Climb and then spread later or spread and then climb? Life history strategies of clonal growth in lianas.

先爬升再扩散，还是先扩散再爬升？

基本信息

批准号：
21K14882
负责人：
森英樹
金额：
$ 2.16万
依托单位：
Forest Research and Management Organization
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

クローン成長の生活史戦略を明らかにする対象種の選定を行い、新たに５種のサンプリングを行った。その結果、種によっては林床で全く出現しない種も存在することが明らかになった。新たにサンプリングした種は、ミツバアケビ（N=38）、サルナシ（N=31）、ヤマブドウ（N=16）、ツルウメモドキ（N=41）、テイカカズラ（N=613）ある。テイカカズラは三宅島、それ以外の種は小川試験地にてサンプリングを行った。サンプリングはこれまでと同様10メートル四方のコドラートを設置して林床の小型個体を採取し、それを中心とする30メートル四方のコドラートに分布する樹木に登攀する個体を採取した。サンプル採取は各種３反復した。ヤマブドウは老齢林内で個体群が少なく２反復となった。新たにサンプリングした個体はすべてDNAを抽出し、一定の収量を得ることができた。テイカカズラはサンプル数が多いためDNAマーカー（SSR）を用いて遺伝子型を決定する方法を採用し、SSRの設計・開発を行った。その結果合計１１座の多型のあるSSRマーカーを開発した。今後は開発したSSRマーカーを用いて遺伝子型の決定を進める予定である。その他の４種およびマツブサはサンプル数が比較的少ないため、次世代シーケンサーにより得られるゲノムワイドSNPを使って遺伝子型を決定する。そのライブラリー調整は今年度内に完了する予定である。昨年度サンプリングしDNAを抽出したツルアジサイについては、次世代シーケンサーにより得られたmRNAの配列からEST-SSRマーカーを設計し、開発中である。

选择目标物种以阐明克隆生长的生活史策略，并采样了5个新物种。结果显示，有些物种从未出现在森林地面上。新采样的物种是木通（N=38）、梨槭（N=31）、山藤（N=16）、刺棘（N=41）和Teikasuzuru（N=613）。在三宅岛进行了 Teikazura 的采样，并在小川试验场进行了其他物种的采样。和之前一样，我们设置了一个10平方米的样方来收集森林地面上的小个体，然后收集分布在该样方周围30平方米的样方中的爬树个体。每个物种的样品采集重复三次。原始森林中野生葡萄的数量很少，因此只有两次重复。我们能够从所有新采样的个体中提取 DNA 并获得一定的产量。由于Teika Kazura拥有大量样本，我们采用了利用DNA标记（SSR）来确定基因型的方法，并设计和开发了SSR。结果，我们开发了总共 11 个位点具有多态性的 SSR 标记。未来，我们计划继续使用开发的 SSR 标记来确定基因型。由于其他四个物种和线虫的样本数量相对较少，因此将使用新一代测序获得的全基因组 SNP 来确定基因型。图书馆调整计划于本财年完成。对于我们去年取样并提取 DNA 的攀缘绣球花，我们根据使用下一代测序仪获得的 mRNA 序列设计并目前正在开发 EST-SSR 标记。