした歯周基本治療が行われるが、同じ術者が歯周基本治療を行っても歯周ポケット深さが減少するケースと反応性が悪いケースが存在する。この反応性の違いについては、不明な点が多い。歯肉溝滲出液（GCF）は歯周ポケットに存在する組織液である。歯周炎患者から採取したGCFには炎症性サイトカインが含まれ、歯周組織局所の炎症状態を反映することが知られている。miRNAは小分子RNAであり、癌をはじめとした疾患のマーカーとなることが示されている。GCF中にも様々なmiRNAが含まれていることが明らかとなったが、歯周炎の病態、並びに歯周炎の治療反応性との関連は不明である。本研究では、歯周炎患者のGCFに対して、NGS（次世代シーケンサー）を用いて、miRNA発現プロファイリングを網羅的に解析し、歯周炎病態や歯周基本治療に対する反応性に関わるmiRNA発現を明らかにし、さらに、炎症性サイトカイン発現に対する制御機構を検証することである。令和4年度は、研究計画の見直しおよび修正を行った。九州歯科大学附属病院歯周病科に初診で来院した患者より、miRNA解析のためのGCFと炎症性サイトカイン解析のためのGCFを採取した。miRNA解析のためのGCFからは、随時、RNA抽出を行った。患者のクリニカルパラメータとして、PPD（歯周ポケット深さ）、CAL（クリニカルアタッチメントレベル）、プロービング時出血（BOP）の有無、その他歯肉溝内縁上皮面積（PESA）・炎症歯肉内縁上皮面積（PISA）を計測した。

针对慢性牙周炎，进行基于SRP的基础牙周治疗，其目的是消除炎症，但即使是同一位医生进行基础牙周治疗，也存在牙周袋深度降低的情况。关于反应性的这种差异存在许多未知点。龈沟液（GCF）是存在于牙周袋中的组织液。从牙周炎患者采集的 GCF 含有炎症细胞因子，已知可以反映牙周组织的局部炎症状态。 miRNA 是一种小 RNA 分子，已被证明是包括癌症在内的疾病的标志物。尽管已经清楚GCF含有多种miRNA，但它们与牙周炎病理学和牙周炎治疗反应的关系尚不清楚。在本研究中，我们利用NGS（下一代测序）全面分析了牙周炎患者GCF中的miRNA表达谱，确定了与牙周炎病理和对基础牙周治疗的反应相关的miRNA的表达，本研究的目的是阐明其机制。炎症细胞因子的表达并检查炎症细胞因子表达的调节机制。 2020财年，我们重新审视并修订了研究计划。用于miRNA分析的GCF和用于炎症细胞因子分析的GCF是从首次到九州齿科大学医院牙周科就诊的患者收集的。随时从GCF中提取RNA用于miRNA分析。患者的临床参数包括PPD（牙周袋深度）、CAL（临床附着水平）、探诊是否出血（BOP）以及其他龈沟内上皮面积（PESA）和发炎的牙龈内上皮面积（PISA）。我测量了。