分散が駆動する海産巻貝の放散：貝殻遺骸・集団ゲノミクスを用いた検証

海洋蜗牛的扩散驱动扩散：使用贝壳遗骸和种群基因组学进行验证

基本信息

批准号：
21K15161
负责人：
山崎大志
金额：
$ 2.5万
依托单位：
Kochi University (2022)Tohoku University (2021)
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

2022年度は、昨年度に新型コロナウイルス感染症による社会情勢の変化のため大きく制約されていた野外におけるフィールド調査が実施でき、生態データの取得および新規のサンプルを入手した。本年度得られたサンプルに加え、これまでに取得済みのサンプルを用いて、浅海域の海産巻貝を対象とした形態解析および遺伝的解析を実施している。次世代シークエンサーを用いた集団ゲノミクス解析を進めた結果、潮間帯性の巻貝であるイシダタミ属において島嶼部（トカラ列島および琉球列島・伊豆諸島・小笠原諸島）を中心に独自の遺伝的系統が出現することが明らかとなった。このうち一部は筆者による先行研究（Yamazaki et al., 2017. Mar Biol）においても示唆されていたものの、本研究のように核遺伝子をゲノムワイドに検討することで、より詳細な遺伝的構造のパターンが得られた。現在これらの系統群を対象とした集団動態推定の解析から集団拡大および縮小と分岐の時系列解明を進めている。同様に、東北太平洋沿岸域において複数の巻貝種群を用いた集団構造の比較を進め、共通の遺伝的境界を検出した。加えて本年度は博物館等の機関に収蔵されている貝塚遺骸標本が実見できた。これも野外調査と同様、昨年度は十分に実施できなかった研究活動である。特にバテイラ属を中心とした浅海性巻貝や、二枚貝類の実見および撮影を行い、形態解析に供した。バテイラ属を中心とした巻貝類を対象として、過去および現生サンプルの形態解析との結果と比較するため、集団ゲノミクス解析を実施するための次世代シークエンサー用のライブラリー作成を進めている。これらについて概ね現生種のサンプルは揃い、殻形態の定量化ができている。

在2022财年，在现场进行了现场调查，该现场受到了去年Covid-19引起的社交情况的变化的显着限制，并获得了生态数据并获得了新样本。除了今年获得的样品外，还使用到目前为止获得的样品在浅水中的海洋蜗牛上进行了形态和遗传分析。在使用下一代测序仪分析了种群基因组学之后，据揭示了独特的遗传线出现在Ishidatami属（主要是在岛屿（Tokara群岛和Ryukyu群岛，Izu群岛，Izu群岛）和Ogasawara Islands）中的Ishidatami属中。尽管作者在先前的研究中提出了其中的一些（Yamazaki等人，2017年。Mar Biol），但对核基因的全基因研究如本研究中允许更详细的遗传结构模式。目前，我们正在努力通过分析针对这些系统发育群体的人口动态估计，阐明人口扩展，减少和分支的时间序列。同样，对Tooku Pacific沿海地区使用多个蜗牛物种的种群结构进行了比较，以检测常见的遗传边界。此外，今年我们还可以看到存储在博物馆和其他机构中的壳丘的标本。像现场研究一样，这是一项去年没有完全进行的研究活动。特别是，进行了浅海蜗牛，主要是bateira属和双壳类的实际观看和照片进行形态学分析。为了将结果与过去和当前样品的形态分析进行比较，我们目前正在为下一代序列仪开发一个库，以进行人群基因组分析，主要针对蜗牛，主要是bateira属。通常，现代物种的样品是对齐的，可以量化壳形态。